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El investigador descubre siete huellas dactilares de la DNA que definan riesgo de cáncer

La forma de vida, o puesto otra manera “hábitos malos”, es una de las explicaciones del libro de texto para porqué algunas personas están en un riesgo más alto para el cáncer. Oímos a menudo que el fumar aumenta nuestro riesgo de desarrollar el cáncer de pulmón o que una dieta de alto grado en grasas aumenta nuestro riesgo de desarrollar el cáncer del intestino, pero no todos los fumadores consiguen el cáncer de pulmón y no toda la gente que come los cheeseburgers consigue el cáncer del intestino. “Otros factores” deben estar en el juego.

Ahora, la nueva investigación de la universidad del Dr. Edwin Wang, doctorado del científico de Calgary, está vertiendo la luz en esos “otros factores”. Wang ha descubierto siete huellas dactilares o las configuraciones de la DNA que definen riesgo de cáncer. La investigación se publica en avances de la ciencia.

Este descubrimiento reescribe la explicación del libro de texto que el cáncer ocurre debido a la conducta humana combinada con una cierta suerte mala de incluir su maquillaje genético. Creemos que un bebé nace con una configuración genomic del germline y no cambiará, y que la configuración está asociada a un riesgo de cáncer más inferior o más alto.”

El Dr. Edwin Wang, Ph.D., científico, universidad de Calgary

La investigación ofrece nuevo discernimiento en riesgo multi-generacional de la enfermedad mientras que el germline representa las células que determinan nuestros niños y la DNA que se pasa de padre a los niños. Es la primera vez que los científicos han descrito estas configuraciones biológicas sumamente especializadas aplicables al riesgo de cáncer.

Wang, un biólogo y el científico grande de los datos, asimientos de los sistemas del cáncer la Alberta innova silla de translación en genómica del cáncer. Él presume que todo el mundo los ajustes en éstos arriesga las categorías que las hacen más o menos predispuestas al cáncer, como una escala variable. Una pieza del instituto de investigación del hospital de niños de Alberta (ACHRI) y del instituto en la Facultad de Medicina del Cumming, Wang del cáncer de Arnie Charbonneau encontró que las huellas dactilares de la DNA se podrían clasificar en subgrupos con tasas de supervivencia distintas. Uno de la protección de siete ofertas de los germlines contra cáncer que se convierte, y los otros seis germlines presenta un mayor riesgo para el cáncer.

“Es interesante que uno de estos germlines es protector en contra cáncer que se convierte y apareció con frecuencia en nuestro análisis de genomas,” dice Wang, profesor en el departamento del CSM de la bioquímica y de la biología molecular. “Sabemos que hay los individuos que pueden fumar y tienen una forma de vida malsana pero nunca conseguir el cáncer, y este descubrimiento pueda explicar que los fenómenos.”

Para esta investigación, Wang conducto un análisis sistemático masivo de más de 26.000 genomas del germline de los individuos, de cerca de 10.000 personas que tenían cáncer, y del descanso fuera. Sus personas analizaban ficheros informáticos de los enfermos de cáncer en el Instituto Nacional del Cáncer - datos cerco por el instituto de la salud nacional para el atlas del genoma del cáncer, parte de los institutos de la salud nacionales en los E.E.U.U. Las muestras incluyen 22 cánceres distintos, incluyendo el pulmón, pancreático, diafragma, pecho, cerebro, estómago, tiroides, y hueso y docena más. El grupo de personas de mando sin cáncer incluyó a grupos genomic-ordenados de Suecia, de Inglaterra y de Canadá.

Las cantidades de datos masivas se podían tramitar solamente con el aprendizaje de máquina. El laboratorio de Wang se equipa para ocuparse de datos a través de redes ultra de alta velocidad en UCalgary. Esta investigación requiere una cantidad colosal de memoria interna: 10 millones de Terabyte. Para ayudar a entender este volumen, un Terabyte puede salvar 250 películas.

“Incluso en de alta velocidad, con dos corrientes ejecutando 24/7, tardó a nuestro laboratorio tres meses derechos apenas para transferir la información directamente biológica que contenía mil millones y los mil millones de nucleótidos en cada genoma individual,” dice Wang.

Wang observa eso entre el cinco a 10 por ciento de cánceres es causado por mutaciones de gen específicas. Piense en el cáncer de pecho y el gen heredado BRCA1 y BRCA2, una mutación de gen hecha sabida extensamente por el actor Angelina Jolie. Wang ha sospechado siempre que estos cánceres heredados representan solamente un puñado de asociaciones y que emprendieron una investigación más profunda con capacidades genomic avanzadas para rendir más asociaciones.

“Quisimos investigar si una configuración genomic o un substancial, perfil secuencial en varias ocasiones de ocurrencia en genomas podría servir como medición prometedora para la predisposición genética al cáncer,” decimos Wang.

“Encontramos que una DNA-huella dactilar era diez enriquecidos a los centenares de épocas en los genomas del germline de enfermos de cáncer, sugiriendo que es un riesgo de cáncer que se puede heredar universal de la codificación del rasgo.” La investigación también destapó que otra DNA-huella dactilar fue enriquecida altamente en los enfermos de cáncer que eran también fumadores del tabaco, indicando que los fumadores que soportan tal DNA-huella dactilar tienen un riesgo más alto del cáncer.

El remedio Genomic hace la diagnosis de enfermedad más eficiente, de poco costo, y puede ayudar a gente a tomar decisiones de la salud en su vida. La investigación de Wang pone la base para las herramientas que podrían ayudar a especialistas del cáncer y a médicos de cabecera a conducir a pacientes. “Espero que otros estudios estén realizados para desplegarse sobre este trabajo, para poderlo poner eventual en práctica permitiendo que los clínicos informen a pacientes su riesgo de cáncer y cómo tomar precauciones para asegurar una vida sana.”

Source:
Journal reference:

Xu, X., et al. (2020) Germline genomic patterns are associated with cancer risk, oncogenic pathways, and clinical outcomes. Science Advances. doi.org/10.1126/sciadv.aba4905.