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Les chercheurs tracent les altérations génétiques qui ont pu avoir facilité le saut de SARS-CoV-2 de "bat" aux êtres humains

La pandémie de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19) continue à ravager le globe. Jusqu'à présent, plus de 91,62 millions de cas et plus de 1,96 millions de morts ont été mondial rapporté.

Le coronavirus 2 (SARS-CoV-2), le virus de syndrôme respiratoire aigu sévère qui entraîne COVID-19, est couramment vraisemblablement une maladie zoonotique qui a provenu de "bat" et alors par la suite sauté aux êtres humains. Ceci est pensé pour s'être produit par l'intermédiaire d'un hôte intermédiaire jusqu'à présent non identifié qui a pu avoir porté le virus à la ville de Wuhan, Chine, où l'agent pathogène a été la première fois trouvé en décembre 2019.

Maintenant, une étude neuve par les chercheurs basés à l'université de Cambridge et l'institut de Pirbright au R-U a recensé les altérations génétiques principales dans SARS-CoV-2 qui peut être responsable du virus sautent de "bat" aux êtres humains. L'équipe a également déterminé quels animaux contiennent les récepteurs cellulaires qui permettent au virus de présenter des cellules plus effectivement, répartissant en zones dedans sur les animaux potentiels qui ont agi en tant qu'hôte intermédiaire en facilitant la zoonose de SARS-CoV-2.

La pandémie de coronavirus

SARS-CoV-2 a apparu la première fois fin 2019 en Chine, et a depuis l'écart à 191 pays et territoires. Jusqu'à présent, il a entraîné plus de 91,71 millions de cas et 1,96 millions de morts.

Coronaviruses diffusent couramment parmi la substance de "bat", et SARS-CoV-2 - un agent pathogène d'ARN de positif-boucle de la famille de betacoronavirus - est également pensé pour avoir provenu de la substance de Chiroptera en Chine. Cependant, si le virus a directement sauté aux êtres humains ou par un hôte intermédiaire est encore peu clair. Cependant, on l'a déterminé que le virus peut infecter des animaux, des animaux familiers, la faune, et le bétail d'accouplement.

Les variantes neuves du virus diffusent en travers du globe, menant aux ondes successives des infections. Beaucoup de gouvernements dans particulièrement les pays gravement atteints - tels que le R-U, où une tension neuve hautement infectieuse a été recensée - ont réimposé des interdictions de course, des restrictions, et des commandes de lockdown pour essayer et contenir l'écart du virus.

"bat" aux êtres humains

L'étude, publiée dans la biologie du tourillon PLOS, a employé une combinaison des analyses de remplacement d'entrée et du virus sous tension pour expliquer qu'hormis l'enzyme de conversion de l'angiotensine humaine 2 (ACE2), la glycoprotéine de pointe de SARS-CoV-2 (également connu sous le nom de la protéine de pointe ou protéine de S) a un large éventail de tropisms d'hôte pour les récepteurs ACE2 mammifères. C'est en dépit de divergence dans les acides aminés à l'accepteur du récepteur de la protéine de pointe.

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L'examen critique de récepteur utilisant des analyses de remplacement d'entrée recense la pointe SARS-CoV-2 comme protéine virale de pièce d'assemblage de carter-tropique. (a) Un heatmap illustrant le profil d'usage de récepteur de SARS-CoV-2 et de Radars à ouverture synthétique-CoV dans des analyses de fusion d'entrée et de cellule-cellule de pseudotype avec mammifère varié et l'oiseau ACE2s. Les caractéristiques dans chaque rangée sont normalisées au signe vu pour ACE2 humain (premier), avec des résultats représentant le moyen pourcentage prévu à partir de 3 expériences indépendantes effectuées différents jours. Un contrôle réservé au vecteur (pDISPLAY) a été ajouté pour expliquer la spécificité. Mammifère et l'oiseau ACE2s sont dispensés, de haut en bas, basé sur leur relation phylogénétique (le cladogram rectangulaire, est parti). L'erreur standard inter-expérimentale du moyen pour les analyses de fusion de pseudotype et de cellule-cellule s'est échelonnée de 0,01% à 47,92% (médiane 10,73%) et 0,12% à 32,97% (médiane 5,43%), respectivement. (B et C) pour SARS-CoV-2 et Radars à ouverture synthétique-CoV, la cellule-cellule respective et des pourcentages d'analyse de pseudotype pour chaque protéine ACE2 (relativement à ACE2 humain) ont été tracés sur un graphe par nuage de points DE X/Y, la corrélation de Pearson prévue et une ligne linéaire de régression adaptée avec des intervalles de confiance de 95%. Les caractéristiques étant à la base de ce chiffre peuvent être trouvées dans les caractéristiques S1. ACE2, enzyme de conversion de l'angiotensine 2 ; Radars à ouverture synthétique-CoV, coronavirus de radar à ouverture synthétique ; SARS-CoV-2, coronavirus 2. de radar à ouverture synthétique.

De plus, ils ont constaté que les adaptations génétiques recensées étaient assimilées à ceux ont effectué par le coronavirus de syndrôme respiratoire aigu sévère (Radars à ouverture synthétique-CoV), qui a entraîné la manifestation 2002-2003 (SARS) de syndrôme respiratoire aigu sévère. Les découvertes d'étude proposent qu'il puisse y a un mécanisme courant par lequel les coronaviruses subissent une mutation pour qu'ils sautent des hôtes animaux aux êtres humains.

Avec des parents de SARS-CoV-2 - Radars à ouverture synthétique-CoV et le coronavirus respiratoire de syndrome de Moyen-Orient (MERS-CoV), qui ont apparu en Arabie Saoudite en 2012 - le réservoir animal est vraisemblablement "bat". On a soupçonné le débordement viral dans des êtres humains et les scientifiques croient que ceci s'est produit par l'intermédiaire d'un hôte intermédiaire dans les deux cas. Les Radars à ouverture synthétique-CoV est pensés pour venir des chivets et de MERS-CoV des chameaux.

De Coronaviruses l'utilisation type leurs protéines de pointe de présenter des cellules en grippant avec des récepteurs de surface de cellule humaine aiment l'ACE2. Ces accepteurs agissent comme un blocage et introduisent, où la protéine de pointe doit être la bonne forme à s'insérer dans les récepteurs et pour faciliter l'entrée virale. Cependant, les espèces différentes expriment des récepteurs avec des formes variables, ainsi il signifie que les protéines de la pointe du virus peuvent gripper avec les récepteurs plus fortement chez certains animaux que d'autres.

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L'accepteur SARS-CoV-2 sur ACE2 est hautement variable. (a) Un arbre phylogénétique des protéines ACE2 assemblées suivre la méthode de voisin-jointure [51] conduite dans MEGA7 (Temple University, Etats-Unis) [52] des positions ambiguës étant coupées. L'arbre est entraîné à l'écaille, et le support a été équipé de 500 amorces. (b) Structure de l'ectodomain ACE2 humain (vert) dans le composé avec le RBD de SARS-CoV-2 [10]. (c) Conservation des résidus d'acide aminé ACE2 mammifères, prévue à partir des régimes évolutionnaires de site-détail [50], tracée sur la surface de l'ectodomain ACE2 [10], et colorée de bleu (divergent) au pourpre (économisé) et présentée dans 2 orientations. La vignette dépeint la région SARS-CoV-2 obligatoire d'ACE2 (donné), avec les résidus qui entrent en contact avec le SARS-CoV-2 RBD mis en valeur [6]. (d) WebLogo (Université de Californie, Berkeley, Etats-Unis) [53] trace récapituler la divergence acide aminée dans les séquences mammifères et de l'oiseau ACE2 caractérisées dans cette étude. L'indicatif acide aminé de lettre (aa) unique est employé avec la hauteur verticale de l'acide aminé.

Le recensement du réservoir animal de SARS-CoV-2 et de tous les hôtes intermédiaires peut aider à fournir des analyses dans la façon dont, où, et quand le virus a apparu et éventuellement a été réussi en circuit aux êtres humains. Il peut également aviser le développement des mesures préventives de s'assurer que cette forme de la zoonose ne se reproduit pas.

Virus RaTG13

Dans la manifestation de radar à ouverture synthétique, les scientifiques ont recensé les isolats étroitement liés dans les deux "bat" et civettes, où le virus est pensé pour avoir apparu. Dans la manifestation actuelle, cependant, d'autres études sont encore nécessitées pour déterminer la source exacte de virus et hôte intermédiaire.

Le virus SARS-CoV-2 a la séquence d'un coronavirus relatif de "bat" connu sous le nom de RaTG13, qui partage 96 pour cent de similitude au génome de SARS-CoV-2.

Pour évaluer si les différences entre SARS-CoV-2 et RaTG13 étaient impliquées dans l'adaptation du virus aux êtres humains, les chercheurs ont permuté les régions et observents à quel point les protéines de pointe liées avec les récepteurs ACE2 humains.

Les découvertes d'étude ont prouvé que les protéines de pointe de SARS-CoV-2 qui contient les régions RaTG13 ne pourraient pas gripper aux récepteurs ACE2 humains effectivement. D'autre part, les pointes RaTG13 contenant les régions SARS-CoV-2 ont pu gripper plus effectivement aux récepteurs humains. Les découvertes ont prouvé que les changements assimilés de la protéine de pointe se sont produits historiquement, qui a pu avoir joué un rôle essentiel dans le débordement viral.

Infection animale

Indépendamment des découvertes d'étude, les chercheurs ont également constaté que le crabot, les bétail, et les récepteurs du chat ACE2 ont les interactors les plus intenses avec la protéine de la pointe SARS-CoV-2. Ceci signifie que ces animaux sont à un plus gros risque d'être infectés avec SARS-CoV-2.

Comme nous avons vu avec les manifestations dans le vison danois cultive l'année dernière, il est essentiel de comprendre quels animaux peuvent être infectés par SARS-CoV-2 et comment les mutations dans la protéine virale de pointe changent sa capacité d'infecter des espèces différentes, »

M. Stephen Graham à l'université du Service de Pathologie de Cambridge

Cependant, davantage de recherche est nécessaire pour déterminer si ces animaux peuvent acquérir l'infection et s'ils pourraient agir en tant que réservoirs animaux.

Journal reference:
Angela Betsaida B. Laguipo

Written by

Angela Betsaida B. Laguipo

Angela is a nurse by profession and a writer by heart. She graduated with honors (Cum Laude) for her Bachelor of Nursing degree at the University of Baguio, Philippines. She is currently completing her Master's Degree where she specialized in Maternal and Child Nursing and worked as a clinical instructor and educator in the School of Nursing at the University of Baguio.

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