Un estudio reciente publicado en gorrón de las enfermedades infecciosas de The Lancet muestra que el coronavirus transformado de la neumonía asiática 2 deformaciones (SARS-CoV-2) con una substitución en la posición 501 pudo haber circulado inadvertido incluso antes de finales de septiembre de 2020, cuando la aparición rápida del linaje B.1.1.7 (que lleva la mutación de N501Y) fue denunciada inicialmente.
El 14 de diciembre de 2020, las autoridades del Reino Unido denunciado a la Organización Mundial de la Salud (WHO) que una nueva variante de SARS-CoV-2, un agente causativo de un pandémico en curso de la enfermedad 2019 del coronavirus (COVID-19), fue determinada con la secuencia genomic viral.
Esta variante, designada a menudo SARS-CoV-2 VUI 202012/01 (variante bajo la investigación, el año 2020, el mes 12, variante 01), fue mostrada para extenderse más fácilmente entre la gente, no obstante no hay asociaciones importantes con severidad del síntoma o eficacia de la vacuna.
En todo caso, las mutaciones multíples en la glicoproteína viral del pico son características para esta variante, con N501Y siendo una preocupación importante pues implica uno de los seis residuos dominantes del aminoácido responsables de contacto apretado entre el dominio receptor-obligatorio SARS-CoV-2 (RBD) y angiotensina-convertir el receptor celular de la enzima 2 (ACE2).
Por lo tanto, un grupo de investigadores, llevado por el Dr. Simona Fiorentini del departamento del remedio molecular y de translación en la universidad de Brescia en Italia, conducto la secuencia metagenomic detallada y análisis bioinformatic para tomar una mirada profunda en aislantes italianos.
Caracterización genética detallada
En noviembre de 2020, un individuo masculino de 59 años con una historia de la infección persistente SARS-CoV-2 experimentó la prueba molecular. Sobre la confirmación del laboratorio de la infección, la caracterización genética de virus muestrea en noviembre o MB61-Nov (pero también la muestra anterior a partir de agosto de 2020, conocido como MB61-Aug) fue perseguido por la secuencia metagenomic.
Dos genomas obtenidos completos fueron comparados posteriormente con los genomas virales integrales libremente disponibles en la plataforma de GISAID, que es una fuente del abierto-acceso a los datos genomic de la gripe y de los virus SARS-CoV-2.
Las deformaciones con la mutación N501Y en el pico RBD, que fueron caracterizados recientemente en Italia y el Reino Unido según lo incorporado al linaje rápidamente emergente B.1.1.7, fueron incluidas en el análisis. Finalmente, la alineación de la serie y el corregir detallado también fueron hechos para obtener el retrato completo.
Variantes de N501T presentes a principios de agosto
En fin, los análisis bioinformatic en este estudio revelaron que el aislante de MB61-Aug SARS-CoV-2 había amontonado diez cambios del aminoácido comparados a los aislantes italianos tempranos; además, tres tenidos aparecido a lo largo de su evolución hasta finales de noviembre de 2020.
Tiene que ser observado que la substitución de N501T fue encontrada en los aislantes de MB61-Aug y de MB61-Nov SARS-CoV-2, apuntando hacia la conclusión que una mutación en el residuo dominante 501 del aminoácido ha estado extendiendo ya en Italia desde agosto de 2020.
Nuestro árbol tiempo-escalado de la toda probabilidad sugiere que estas variantes del pico N501T emergieron a principios de agosto en Italia septentrional, y por lo tanto las deformaciones ese SARS-CoV-2 que abrigaban una substitución en la posición 501 pudieron haber circulado inadvertido incluso, cuando el linaje rápidamente emergente B.1.1.7 (que lleva la mutación de N501Y) primero fue denunciado”, dicen antes de finales de septiembre de 2020 a autores del estudio.
La necesidad de un esfuerzo de investigación masivo
Los descubrimientos recientes con respecto a la evolución SARS-CoV-2, determinado dentro del RBD, autorizan un esfuerzo científico masivo para establecer claramente variantes nuevas con el potencial de extenderse viral creciente, pero también con la propensión a mostrar una inmunidad de neutralización infección-derivada o vacuna-inducida evasiva del comportamiento.
Este estudio es un paso hacia esa dirección, y también comparó la deformación de la referencia de Wuhan con ambas variantes MB61. Las variantes llevaron real cuatro mutaciones y una supresión en la glicoproteína del pico - dos cuyo fueron situados dentro del RBD.
No obstante, investigaciones más complejas y más muy largas que necesitan la colaboración entre diversos grupos de investigación serán necesitadas en el futuro. A este respecto, el grupo de trabajo recientemente establecido de la evolución del virus del WHO SARS-CoV-2 es una manera hacia la comprensión perfeccionada de esta entrega oportuna.
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