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L'intestin et les microbiomes oraux prévoient la gravité COVID-19

Une question qui continue à demeurer sans réponse pendant la pandémie actuelle de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19) a été pourquoi y a il une configuration distinctive de coup-et-coup manqué quand il s'agit de maladie sévère ? Une étude neuve intéressante qui apparaît sur le serveur de prétirage de medRxiv* indique exactement un facteur de risque hautement approprié : la condition des microbiomes oraux et d'intestin.

L'onde de ressort de COVID-19 a rempli beaucoup d'hôpitaux et d'unités de soins intensifs de patients haletant pour l'haleine. Beaucoup de fois qui numérotent sont examinées pour l'admission. Le besoin de biomarqueurs efficaces et fiables de risque n'a jamais été plus grand.

Petits groupes d'étude

La rayure de la mortalité 4C a été décrite en septembre 2020 pour répondre à ce besoin par le consortium aigu sévère international d'infections (ISARIC) et l'Organisation Mondiale de la Santé respiratoires et apparaissants (WHO). Ce système de notation étendu de risque comporte huit variables, y compris l'âge, le sexe, d'autres maladies préexistantes, le niveau de la conscience, la saturation de l'oxygène dans le sang périphérique, et la protéine C réactive (CRP).

Avec cette information, cependant, l'exactitude de la prévision était seulement 79%, avec 30% de patients à un haut risque de la mortalité étant manquée. Ceci a piloté la tentative de prévoir le risque de fatalité par une autre méthode. Les chercheurs dans l'étude actuelle se sont servis du fait qui étripent des microbiomes dans des troubles sévères d'exposition des patients COVID-19, dysbiosis appelé, avec 23 familles bactériennes en particulier étant jointes à la gravité de la maladie parmi les patients qui ont été hospitalisés avec COVID-19.

Les scientifiques ont installé un cadre robuste utilisant de calcul et des outils d'analyse pour tracer les réseaux des tiges entre le microbiota, les caractéristiques cliniques, et la gravité de la maladie. Ils ont trouvé cet enterocoque, une substance d'oral et les bactéries intestinales, peuvent robuste prévoir une issue fatale dans ces patients.

Cette petite étude a compris 69 patients COVID-19 avec le modéré aux symptômes sévères, c.-à-d., ceux qui ont exigé moins qu'ou plus de 4 litres de l'oxygène, respectivement. De ces derniers, 63 ont eu de pleins dossiers médicaux. Les caractéristiques cliniques de ligne zéro étaient comparables dans les deux groupes, sévères et modérées. Les patients sévères ont dû rester dans l'hôpital pour six jours davantage, en moyenne, que les patients modérément mauvais.

Sur analyser les caractéristiques sur des comorbidités, les chercheurs ont constaté qu'une combinaison des variables cliniques, y compris la gravité de COVID-19, a eu l'exactitude de 89% en prévoyant une issue fatale. En fait, la condition pour 4 litres de l'oxygène était le facteur en chef en prévoyant des tels résultats. Quand la gravité de la maladie n'a pas été considérée, l'exactitude a chuté à 84%. Ceci qui trouve prouve que les symptômes respiratoires sont d'importance en prévoyant les résultats COVID-19.

La fatalité COVID-19 est prévue par la gravité des symptômes respiratoires et d
La fatalité COVID-19 est prévue par la gravité des symptômes respiratoires et d'autres comorbidités utilisés généralement aux patients de sélection. (a) Endroit sous la courbe recevant la courbure fonctionnante (AUC-ROC) pour la prévision de évaluation de contre-vérification de congé-un-à l'extérieur de l'exactitude de la fatalité COVID-19. Les lignes rouges correspondent au modèle comprenant tous les covariates cliniques (CC), ligne noire correspondent au modèle comprenant tous les covariates cliniques excepté la gravité de la maladie (cc, aucune gravité). (b) Covariates a sélecté par le modèle fait au hasard de catégorie de forêt classé selon leur importance en classifiant la fatalité comme résultats de la maladie. (c) Pour les covariates catégoriques (Yes=1, No=0) le nombre de patients hors des 63 compris dans les analyses dans une catégorie spécifique étaient coloré par des résultats (survécus, dans le bleu ; Est mort, en rouge). (d) Pour la variable numérique, des plots de favori (la médiane, enferment dans une boîte 5ème et 9ème le percentile interquartile de gamme, pour des lignes) sont employés avec chaque point solide correspondant à un patient unique. (Valeur de p réglée par BH < 0,05)

Les selles ou le microbiome oral prévoient la gravité

On le sait qu'un viral infection du poumon a un choc à long terme sur le microbiome d'intestin. Les chercheurs se sont servis, pour cette raison, de cette connaissance pour prévoir la gravité de COVID-19, l'associant à d'autres actions communes. Ils ont vérifié l'effet d'employer les variables cliniques seulement, la composition intestinale de microbiome seulement, la composition orale de microbiome seulement, les deux premiers combinés, et le premier et le tiers en association.

Ils ont constaté que l'exactitude du premier modèle était ~76%. De nouveau, les comorbidités que le meilleur a prévu la gravité de la maladie étaient ceux comme le cholestérol élevé, le chemin latin, la maladie coronarienne, l'asthme, l'obésité, la difficulté respiratoire liée à l'hypoxie, le rythme respiratoire rapide, le numéro des jours dans l'hôpital, la thrombose, et le sexe mâle.

Utilisant les deuxièmes et troisième modèles, avec le microbiota du tabouret ou la bouche comme facteurs prédictifs, ils ont trouvé des exactitudes de 92% et de 84%, respectivement. C'est une amélioration 122% et 111% d'exactitude, respectivement.

Les modèles combinés ont montré l'exactitude de prévision la plus élevée, à 96%, proposant que le microbiota oral ou d'intestin soient meilleur à prévoir la gravité COVID-19. Sur l'analyse approfondie du microbiota, les chercheurs ont trouvé une substance d'indicateur qui peut être cultivée dans le laboratoire clinique.

Premier facteur prédictif

Les trois substances bactériennes principales pour la prévision de la gravité COVID-19 dans le microbiome intestinal étaient des uniformis de bacteroide, enterocoque faecalis, et pectinilyticus de Monoglobus, alors que tels du microbiome oral étaient des endodontalis de Porphyromonas, tobetsuensis de Veillonella, et brève de Bifidobacterium.

Bactéries faecalis d
Bactéries faecalis d'enterocoque connues sous le nom de Streptococcus faecalis. Ces bactéries sont arrondies ou des coques ovales, sont vus formant ici type des réseaux des cellules. Crédit d'image : Shutterstock

L'analyse directionnelle a prouvé qu'une réduction de l'abondance de l'enterocoque faecalis, et les endodontalis de Porphyromonas, dans l'intestin et la bouche, respectivement, dans les patients modérément malades COVID-19, ou une augmentation dans l'abondance de ces substances pathologiques dans les patients sévèrement malades, étaient les meilleurs facteurs prédictifs de COVID-19 sévère.

Les facteurs prédictifs du modéré COVID-19 ont inclus une augmentation en abondance du bacteroide fragilis, les caccae de bacteroide, et le clostridioforme de Clostridium, dans le tabouret ou l'intestinale de Muribaculum de la bouche.

Ils ne pourraient trouver aucune corrélation entre le nombre de bactéries d'aucune substance et les titres d'anticorps, quoique de anti-RBD niveaux plus élevés d'IgG soient marqués avec la survie. Ceci peut signifier que le microbiota et les niveaux d'IgG sont les facteurs prédictifs indépendants des résultats sévères.

Conclusion

« Dans cette étude, nous avons expliqué que la gravité de la maladie COVID-19 peut être prévue par le tabouret ou la composition orale de microbiome avec de grande précision que des méthodes de rayure cliniques traditionnelles. En particulier, deux pathobionts dans le (enterocoque faecalis) le microbiota oral (des endodontalis de Porphyromonas) ou intestinal peuvent servir de substance d'indicateur pour prévoir robuste la gravité des infections SARS-CoV-2. »

Ceci pourrait aboutir à améliorer la stratification du risque de patients, d'autant plus qu'il est facile et peu coûteux cultiver enterocoque faecalis. Ceci pourrait aider à fournir un support plus tôt pour les patients qui sont susceptibles de développer la maladie mortelle. Les chercheurs demandent instamment que cette bactérie soit comprise dans la stratification du risque clinique dans le réglage de santé.

La gravité de la maladie est liée à l'inflammation excessive, et ceci pourrait être un résultat du dysbiosis d'intestin, qui a été incriminé dans plusieurs états inflammatoires continuels. Cet endroit exige davantage de recherche, de comprendre particulièrement le rôle des cellules de T de réglementation (Tregs), qui sont responsables de l'immunomodulation dans des circonstances normales mais peut être anormalement exprimé en COVID-19.

De telles études pourraient aider à déterminer comment « le dysbiosis dans les patients SARS-CoV-2 infectés, et particulièrement l'enrichissement des pathobionts nous ont observé dans cette cohorte, peuvent contribuer à la gravité de la maladie COVID-19 par l'intermédiaire du changement du développement de Treg. »

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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