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La proteina della punta SARS-CoV-2 rimane conservata notevolmente fra 37 varianti da Hong Kong

Mentre la pandemia di malattia 2019 di coronavirus (COVID-19) continua ad intensificare in molte parti del mondo, lo sviluppo del vaccino sta continuando rapidamente. Effettivamente, i vaccini approvati più in anticipo ora stanno amministrandi alle centinaia di migliaia di gente dappertutto.

Tuttavia, l'avvenimento delle mutazioni che piombo all'emergenza delle varianti multiple piombo ad incertezza circa la possibilità delle mutazioni di fuga, che renderebbero questi vaccini inefficaci.

Una nuova pubblicazione preliminare sul " server " del bioRxiv*, sembrante nel dicembre 2020, indica che questi timori possano essere inutili, dato lo stato corrente di conoscenza circa il virus.

Analisi del disadattamento: l

Analisi del disadattamento: l'espansione demografica e spaziale valuta per i 37 aplotipi della proteina della PUNTA SARS-CoV-2. Credito di immagine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.16.423166v1.full.pdf

La proteina della punta

Il virus dietro COVID-19 è il coronavirus 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo, che è conosciuto per mediare la sua entrata nella cellula ospite via la sua proteina della punta. Ciò consiste della proteina di fusione della classe A I, con un'estremità inclusa nella busta virale e l'altra che sporge dalla superficie. Questa proteina entrambe riconosce i attaches a e fonde con la membrana cellulare ospite per raggiungere l'interiorizzazione nella cellula ospite.

Il virus all'interno della cella ora continua a ripiegare il suo genoma ed a tradurre le sue componenti strutturali e non strutturali, per montare i nuovi virions maturi. La proteina esposta della punta è un obiettivo pronto per le celle di T, che quindi sono attivate per produrre gli anticorpi policlonali ai parecchi epitopi e domini specifici della proteina della punta. Questi anticorpi stanno neutralizzando spesso in natura, bloccante il collegamento del virus al recettore cellulare ospite, l'enzima di conversione dell'angiotensina 2 (ACE2).

La proteina della punta è metastabile nel suo modulo di prefusion, che è composto di due sottounità, S1 e S2. Il primo media l'associazione al ricevitore via il suo dominio dell'ricevitore-associazione (RBD) ed il secondo è responsabile di fusione della membrana della virus-cella. Ciò permette che il virus entri nella cella, ma questo trattamento dipende dalle proteasi della cellula ospite, che devono fendere gli sottounità.

Obiettivo della punta per i antivirals e le immunoterapie

Il ruolo chiave della proteina di S gli ha reso un obiettivo principale per le immunoterapie ed i antivirals come pure per i vaccini in sviluppo.

Più presto, la scoperta della natura antigenica potente della proteina della punta in SAR-CoV e MERS-CoV hanno avviato l'uso di questa proteina come antigene vaccino. Negli studi del mouse, gli antisieri raccolti dai mouse immunizzati con la proteina di S dei SAR-CoV più iniziali contrassegnato hanno diminuito l'entrata del virus nelle cellule bersaglio.

Ciò suggerisce l'induzione di immunità inter-reattiva contro gli epitopi della proteina della punta, che altamente sono conservati nei coronaviruses. Entro 14 giorni l'post-immunizzazione, sia anticorpi di neutralizzazione che celle di T che mirano alla proteina della punta è rilevabile. Questi animali sono stati trovati per avere caricamenti virali bassi nelle vie respiratorie che seguono l'esposizione successiva al virus.

Mentre altre terapie stanno esplorande, compreso gli estratti di piante medicinali e piccoli molecole o peptidi che mirano a questa proteina, c'è parecchio da fare, parlante tecnologicamente, prima che questi diventino disponibili come droghe commercialmente possibili completamente provate ed approvate.

Risultati di studio

Lo studio corrente ha mirato ad esplorare la diversità molecolare della proteina della punta in popolazioni virali differenti, che possono cambiare la conformazione genetica e permettere all'evasione immune. Il gruppo dei ricercatori, dal laboratorio di genetica di popolazione e di biologia evolutiva di calcolo (LaBECom-UNIVISA), ha effettuato un'analisi della varianza molecolare (AMOVA) su 37 varianti differenti della proteina della punta SARS-CoV-2.

Questi aplotipi si riferiscono agli insiemi collegati delle variazioni nel genoma. Tutti sono stati recuperati pubblicamente - dalla piattaforma nazionale disponibile del centro d'informazione di biotecnologia (NCBI).

I ricercatori hanno trovato molto un a basso livello di diversità fra gli aplotipi. Il numero delle inserzioni, le eliminazioni, le transizioni e le transversioni erano molto bassi. Hanno osservato soltanto 17 siti polimorfici nella proteina della punta. Gli indici analitici molecolari di diversità hanno mostrato un'assenza di mutazioni significative per questi aplotipi e nessun'espansione significativa della popolazione è stata osservata l'uno o l'altro.

Che cosa sono le implicazioni?

I ricercatori, quindi, trovati che gli aplotipi della punta SARS-CoV-2 sono altamente simili. “Ammettiamo quella diversità molecolare per questa proteina, se trovato negli studi futuri, può essere associato con le componenti della variazione all'infuori delle sostituzioni trovate comunemente nel genoma SARS-CoV-2.„

Questi risultati sono d'accordo con la conservazione conosciuta della sequenza della punta. Quindi, dicono, la variabilità genetica riferita del virus risparmia alcuni geni virali, lascianti alcune proteine ancestrali intatte. I metodi impiegati in questo studio hanno tenuto conto il modo discontinuo in cui gli aplotipi hanno sviluppato le variazioni genetiche, via parecchie fasi intermedie mutational. Gli estimatori utilizzati hanno acconsentito con l'uniformità dei risultati, malgrado la loro alta sensibilità per tutta la variazione molecolare.

Queste considerazioni assicurano che l'uso di neutralizzazione degli anticorpi possa potere sopprimere la proliferazione del virus, ulteriore giustificando lo sviluppo dei vaccini basati su proteina S.

Avviso *Important

il bioRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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