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O pesquisador descobre sete impressões digitais do ADN que definem o risco de cancro

O estilo de vida, ou posto uma outra maneira “hábitos ruins”, é uma das explicações do livro de texto para porque alguns povos estão em um risco mais alto para o cancro. Nós ouvimo-nos frequentemente que fumar aumenta nosso risco de desenvolver o câncer pulmonar ou que uma dieta alto-gorda aumenta nosso risco de desenvolver o cancro das entranhas, mas não todos os fumadores ficam o câncer pulmonar e não todos os povos que comem cheeseburgers ficam o cancro das entranhas. “Outros factores” devem estar no jogo.

Agora, a pesquisa nova da universidade do Dr. Edwin Wang do cientista de Calgary, PhD, está derramando a luz naqueles “outros factores”. Wang descobriu sete impressões digitais ou testes padrões do ADN que definem o risco de cancro. A pesquisa é publicada em avanços da ciência.

Esta descoberta reescreve a explicação do livro de texto que o cancro ocorre devido ao comportamento humano combinado com alguma má sorte incluir sua composição genética. Nós acreditamos que um bebê é nascido com um teste padrão genomic do germline e não mudará, e que o teste padrão está associado com um risco de cancro mais baixo ou mais alto.”

Dr. Edwin Wang, Ph.D., cientista, universidade de Calgary

A pesquisa oferece a introspecção nova no risco multi-geracional da doença enquanto o germline representa as pilhas que determinam nossas crianças e o ADN que é passado do pai às crianças. É a primeira vez que os cientistas descreveram estes testes padrões biológicos alto-especializados aplicáveis ao risco de cancro.

Wang, um biólogo dos sistemas do cancro e o cientista grande dos dados, posses a Alberta inovam cadeira Translational na genómica do cancro. Supor que todos ajustes nestes arrisca as categorias que fazem as mais-ou-menos predispor ao cancro, bem como uma escala de deslizamento. Um membro do instituto na Faculdade de Medicina (ACHRI) do Cumming, Wang do instituto de investigação do hospital de crianças de Alberta e do cancro de Arnie Charbonneau encontrou que as impressões digitais do ADN poderiam ser classificadas em subgrupos com taxas de sobrevivência distintas. Uma da protecção de sete ofertas dos germlines do cancro tornando-se, e outros seis germlines apresenta um risco maior para o cancro.

“É interessante que um destes germlines é protector contra o cancro se tornando e apareceu freqüentemente em nossa análise dos genomas,” diz Wang, um professor no departamento do CSM da bioquímica e da biologia molecular. “Nós sabemos que há os indivíduos que podem fumar e têm um estilo de vida insalubre mas para ficar nunca o cancro, e esta descoberta pode explicar que os fenômenos.”

Para esta pesquisa, Wang conduziu uma análise sistemática maciça de mais de 26.000 genomas do germline dos indivíduos, dos aproximadamente 10.000 povos que estiveram com o cancro, e do resto sem. Sua equipe analisou ficheiros informáticos das pacientes que sofre de cancro no instituto nacional para o cancro - dados recolhidos pelo instituto de saúde nacional para o atlas do genoma do cancro, parte dos institutos de saúde nacionais nos E.U. As amostras incluem 22 cancros distintos, incluindo o pulmão, pancreático, a bexiga, o peito, o cérebro, o estômago, o tiróide, e o osso e a dúzia mais. O grupo de pessoas de controle sem cancro incluiu grupos genomic-arranjados em seqüência da Suécia, da Inglaterra e do Canadá.

As quantidades de dados maciças podiam somente ser processadas com aprendizagem de máquina. O laboratório de Wang é equipado para tratar os dados através das redes ultra de alta velocidade em UCalgary. Esta pesquisa exige uma quantidade colossal de armazenamento de computador: 10 milhão Terabyte. Para ajudar a compreender este volume, um Terabyte pode armazenar 250 filmes.

“Mesmo em de alta velocidade, com os dois córregos que executam 24/7, tomou a nosso laboratório três meses rectos apenas para transferir a informação biológica que contem biliões e biliões de nucleotides em cada genoma individual,” diz Wang.

Wang nota aquele entre cinco a 10 por cento dos cancros é causado por mutações genéticas específicas. Pense do cancro da mama e do gene herdado BRCA1 e BRCA2, uma mutação genética feita de conhecimento geral pelo actor Angelina Jolie. Wang suspeitou sempre que estes cancros herdados representam somente um punhado das associações e empreenderam uma investigação mais profunda com capacidades genomic avançadas render mais associações.

“Nós quisemos investigar se um teste padrão genomic ou um substancial, perfil seqüencial repetidamente de ocorrência nos genomas poderiam servir como uma medida prometedora para a predisposição genética ao cancro,” dizemos Wang.

“Nós encontramos que uma ADN-impressão digital era dez enriquecidos às centenas de épocas nos genomas do germline das pacientes que sofre de cancro, sugerindo que fosse um risco de cancro herdável universal da codificação do traço.” A pesquisa igualmente descobriu que uma outra ADN-impressão digital estêve enriquecida altamente nas pacientes que sofre de cancro que eram igualmente fumadores do tabaco, indicando que os fumadores que carregam tal ADN-impressão digital têm um risco mais alto de cancro.

A medicina Genomic faz o diagnóstico da doença mais eficiente, eficaz na redução de custos, e pode ajudar povos a fazer decisões da saúde ao longo de sua vida. A pesquisa de Wang coloca o fundamento para as ferramentas que poderiam ajudar especialistas do cancro e médicos de família a guiar pacientes. “Eu espero que uns estudos mais adicionais estão realizados para expandir em cima deste trabalho, de modo que possa eventualmente ser posto na prática permitindo que os clínicos informem pacientes de seu risco de cancro e como tomar precauções para assegurar uma vida saudável.”

Source:
Journal reference:

Xu, X., et al. (2020) Germline genomic patterns are associated with cancer risk, oncogenic pathways, and clinical outcomes. Science Advances. doi.org/10.1126/sciadv.aba4905.