Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

Estude SHIFT espaciais dos monitores da expressão genética do fígado no relacionamento ao pulso de disparo circadiano

Nada na biologia é estático. Os processos biológicos flutuam ao longo do tempo, e se nós devemos unir uma imagem exacta das pilhas, dos tecidos, dos órgãos etc., nós temos que levar em consideração seus testes padrões temporais. De facto, este esforço causou um campo de estudo inteiro conhecido como a “cronobiologia”.

O fígado é um excelente exemplo. Tudo que nós comemos ou a bebida é processada eventualmente lá para separar nutrientes do desperdício e para regular o balanço metabólico do corpo. De facto, o fígado no conjunto tempo-é regulado extensivamente, e este teste padrão é orquestrado ritmos o pulso de disparo circadiano assim chamado, o metrônomo interno do nosso corpo, assim como os sinais bioquímicos e comer.

Mas o fígado é dividido realmente nas unidades de repetição pequenas chamadas os “lóbulo”, em que as zonas distintas executam funções diferentes. Esta organização espacial intrincada é sabida como do “o zonation fígado”. Por exemplo, a divisão dos açúcares durante a digestão ocorrer preferencial em um lado do lóbulo, a zona central assim chamada, quando a produção de glicose quando nós descansarmos das lojas tais como a gordura, ocorre no outro lado do fígado, no lado portal.

Até agora, o zonation do fígado foi estudado somente estaticamente, olhando o que cada zona faz independentemente do tempo, em e vice-versa. E dado como a central o fígado está na fisiologia mamífera, as duas aproximações da pesquisa têm que juntar-se a esforços para compreender como os programas temporais e espaciais do fígado interagem.

Em um primeiro - estude nunca, cientistas em EPFL e o instituto de Weizmann da ciência, conduzido por professores Felix Naef na escola de EPFL das ciências da vida e Shalev Itzkovitz no Weizmann, pôde monitorar as SHIFT espaciais da expressão genética dentro dos lóbulo do fígado no relacionamento ao pulso de disparo circadiano. Estudar esta relação é um foco da pesquisa de Naef, que tem descoberto previamente conexões entre o pulso de disparo circadiano e as proteínas do fígado, nossos ciclos de pilha, e mesmo a estrutura 3D da cromatina, o ADN firmemente empacotado no núcleo de pilha.

O estudo saiu de uma concessão da junção de EPFL-Weizmann da fundação de Rothschild Caesarea.

Explorando a capacidade para analisar o tecido do fígado em cada pilha individual, os pesquisadores estudaram aproximadamente 5000 genes em pilhas de fígado em diversos timepoints ao longo do dia de 24 horas. Então classificaram estatìstica os testes padrões que descobriram com um modelo que pudesse capturar variações espaciais e temporais nos níveis do RNA de mensageiro (mRNA), um marcador do espaço tempo da expressão genética.

O estudo revelou que muitos dos genes do fígado parecem ser zonated e rítmicos, significando que estão reguladas em seu lugar no fígado e a hora do dia. Estes genes dupla regulados são ligados na maior parte para fechar funções do fígado, por exemplo o metabolismo dos lipidos, hidratos de carbono, e os ácidos aminados, mas igualmente inclui alguns genes que foram associados nunca com o metabolismo, por exemplo genes relativos às proteínas do acompanhante, que ajudam outras biomoléculas a mudar sua estrutura 3D ou mesmo à montar e a desmontar.

O trabalho revela uma riqueza da dinâmica da expressão genética do espaço tempo do fígado, e mostra como a divisão em compartimentos da função de fígado no espaço e no tempo é indicação da actividade metabólica no fígado mamífero.”

Felix Naef, a escola de EPFL das ciências da vida

Source:
Journal reference:

Droin, C., et al. (2021) Space-time logic of liver gene expression at sub-lobular scale. Nature Metabolism. doi.org/10.1038/s42255-020-00323-1.