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A mutação nova de N501 SARS-CoV-2 pode ter circulado em Itália desde agosto de 2020

Um estudo recente publicado no jornal das doenças infecciosas de The Lancet mostra que o coronavirus transformado da Síndrome Respiratória Aguda Grave 2 tensões (SARS-CoV-2) com uma substituição na posição 501 pôde ter circulado despercebido mesmo antes de fim de setembro de 2020, quando a emergência rápida da linhagem B.1.1.7 (que leva a mutação de N501Y) foi relatada inicialmente.

O 14 de dezembro de 2020, as autoridades do Reino Unido relatado à Organização Mundial de Saúde (WHO) que uma variação nova de SARS-CoV-2, um agente causal de uma pandemia em curso da doença 2019 do coronavirus (COVID-19), estêve identificada com arranjar em seqüência genomic viral.

Esta variação, referida frequentemente como SARS-CoV-2 VUI 202012/01 (variação sob a investigação, o ano 2020, o mês 12, a variação 01), foi mostrada para espalhar mais prontamente entre povos, embora não há nenhuma associação significativa com severidade do sintoma ou eficácia da vacina.

Em todo caso, as mutações múltiplas na glicoproteína viral do ponto são características para esta variação, com o N501Y que é um interesse principal porque envolve um dos seis resíduos chaves do ácido aminado responsáveis para o contacto apertado entre o domínio SARS-CoV-2 receptor-obrigatório (RBD) e a angiotensin-conversão do receptor celular da enzima 2 (ACE2).

Conseqüentemente, um grupo de pesquisadores, conduzido pelo Dr. Simona Fiorentini do departamento da medicina molecular e Translational na universidade de Bríxia em Itália, conduziu arranjar em seqüência metagenomic detalhado e análises bioinformatic para tomar um olhar profundo em isolados italianos.

Caracterização genética detalhada

Em novembro de 2020, um indivíduo masculino dos anos de idade 59 com uma história da infecção SARS-CoV-2 persistente submeteu-se ao teste molecular. Em cima da confirmação do laboratório da infecção, a caracterização genética dos vírus prova em novembro ou MB61-Nov (mas igualmente a amostra precedente desde agosto de 2020, sabido como MB61-Aug) foi levado a cabo arranjar em seqüência metagenomic.

Dois genomas obtidos completos foram comparados subseqüentemente com os genomas virais completos livremente disponíveis na plataforma de GISAID, que é uma fonte do aberto-acesso aos dados genomic da gripe e dos vírus SARS-CoV-2.

As tensões com a mutação N501Y no ponto RBD, que foram caracterizados recentemente em Itália e no Reino Unido como incorporados à linhagem B.1.1.7 rapidamente emergente, foram incluídas na análise. Finalmente, o alinhamento da seqüência e a edição detalhada foram feitos igualmente para obter a imagem completa.

Variações de N501T actuais ao princípio de agosto

Em análises curtos, bioinformatic neste estudo revelou que o isolado de MB61-Aug SARS-CoV-2 tinha acumulado dez mudanças do ácido aminado comparadas aos isolados italianos adiantados; além, três mais tidos aparecido ao longo de sua evolução até o fim de novembro de 2020.

Tem-se que notar que a substituição de N501T estêve encontrada nos isolados de MB61-Aug e de MB61-Nov SARS-CoV-2, apontando para a conclusão que uma mutação no resíduo chave 501 do ácido aminado tem espalhado já em Itália desde agosto de 2020.

Nossa árvore tempo-escalada da probabilidade máxima sugere que estas variações do ponto N501T emerjam ao princípio de agosto em Itália do norte, e conseqüentemente as tensões esse SARS-CoV-2 que abrigam uma substituição na posição 501 puderam ter circulado despercebido mesmo antes de fim de setembro de 2020, quando a linhagem B.1.1.7 ràpida emergente (que leva a mutação de N501Y) foi relatada primeiramente”, dizem autores do estudo.

A necessidade para um esforço de pesquisa maciço

As descobertas recentes em relação à evolução SARS-CoV-2, particularmente dentro do RBD, justificam um esforço científico maciço a fim localizar variações novas com o potencial do espalhamento viral aumentado, mas igualmente com a propensão mostrar uma imunidade de neutralização infecção-derivada ou vacina-induzida evasivo do comportamento.

Este estudo é uma etapa para esse sentido, e igualmente comparou a tensão da referência de Wuhan com ambas as variações MB61. As variações levaram realmente quatro mutações e um supressão na glicoproteína do ponto - dois de que foram situados dentro do RBD.

Todavia, umas investigações mais complexas e mais longas que necessitem a colaboração entre grupos de investigação diferentes serão necessários no futuro. No que respeita, o grupo de trabalho recentemente estabelecido da evolução do vírus do WHO SARS-CoV-2 é uma maneira para a compreensão melhorada desta edição oportuna.

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Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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