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La protéine de la pointe SARS-CoV-2 reste remarquablement économisée parmi 37 variantes de Hong Kong

Pendant que la pandémie de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19) continue à intensifier à beaucoup de parties du monde, la mise au point de vaccin se poursuit rapidement. En effet, les vaccins approuvés les plus tôt sont maintenant administrés aux centaines de milliers de gens le monde plus de.

Cependant, le cas des mutations menant à l'émergence des variantes multiples a mené à une incertitude au sujet de la possibilité de mutations d'évasion, qui rendraient ces vaccins inutiles.

Un prétirage neuf sur le serveur de bioRxiv*, étant évident en décembre 2020, indique que ces craintes peuvent être inutiles, vu l'état actuel des connaissances au sujet du virus.

Analyse de mésappariement : l

Analyse de mésappariement : l'extension démographique et spatiale calibre pour les 37 haplotypes de la protéine de la POINTE SARS-CoV-2. Crédit d'image : https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.16.423166v1.full.pdf

La protéine de pointe

Le virus derrière COVID-19 est le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère, qui est connu pour négocier son entrée dans la cellule hôte par l'intermédiaire de sa protéine de pointe. Ceci se compose d'une protéine de fusion de la classe I, avec une extrémité incluse dans l'enveloppe virale et l'autre qui dépasse de la surface. Cette protéine les deux identifie des attaches à, et protège par fusible avec la membrane de cellule hôte pour réaliser l'intériorisation dans la cellule hôte.

Le virus dans la cellule effectue maintenant pour reproduire son génome et pour traduire ses composantes structurelles et non-structurelles, pour assembler les virions adultes neufs. La protéine exposée de pointe est un objectif disponible pour les cellules de T, qui sont de ce fait activées pour produire les anticorps polyclonaux aux multiples épitopes et domaines de détail de la protéine de pointe. Ces anticorps neutralisent souvent en nature, bloquant la pièce d'assemblage de virus au récepteur de cellule hôte, l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2).

La protéine de pointe est métastable sous sa forme de prefusion, qui se compose de deux sous-unités, S1 et S2. Le premier négocie le grippement au récepteur par l'intermédiaire de son domaine récepteur-grippant (RBD) et le deuxième est responsable de la fusion de membrane de virus-cellule. Ceci permet au virus de présenter la cellule, mais ce procédé dépend des protéases de cellule hôte, qui doivent fendre les sous-unités.

Objectif de pointe pour des antivirals et des immunothérapies

La fonction clé de la protéine de S lui a effectué un premier objectif pour des immunothérapies et des antivirals, ainsi que pour des vaccins en cours de développement.

Plus tôt, la découverte de la nature antigénique efficace de la protéine de pointe dans Radars à ouverture synthétique-CoV et MERS-CoV ont déclenché l'utilisation de cette protéine comme antigène vaccinique. Dans des études de souris, les antisérums se sont rassemblés des souris immunisées avec la protéine de S des Radars à ouverture synthétique-CoV plus tôt nettement réduits l'entrée de virus dans les cellules cibles.

Ceci propose l'admission de l'immunité croix-réactive contre les épitopes de protéine de pointe, qui sont hautement économisés dans les coronaviruses. Dans les 15 jours la goujon-immunisation, les anticorps de neutralisation et les cellules de T visant la protéine de pointe sont détectable. Ces animaux se sont avérés pour avoir les charges virales inférieures dans les voies respiratoires suivant l'exposition suivante au virus.

Tandis que d'autres traitements sont explorés, y compris des extraits des plantes médicinales et les petites molécules ou les peptides qui visent cette protéine, il y a de beaucoup de chemin à faire, parlant technique, avant que ceux-ci deviennent procurables en tant que médicaments commercialement viables entièrement vérifiés et reconnus.

Découvertes d'étude

L'étude actuelle a visé à explorer la diversité moléculaire de la protéine de pointe dans différentes populations virales, qui ont pu avoir changé la conformation génétique et avoir activé l'évasion immunisée. L'équipe de recherche, du laboratoire de la génétique de population et de la biologie évolutionnaire de calcul (LaBECom-UNIVISA), a effectué une analyse du degré de liberté moléculaire (AMOVA) sur 37 variantes différentes de la protéine de la pointe SARS-CoV-2.

Ces haplotypes se rapportent aux ensembles joints de variations du génome. Tous ont été recherchés publiquement - de la plate-forme nationale procurable du centre de documentation de biotechnologie (NCBI).

Les chercheurs ont trouvé très un à basse altitude de la diversité entre les haplotypes. Le nombre de mises en place, les omissions, les passages, et les transversions étaient très inférieurs. Ils ont observé seulement 17 sites polymorphes dans la protéine de pointe. Les index moléculaires de diversité ont montré une absence des mutations significatives pour ces haplotypes, et aucune extension significative de population n'a été observée l'un ou l'autre.

Quelles sont les implications ?

Les chercheurs, pour cette raison, constatés que les haplotypes de la pointe SARS-CoV-2 sont hautement assimilées. « Nous assumons cette diversité moléculaire pour cette protéine, si trouvé dans de futures études, peut être associé aux composantes de la variation autre que des remplacements couramment trouvés dans le génome SARS-CoV-2. »

Ces découvertes sont conformes à la conservation connue de la séquence de pointe. Ainsi, ils disent, la variabilité génétique rapportée du virus stocke quelques gènes viraux, laissant quelques protéines héréditaires intactes. Les méthodes employées dans cette étude ont tenu compte de la façon discontinue de laquelle les haplotypes ont développé des variations génétiques, par l'intermédiaire de plusieurs étapes intermédiaires mutationnelles. Les estimateurs utilisés étaient conformes à l'uniformité des résultats, en dépit de leur sensibilité élevée pour n'importe quelle variation moléculaire.

Ces considérations s'assurent que l'utilisation de neutraliser des anticorps peut pouvoir supprimer la prolifération du virus, autre justifiant le développement des vaccins basés sur la protéine S. »

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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