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El epitopo “megapools” podía ayudar a determinar juegos de la inmunidad del linfocito T del papel en COVID-19

Los investigadores en los Estados Unidos y la Australia han conducto un análisis completo de las configuraciones del reconocimiento del epitopo asociadas a la infección del coronavirus 2 de la neumonía asiática (SARS-CoV-2) en seres humanos.

El virus SARS-CoV-2 es responsable del pandémico de la enfermedad 2019 del coronavirus (COVID-19) que tiene actualmente científicos el embalarse para desarrollar vacunas efectivas y terapias antivirus.

Las personas - del instituto de La Jolla para la inmunología (LJI) en California, la Universidad de California San Diego (UCSD), y la universidad de Murdoch, Perth - los centenares determinados de antígeno humano del leucocito (HLA) clasifican I y epitopos Ii-reservados de la clase SARS-CoV-2-derived de HLA. El estudio reveló las configuraciones distintas del immunodominance SARS-CoV-2 que difirieron entre las células de T de CD4+, las células de T de CD8+, y los anticuerpos.

Alessandro Sette y colegas dice que a su conocimiento, ningún estudio hasta la fecha ha descrito el repertorio los epitopos del linfocito T SARS-CoV-2 de CD4+ y de CD8+ con un nivel comparable de granulosidad o de anchura.

Las personas combinaron estos epitopos para crear el nuevo epitopo “megapools” que se puede utilizar para medir las reacciones del linfocito T de CD4+ virus-específico y de CD8+ y podrían facilitar la investigación en el papel que la inmunidad del linfocito T desempeña en la infección SARS-CoV-2 y COVID-19.

Una versión de la prueba preliminar del papel está disponible en el servidor del bioRxiv*, mientras que el artículo experimenta la revisión paritaria.

Las reacciones del linfocito T aparecen modular la severidad COVID-19

El curso de la enfermedad que sigue la infección SARS-CoV-2 es altamente variable, colocando de suave o aún asintomático, a la pulmonía viral severa, la señal de socorro y el multi-órgano respiratorios dañan.

Una carrocería cada vez mayor de las pruebas apunta a las reacciones del linfocito T de SARS-CoV-2-specific como moduladores dominantes de esta severidad de la enfermedad. COVID-19 suave se ha asociado el anticuerpo coordinado, el linfocito T de CD4+ y a las reacciones del linfocito T de CD8+, mientras que los casos severos se han asociado a una falta de coordinación en reacciones celulares y del anticuerpo.

Hasta la fecha, la mayoría de los estudios que apuntan delinear el papel que el juego de las reacciones del linfocito T ha utilizado reúnen de los péptidos previstos o que recubren que atraviesan la serie de diversos antígenos SARS-CoV-2. Sin embargo, los epitopos exactos del linfocito T y las regiones immunodominant del antígeno implicados no se han determinado completo.

La “definición de un equipo completo de especificidades del epitopo es importante por varias razones,” escribe a los investigadores.

Por ejemplo, la capacidad de determinar si ciertas regiones dentro de diversos antígenos SARS-CoV-2 son immunodominant serían dominantes a asegurar construcciones vaccíneas no sólo incluyen las regiones apuntadas neutralizando los anticuerpos, pero también ésas capaces de entregar suficientes reacciones del linfocito T.

Además, un levantamiento topográfico completo de los epitopos de SARS-CoV-2-derived restringidos por un equipo de diverso HLAs que son diversos a través de la población en general ayudaría a asegurarse que las conclusión del estudio es generalizable a diversas pertenencias étnicas.

¿Qué los investigadores hicieron?

Para determinar la configuración del immunodominance a través de los diversos antígenos SARS-CoV-2 y cuantificar las reacciones del linfocito T de CD4+ y de CD8+ al virus, las personas estudiaron reacciones epitopo-específicas del linfocito T usando las muestras mononucleares de la célula de la sangre (PBMC) periférica recogidas a partir de 99 donantes convalecientes adultos COVID-19.

El proteome SARS-CoV-2 fue sondado usando 1.925 diversos péptidos que recubrían que atravesaron el genoma viral entero, para asegurar el abrigo imparcial de los diversos alelos de la clase II de HLA expresados a través de la cohorte del estudio.

Para la clase de HLA I, las personas seleccionó los 5.600 aglutinantes previstos adicionales para 28 alelos prominentes de la clase I de HLA, representando 98,8% de abrigo de la clase I de HLA por todo el mundo.

“No somos conscientes de ningún estudio que describa el repertorio los epitopos del linfocito T de CD4+ y de CD8+ reconocidos en la infección SARS-CoV-2 con un nivel comparable de granulosidad o de anchura,” escribimos a las personas.

¿Qué encontraron?

Los investigadores determinaron varios cientos de epitopos HLA-reservados de SARS-CoV-2-derived. Observaron las configuraciones sin obstrucción del immunodominance que difirieron entre las células de T de CD4+, las células de T de CD8+, y los anticuerpos.

Un número limitado de antígenos explicado alrededor del 80% de la reacción y del guardapolvo totales, los mismos antígenos era dominante para las reacciones de CD4+ y de CD8+.

Sin embargo, la capacidad de enlace de HLA era un determinante importante de la inmunogeneticidad para las células de T de CD4+.

El “atar a las variantes alélicas múltiples de HLA es un mecanismo importante para amplificar la inmunogeneticidad potencial de los epitopos del péptido y las regiones específicas dentro de un antígeno,” dice Sette y a colegas.

Después, las personas proyectaron las regiones dominantes del linfocito T de CD4+ sobre las estructuras sabidas o previstas de la proteína SARS-CoV-2. Esto reveló que las regiones dominantes del epitopo son diferentes para las células de B y de T.

“Esto es de importancia para el revelado vaccíneo, como la partícula extraña de las subregiones del antígeno seleccionadas en base de la dominación para la reactividad del anticuerpo pudo dar lugar a un inmunógeno falto de suficiente actividad del linfocito T de CD4+,” escribe a las personas.

A diferencia de las regiones dominantes sin obstrucción distintas observadas para el linfocito T de CD4+ y de las reacciones del anticuerpo, los epitopos del linfocito T de CD8+ fueron distribuidos uniformemente en los diversos antígenos, sugiriendo poco efecto posicional en la distribución del epitopo del linfocito T de CD8+.

“En el caso de reacciones del linfocito T de CD8+, nuestros datos destacan diferencias específicas del HLA-alelo en la frecuencia y la magnitud de reacciones,” escribe a las personas. “Nuestro estudio ofrece un mapa itinerario para la partícula extraña de regiones específicas o de epitopos discretos, para permitir la representación del epitopo del linfocito T de CD8+ a través de una variedad de diverso HLAs.”

Combinar los epitopos en megapools

Totales, estos experimentos determinaron un total de 280 CD4+ y 454 epitopos del linfocito T de CD8+, que los investigadores combinaron en nuevos megapools del epitopo para facilitar la identificación y la cuantificación de las células de SARS-CoV-2-specific CD4+ y de T de CD8+.

Proyectamos poner estos centros comunes del epitopo a disposición la comunidad científica at large, y contamos con que faciliten la posterior investigación del papel de la inmunidad del linfocito T en la infección SARS-CoV-2 y COVID-19,” decimos Sette y a colegas.

Los investigadores anticipan que las conclusión del estudio estarán de valor importante para que la ayuda entienda inmunorespuestas a la infección SARS-CoV-2 y para desarrollar diagnósticos T-célula-basados.

“Además, los resultados vierten la luz en los mecanismos del immunodominance de SARS-CoV-2, que tienen implicaciones para las acciones recíprocas de comprensión del ordenador principal-virus, así como para el diseño vaccíneo,” concluyen.

Advertencia *Important

el bioRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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