Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

Os cientistas desenvolvem um método novo para estudar as características moleculars de pilhas de T

Os cientistas do sudoeste de UT desenvolveram um método novo para estudar as características moleculars de pilhas de T, as pilhas imunes críticas que reconhecem e atacam invasores no corpo tal como vírus, bactérias, e cancro.

A aproximação, descrita hoje nos métodos da natureza do jornal, permite pesquisadores a analisa mais facilmente os papéis dos receptors de célula T (TCRs) - as moléculas nas superfícies das pilhas de T que são responsáveis para reconhecer os micróbios patogénicos.

Isto poderia conduzir a uma compreensão melhor de como as pilhas de T trabalham assim como as maneiras novas de aproveitar pilhas de T para lutar a doença.”

Tao Wang, Ph.D., líder do estudo, professor adjunto da população e as ciências dos dados e membro do centro de pesquisa biomedicável quantitativo em UTSW

Quando algumas pilhas imunes puderem simultaneamente atacar os micróbios patogénicos diferentes, as pilhas de T são mais visadas - cada t cell individual tem um grupo distinto de receptors de célula T (TCRs) em sua superfície. Cada receptor reconhece geralmente somente uma molécula específica, ou “antígeno.” Um TCR, por exemplo, pôde ligar somente a uma proteína encontrada em câncers pulmonares, quando um TCR diferente pôde ligar apenas a um virus da gripe. Quando um t cell encontra um antígeno que ligue a um de seu TCRs, torna-se ativado, alertando uma resposta imune. Para defender fora o grupo diverso de invasores potenciais, os seres humanos têm milhões de pilhas de T diferentes em seus corpos.

Os cientistas tentaram estudar o que faz pilhas de T diferentes e TCRs mais ou menos eficaz, impedido até agora por uma falta da informação sobre o que vário TCRs faz. Geralmente, supor esse TCRs que ligamento idêntico da obrigação aos antígenos similares, e que todo o TCRs activa pilhas de T em uma maneira similar.

Para eliminar esta adivinhação, a equipa de investigação desenvolveu um modelo estatístico que combina duas tecnologias existentes: Análise de TCR, que mede a diversidade do TCR de uma pessoa, e RNA da único-pilha que arranja em seqüência, que identifica os genes particulares que são girados de ligar/desligar em um t cell. Combinar estas tecnologias foi desafiante desde que ambas geram muitos milhares de partes de dados pela experiência, e os dados vêm em dois formulários diferentes.

O modelo novo, Tessa dublada, usa métodos estatísticos poderosos para construir uma ponte sobre esta diferença. Tessa revela o que acontecem a um t cell individual quando seu TCR reconhece um antígeno, e nos que impacto de TCRs da maneira a função das pilhas de T. (Tessa representa a avaliação funcional da paisagem de TCR supervisionada com análise scRNA-arranjando em seqüência.)

Usando Tessa, os pesquisadores estudaram 100.288 pilhas de T de ambos os povos e pacientes que sofre de cancro saudáveis. Nas pacientes que sofre de cancro, descobriram que a variedade de TCRs em pilhas de T tem uma influência mais fraca no estado funcional de pilhas de T do que naqueles encontrados em pacientes saudáveis. Isto é provável porque uma pletora de outras moléculas imunes, segregada no microambiente do tumor, está influenciando a actividade de célula T em outras maneiras. Esta observação - e outro que são prováveis resultar de um uso mais difundido de Tessa - poderiam ter as implicações para cientistas que projetam tratamentos contra o cancro imune-baseados.

David Gerber, M.D., professor da medicina interna e a população e as ciências dos dados, e director adjunto da pesquisa clínica no centro do cancro de Harold C. Simmons Detalhado em UT do sudoeste, acredita que este trabalho fornece uma maneira completamente nova de usar o único t cell que arranja em seqüência dados. “Nós prevemos distribuir esta ferramenta prometedora para estudar os papéis de pilhas de T nos eventos adversos imune-relacionados causados pela imunoterapia do cancro através de uma concessão recentemente financiada de NIAID U01,” diz.

“As técnicas precedentes envolveram muita suposição quando se trata da função exacta de pilhas de T e como os receptors de célula T associam com a função,” adicionam Todd Aguilera, M.D., Ph.D., um professor adjunto de UTSW da oncologia da radiação, e um perito na imunoterapia, que igualmente está colaborando com o Wang. “Eu acredito que este método poderia ajudar a identificação do TCRs o mais prometedor para a imunoterapia TCR-baseada personalizada e melhor definir respostas imunes produtivas à identificação do guia das estratégias óptimas da imunoterapia.”