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Los científicos desarrollan un nuevo método para estudiar las características moleculares de las células de T

Los científicos al sudoeste de UT han desarrollado un nuevo método para estudiar las características moleculares de las células de T, las células inmunes críticas que reconocen y atacan a invasores en la carrocería tal como virus, bacterias, y cáncer.

La aproximación, descrita hoy en los métodos de la naturaleza del gorrón, habilita a investigadores a analiza más fácilmente el papeles de los receptores del linfocito T (TCRs) - las moléculas en las superficies de las células de T que son responsables de reconocer patógeno.

Esto podría llevar a una mejor comprensión de cómo las células de T trabajan así como las nuevas maneras de aprovechar las células de T para luchar enfermedad.”

Tao Wang, Ph.D., líder del estudio, profesor adjunto de la población y ciencias de los datos y pieza del centro de investigación biomédico cuantitativo en UTSW

Mientras que algunas células inmunes pueden atacar simultáneamente diversos patógeno, las células de T son apuntadas - cada linfocito T individual tiene un equipo distinto de receptores del linfocito T (TCRs) en su superficie. Cada receptor reconoce generalmente solamente una molécula específica, o el “antígeno.” Un TCR, por ejemplo, pudo atar solamente a una proteína encontrada en cánceres de pulmón, mientras que un diverso TCR pudo atar apenas a un virus de gripe. Cuando un linfocito T encuentra un antígeno que ate a uno de su TCRs, se activa, incitando una inmunorespuesta. Para rechazar el equipo diverso de invasores potenciales, los seres humanos tienen millones de diversas células de T en sus carrocerías.

Los científicos han tentativa estudiar qué hace diversas células de T y TCRs más o menos efectivo, obstaculizado hasta ahora por una falta de información sobre lo que lo hace diverso TCRs. Generalmente, asumen ese TCRs que lazo camuflado de la necesidad a los antígenos similares, y que active todo el TCRs las células de T de una manera similar.

Para eliminar esta conjetura, el equipo de investigación desarrolló un modelo estadístico que combinaba dos tecnologías existentes: Análisis de TCR, que mide la diversidad del TCR de una persona, y ARN unicelular que ordena, que determina los genes determinados que se giran con./desc. en un linfocito T. Combinar estas tecnologías ha sido desafiador puesto que ambas generan muchos millares de pedazos de datos por el experimento, y los datos vienen en dos diversas formas.

El modelo nuevo, Tessa aparada, utiliza métodos estadísticos potentes para llenar este vacío. Tessa revela qué suceso a un linfocito T individual cuando su TCR reconoce un antígeno, y en qué impacto de TCRs de la manera la función de las células de T. (Tessa representa la apreciación funcional del paisaje de TCR vigilada con análisis de scRNA-secuencia.)

Usando Tessa, los investigadores estudiaron 100.288 células de T de ambas personas y enfermos de cáncer sanos. En enfermos de cáncer, descubrieron que la variedad de TCRs en células de T tiene una influencia más débil en el estado funcional de las células de T que en ésos encontrados en pacientes sanos. Esto es probable porque una plétora de otras moléculas inmunes, secretada en el microambiente del tumor, está influenciando actividad del linfocito T de otras maneras. Esta observación - y otras que son probables resultar de un uso más disperso de Tessa - podrían tener implicaciones para los científicos que diseñaban tratamientos contra el cáncer inmune-basados.

David Gerber, M.D., profesor del remedio interno y población y las ciencias de los datos, y director adjunto de la investigación clínica en el centro del cáncer de Harold C. Simmons Comprehensive en UT al sudoeste, cree que este trabajo ofrece totalmente una nueva manera de usar el único linfocito T que ordena datos. “Prevemos el desplegar de esta herramienta prometedora para estudiar el papeles de las células de T en las acciones adversas inmune-relacionadas causadas por inmunoterapia del cáncer a través de una recompensa recientemente financiada de NIAID U01,” él dice.

Las “técnicas anteriores han implicado mucho conjeturar cuando se trata de la función exacta de las células de T y cómo los receptores del linfocito T se asocian a la función,” agregan a Todd Aguilera, M.D., Ph.D., profesor adjunto de UTSW de la oncología de la radiación, y experto en la inmunoterapia, que también está colaborando con Wang. “Creo que este método podría ayudar a la identificación del TCRs más prometedor para la inmunoterapia TCR-basada personalizada y definir mejor inmunorespuestas productivas a la identificación de la guía de las estrategias óptimas de la inmunoterapia.”