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Rejet prolongé et mutations multiples 154 jours après le diagnostic SARS-CoV-2 initial rapporté

Beaucoup de cas ont été rapportés dans quelles personnes d'immunodéprimé infectées avec le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère ayez prolongé pour jeter le virus pour bien plus longtemps que la durée typique. Un prétirage neuf publié sur le serveur de medRxiv* décrit un patient immunodéprimé présentant la maladie 2019 (COVID-19) de coronavirus qui prolongé pour jeter le virus pour des 154 jours stupéfiants. Au cours de cette période, le virus a subi de nombreuses mutations.

Étude : Émergence des mutations SARS-CoV-2 multiples dans un hôte d
Étude : Émergence des mutations SARS-CoV-2 multiples dans un hôte d'immunodéprimé. Crédit d'image : NIAID

Après presque une année de COVID-19, le virus a apparu comme variante neuve, maintenant appelée la variante britannique. On le pense que cette variante peut avoir un pouvoir infectant plus élevé et ainsi un transmissibility plus grand. L'ordonnancement de cette variante, qui s'est produite presque immédiatement, a permis une recherche plus en profondeur dans la façon dont les mutations ont affecté la structure des protéines virales variées et les causes déterminantes moléculaires de la transmission de la maladie. On le pense que la diversité génétique surgit dans un hôte si le virus n'est pas sujet à la pression de choix par la réaction immunitaire d'hôte ou par les anticorps thérapeutiques.

L'étude actuelle décrit un tel patient. La personne était infectée pendant plus de 134 jours et est éventuellement morte de la maladie. Au cours de la maladie, un virus reproduisant était présent dans les voies respiratoires. Le virus a également subi un certain nombre de mutations, comparées à deux autres patients qui ont eu des comptages cellulaires inférieurs de B et la plupart des autres gens avec l'infection SARS-CoV-2.

La patiente était une femme dans ses années '70 qui sont entrées dans l'hôpital avec la maladie COVID-19, et syndrome de détresse respiratoire aigu (ARDS). Les sympt40mes avaient été présents et empirants pour pendant deux semaines avant qu'il a été admis. Il a été mis sur l'oxygène de haut-flux et la ventilation artificielle postérieure. Il est resté dans l'unité de soins intensifs jusqu'à ce qu'il soit mort, cinq mois après admission.

Le patient a eu une histoire de lymphome folliculaire et avait reçu trois cycles de chimiothérapie, ainsi que l'obinituzumab de l'anticorps anti-CD20, qui épuise des cellules de B. Cette demande de règlement a été arrêtée juste pendant un mois avant qu'il s'est présenté à l'hôpital. Le patient a été soigné avec des stéroïdes et le plasma convalescent (CP), mais pas avec le remdesivir parce qu'il a également eu l'insuffisance rénale.

Les échantillons provenant du supérieur clinique et des voies respiratoires inférieures contenus vivent reproduisant le virus, avec des valeurs de seuil basses de cycle (Ct) sur la réaction en chaîne inverse de transcriptase-polymérase (ACP de droite), et les charges virales élevées, jusqu'à ce qu'il soit mort le jour 156 du diagnostic. Le premier échantillon rassemblé avait lieu le jour 20, qui le jour de condition de chercheurs 0.

La séquence de génome de ce patient, ainsi que deux autres patients de lymphome présentant l'épuisement de cellules de B étant traité dans le même élément en même temps, dont chacun d'eux ont eu COVID-19 sévère sur une longue période, et ARDS également développé. Les derniers deux patients récupérés complet.

Les cinq mutations qui ont défini la tension de ce patient comprennent D614G, 3037, 14408, et 241, avec l'omission à la position 28881 de l'antigène de nucleocapsid. D'autres seules mutations trouvées dans ce patient comprennent un vu seulement dans les sud de l'Allemagne entre le 16 mars et du 11 mai 2020. En revanche, les deux autres patients ont seulement eu le virus reproduisant pendant trois semaines, tout au plus, avec seulement un ou deux mutations en 19 jours. C'est en accord avec le nombre prévu de mutations dans ce virus. En fait, le patient d'index a également eu un numéro assimilé des mutations pour les 21 premiers jours.

La similitude dans le nombre et la configuration de mutations indique que chacun des trois patients était infecté de la même source. Les mutations détectables ont plongé par le jour 30, après deux doses de CP, mais cinq mutations neuves ont été déterminées à ce moment et persistées jusqu'au jour 134. Ainsi, encore 11 mutations se sont produites.

Le patient actuel a développé 16 mutations. Type, les virus SARS-CoV-2 montrent 1-2 mutations par mois ou environ 24.000 mutations selon le génome par an. Pendant les 134 jours, les échantillons génomiques viraux du patient se sont analysés, le nombre prévu de mutations serait 8,6, mais au lieu, il y avait un numéro exceptionnel des mutations nonsynonymous, plus de trois fois le nombre de mutations synonymes.

Le patient n'a jamais développé n'importe quelle réaction détectable d'anticorps spécifique au virus, et les mutations ont suivi l'utilisation du CP.

Ces découvertes ont abouti les chercheurs à commenter, « l'efficacité thérapeutique du plasma convalescent jusqu'ici a été décevante. Son utilisation devrait être en critique évaluée dans les patients présentant la réplication virale prolongée. »

C'est important du fait la pression externe des anticorps spécifiques pilote le choix dans une grande population virale chez un patient immunodéprimé jusqu'à un degré inconnu. Ceci a pu mener à l'émergence des mutations d'évasion et des variantes virales au fil du temps, le rendant plus difficile de régler la demande de règlement et l'endiguement du virus.

Les chercheurs spéculent également que les mutations dans la variante neuve B1.1.7 ont pu avoir surgi dans un patient assimilé continuel infecté. Une telle lumière de maneton d'études sur la capacité de tracer le cours de l'adaptation virale pendant l'infection chronique afin d'aider à comprendre comment les facteurs d'hôte influencent le génome viral. Ce serait important en développant les agents préventifs et thérapeutiques.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

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Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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