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La mutation neuve de N501 SARS-CoV-2 a pu avoir diffusé en Italie depuis août 2020

Une étude récente publiée en tourillon de maladies infectieuses de The Lancet prouve que le coronavirus muté de syndrôme respiratoire aigu sévère 2 tensions (SARS-CoV-2) avec un remplacement à la position 501 pourrait avoir diffusé inaperçu même avant fin septembre 2020, quand l'émergence rapide de la lignée B.1.1.7 (transportant la mutation de N501Y) était au commencement rapportée.

Le 14 décembre 2020, les autorités du Royaume-Uni rapporté à l'Organisation Mondiale de la Santé (WHO) qu'une variante neuve de SARS-CoV-2, un agent causal d'une pandémie actuelle de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19), a été recensée par l'ordonnancement génomique viral.

Cette variante, souvent désignée sous le nom de SARS-CoV-2 VUI 202012/01 (à l'étude variable, année 2020, mois 12, variante 01), a été montrée pour écarter plus promptement entre les gens, quoiqu'il n'y a aucune association significative avec la gravité de sympt40me ou l'efficacité de vaccin.

En tous cas, les mutations diverses dans la glycoprotéine virale de pointe sont caractéristiques pour cette variante, avec N501Y étant une préoccupation importante car elle concerne un des six résidus d'acide aminé principaux responsables du contact serré entre le domaine SARS-CoV-2 et (RBD) le récepteur cellulaire récepteur-grippants de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2).

En conséquence, un groupe de chercheurs, abouti par M. Simona Fiorentini à partir du service du médicament moléculaire et de translation à l'université de Brescia en Italie, a réalisé l'ordonnancement metagenomic détaillé et les analyses bioinformatic pour jeter un coup d'oeil profond dans les isolats italiens.

Caractérisation génétique détaillée

En novembre 2020, une personne mâle de 59 ans avec une histoire de l'infection SARS-CoV-2 persistante a subi le contrôle moléculaire. Sur la confirmation de laboratoire de l'infection, la caractérisation génétique des virus échantillonnent en novembre ou MB61-Nov (mais également échantillon précédent à partir d'août 2020, connu comme MB61-Aug) a été poursuivi par l'ordonnancement metagenomic.

Deux génomes obtenus complets étaient par la suite avec les génomes viraux intégraux librement procurables sur la plate-forme de GISAID, qui est une source d'ouvert-accès aux caractéristiques génomiques de la grippe et des virus SARS-CoV-2.

Des tensions avec la mutation N501Y dans la pointe RBD, qui ont été récent caractérisés en à l'Italie et au Royaume-Uni comme comporté à la lignée B.1.1.7 apparaissante rapidement, ont été comprises dans l'analyse. En conclusion, le cadrage de séquence et la retouche détaillée ont été également faits pour obtenir l'image entière.

Variantes de N501T actuelles début août

Dans des analyses courtes et bioinformatic dans cette étude a indiqué que l'isolat de MB61-Aug SARS-CoV-2 avait amassé dix modifications acides aminées comparées aux isolats italiens tôt ; de plus, trois plus eus apparu le long de son évolution jusqu'à fin novembre 2020.

Il doit noter que le remplacement de N501T a été trouvé dans des isolats de MB61-Aug et de MB61-Nov SARS-CoV-2, se dirigeant vers la conclusion qu'une mutation au résidu d'acide aminé principal 501 avait déjà étendue en Italie depuis août 2020.

Notre arbre temps-écaillé de maximum de vraisemblance propose que ces variantes de la pointe N501T aient apparu début août en Italie du nord, et pour cette raison les tensions ce SARS-CoV-2 hébergeant un remplacement à la position 501 pourraient avoir diffusé inaperçu même avant fin septembre 2020, quand la lignée B.1.1.7 apparaissante rapidement (transportant la mutation de N501Y) était d'abord rapportée », disent des auteurs d'étude.

Le besoin d'effort de recherche massif

Les découvertes récentes concernant l'évolution SARS-CoV-2, en particulier dans le RBD, justifient un effort scientifique massif afin d'indiquer exactement des variantes nouvelles avec le potentiel de la propagation virale accrue, mais également avec la propension de montrer un comportement évasif à l'immunité de neutralisation infection-dérivée ou vaccin-induite.

Cette étude est une opération vers ce sens, et lui également tension comparée de référence de Wuhan avec les deux variantes MB61. Les variantes ont transporté réellement quatre mutations et une omission dans la glycoprotéine de pointe - deux dont ont été situés dans le RBD.

Néanmoins, des investigations plus complexes et plus prolongées qui rendent nécessaire la collaboration parmi différents organismes de recherche seront nécessaires à l'avenir. À cet égard, le groupe de travail récent déterminé d'évolution de virus d'OMS SARS-CoV-2 est une voie vers la compréhension améliorée de cette édition opportune.

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Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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