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Spargimento prolungato e mutazioni multiple 154 giorni dopo la diagnosi iniziale SARS-CoV-2 riferita

Molti casi sono stati riferiti in cui immunocompromised le persone infettate con il coronavirus 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo hanno continuato a spargere il virus per ben più lungamente della durata tipica. Una nuova pubblicazione preliminare pubblicata sul " server " del medRxiv* descrive un paziente immunosuppressed con la malattia 2019 (COVID-19) di coronavirus chi ha continuato a spargere il virus per i 154 giorni sbalordenti. Durante questo periodo, il virus ha subito le numerose mutazioni.

Studio: Emergenza delle mutazioni multiple SARS-CoV-2 in un host immunocompromised. Credito di immagine: NIAID
Studio: Emergenza delle mutazioni multiple SARS-CoV-2 in un host immunocompromised. Credito di immagine: NIAID

Dopo quasi un anno di COVID-19, il virus è emerso come nuova variante, ora chiamata la variante britannica. È pensato che questa variante possa avere il più alta infettività e così maggior transmissibility. L'ordinamento di questa variante, che ha accaduto quasi immediatamente, ha permesso la ricerca più approfondita su come le mutazioni hanno pregiudicato la struttura di varie proteine virali ed i fattori determinanti molecolari della trasmissione di malattia. È pensato che la diversità genetica sorga all'interno di un host se il virus non è conforme a pressione di selezione dalla risposta immunitaria ospite o dagli anticorpi terapeutici.

Lo studio corrente descrive un tale paziente. La persona è stata infettata per i più di 134 giorni e finalmente è morto della malattia. Attraverso il corso della malattia, un virus di replica era presente nelle vie respiratorie. Il virus egualmente ha subito una serie di mutazioni, ha confrontato altri a due pazienti che hanno avuti i conteggi di linfocita B bassi e maggior parte di altra gente con l'infezione SARS-CoV-2.

Il paziente era una donna nei suoi anni settanta che hanno entrato nell'ospedale con la malattia COVID-19 e nella sindrome di emergenza respiratoria acuta (ARDS). I sintomi erano stati presenti e peggioranti per due settimane prima che fosse ammessa. È stata messa sull'ossigeno di alto-flusso e sulla ventilazione meccanica successiva. È rimanere nell'unità di cure intensive finché non morisse, cinque mesi dopo l'ammissione.

Il paziente ha avuto una cronologia di linfoma follicolare ed aveva ricevuto tre cicli della chemioterapia come pure il obinituzumab dell'anticorpo anti-CD20, che vuota i linfociti B. Questo trattamento è stato interrotto appena un mese prima che presentasse all'ospedale. Il paziente è stato curato con gli steroidi ed il plasma convalescente (CP), ma non con remdesivir perché egualmente ha avuta insufficienza renale.

I campioni dalle vie respiratorie superiori e più basse cliniche contenute vivono ripiegando il virus, con i valori di soglia bassi (Ct) del ciclo su reazione a catena della transcriptase-polimerasi inversa (PCR di RT) e gli alti caricamenti virali, finché non sia morto il giorno 156 dalla diagnosi. Il primo campione raccolto aveva luogo il giorno 20, che la scadenza 0 dei ricercatori.

La sequenza del genoma da questo paziente come pure altri due pazienti di linfoma con svuotamento del linfocita B che è trattato nella stessa unità allo stesso tempo, entrambi i quali hanno avuti COVID-19 severo su un lungo periodo e ARDS anche sviluppato. I due pazienti posteriori recuperati completamente.

Le cinque mutazioni che hanno definito la razza di questo paziente includono D614G, 3037, 14408 e 241, con eliminazione alla posizione 28881 dell'antigene del nucleocapsid. Altre mutazioni uniche trovate in questo paziente includono uno veduto soltanto nel sud della Germania fra il 16 marzo e l'11 maggio 2020. Al contrario, gli altri due pazienti hanno avuti soltanto il virus di replica per tre settimane, al massimo, con soltanto una o due mutazione in 19 giorni. Ciò è in accordo con il numero previsto delle mutazioni in questo virus. Infatti, il paziente di indice analitico egualmente ha avuto un simile numero delle mutazioni per il primi 21 giorno.

La similarità nel numero e nel reticolo delle mutazioni indica che tutti e tre i pazienti sono stati infettati dalla stessa sorgente. Le mutazioni rilevabili hanno immerso di giorno 30, dopo due dosi del CP, ma cinque nuove mutazioni sono state stabilite attualmente e sono state persistite fino al giorno 134. Quindi, altre 11 mutazione ha accaduto.

Il paziente corrente ha sviluppato 16 mutazioni. Tipicamente, i virus SARS-CoV-2 mostrano 1-2 mutazioni un il mese o circa 24.000 mutazioni per genoma all'anno. Nei 134 giorni, i campioni genomica virali del paziente sono stati analizzati, il numero previsto delle mutazioni sarebbe 8,6, ma invece, c'era un numero insolito delle mutazioni nonsynonymous, più di tre volte il numero delle mutazioni sinonime.

Il paziente non ha sviluppato mai alcuna risposta specifica rilevabile dell'anticorpo al virus e le mutazioni hanno seguito l'uso del CP.

Questi risultati piombo i ricercatori commentare, “l'efficacia terapeutica di plasma convalescente finora è stato deludenti. Il suo uso dovrebbe essere valutato criticamente in pazienti con la replicazione virale prolungata.„

Ciò è importante in quella pressione esterna dalla selezione specifica delle unità degli anticorpi in una grande popolazione virale presso un paziente immunosuppressed in misura sconosciuta. Ciò ha potuto piombo col passare del tempo all'emergenza delle mutazioni di fuga e delle varianti virali, rendente la più difficile gestire il trattamento ed il contenimento del virus.

I ricercatori egualmente speculano che le mutazioni nella nuova variante B1.1.7 possono sorgere in un paziente similmente cronicamente infettato. Tali studi fanno luce sulla capacità di rintracciare il corso di adattamento virale durante l'infezione cronica per contribuire a capire come i fattori ospite influenzano il genoma virale. Ciò sarebbe importante nello sviluppare sia gli agenti preventivi che terapeutici.

Avviso *Important

il medRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

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Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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