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Derramamento prolongado e mutações múltiplas 154 dias após o diagnóstico SARS-CoV-2 inicial relatado

Muitos casos foram relatados em que immunocompromised os indivíduos contaminados com o coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) continuaram a derramar o vírus para distante mais por muito tempo do que a duração típica. Uma pré-impressão nova publicada no server do medRxiv* descreve um paciente immunosuppressed com doença 2019 do coronavirus (COVID-19) quem continuou a derramar o vírus para 154 dias de surpresa. Durante este período, o vírus submeteu-se a mutações numerosas.

Estudo: Emergência das mutações SARS-CoV-2 múltiplas em um anfitrião immunocompromised. Crédito de imagem: NIAID
Estudo: Emergência das mutações SARS-CoV-2 múltiplas em um anfitrião immunocompromised. Crédito de imagem: NIAID

Após quase um ano de COVID-19, o vírus emergiu como uma variação nova, chamada agora a variação britânica. Pensa-se que esta variação pode ter uma infectividade mais alta e assim o maior transmissibility. Arranjar em seqüência desta variação, que ocorreu quase imediatamente, permitiu uma pesquisa mais detalhada em como as mutações afectaram a estrutura de várias proteínas virais e as causas determinantes moleculars da transmissão da doença. Pensa-se que a diversidade genética elevara dentro de um anfitrião se o vírus não é sujeito à pressão da selecção pela resposta imune do anfitrião ou por anticorpos terapêuticos.

O estudo actual descreve um tal paciente. O indivíduo foi contaminado por mais de 134 dias e morreu eventualmente da doença. No decorrer da doença, um vírus replicating estou presente nas vias respiratórias. O vírus igualmente submeteu-se a um número de mutações, comparou outros a dois pacientes que tiveram baixas contagens de pilha de B e a maioria outros de povos com infecção SARS-CoV-2.

O paciente era uma mulher em seus anos setenta que entraram no hospital com doença COVID-19, e na síndrome de aflição respiratória aguda (ARDS). Os sintomas estaram presente e agravando-se para duas semanas antes que estêve admitida. Foi posta sobre o oxigênio do alto-fluxo e uma ventilação mecânica mais atrasada. Permaneceu na unidade de cuidados intensivos até que morreu, cinco meses após a admissão.

O paciente teve uma história do linfoma folicular e tinha recebido três ciclos da quimioterapia, assim como o obinituzumab do anticorpo anti-CD20, que esgota pilhas de B. Este tratamento foi parado apenas um mês antes que apresentou no hospital. O paciente foi tratado com os esteróides e o plasma convalescente (CP), mas não com o remdesivir porque igualmente teve a insuficiência renal.

As amostras das vias respiratórias superiores e mais baixas clínicas contidas viveram replicating o vírus, com os baixos valores de ponto inicial (Ct) do ciclo na reacção em cadeia reversa da transcriptase-polimerase (PCR do RT), e cargas virais altas, até que morreu no dia 156 do diagnóstico. A primeira amostra recolhida realizava-se no dia 20, que o dia de termo 0 dos pesquisadores.

A seqüência do genoma deste paciente, assim como outros dois pacientes do linfoma com a prostração da pilha de B que está sendo tratada na mesma unidade ao mesmo tempo, de quem teve COVID-19 severo durante um longo período, e em ARDS igualmente desenvolvido. Os últimos dois pacientes recuperados completamente.

As cinco mutações que definiram a tensão deste paciente incluem D614G, 3037, 14408, e 241, junto com o supressão na posição 28881 do antígeno do nucleocapsid. Outras mutações originais encontradas neste paciente incluem um considerado somente no sul de Alemanha entre o 16 de março e o 11 de maio de 2020. Ao contrário, outros dois pacientes tiveram somente o vírus replicating por três semanas, no máximo, com somente uma ou dois mutações em 19 dias. Isto é de acordo com o número previsto de mutações neste vírus. De facto, o paciente do deslocamento predeterminado igualmente teve um número similar de mutações para os primeiros 21 dias.

A similaridade no número e no teste padrão das mutações indica que todos os três pacientes estiveram contaminados da mesma fonte. As mutações detectáveis mergulharam no dia 30, após duas doses do PC, mas cinco mutações novas foram estabelecidas neste tempo e persistidas até o dia 134. Assim, outras 11 mutações ocorreram.

O paciente actual desenvolveu 16 mutações. Tipicamente, os vírus SARS-CoV-2 mostram 1-2 mutações um o mês ou aproximadamente 24.000 mutações pelo genoma pelo ano. Nos 134 dias, as amostras genomic virais do paciente foram analisadas, o número previsto de mutações seria 8,6, mas pelo contrário, havia um número incomum de mutações nonsynonymous, mais de três vezes o número de mutações sinónimas.

O paciente nunca desenvolveu toda a resposta específica detectável do anticorpo ao vírus, e as mutações seguiram o uso do PC.

Estes resultados conduziram os pesquisadores comentar, “a eficácia terapêutica do plasma convalescente têm sido até agora decepcionantes. Seu uso deve crìtica ser avaliado nos pacientes com réplica viral prolongada.”

Isto é importante que a pressão externo dos anticorpos específicos conduz a selecção em uma grande população viral dentro de um paciente immunosuppressed a uma extensão desconhecida. Isto podia conduzir à emergência de mutações do escape e de variações virais ao longo do tempo, fazendo o mais difícil controlar o tratamento e a retenção do vírus.

Os pesquisadores igualmente especulam que as mutações na variação nova B1.1.7 podem ter elevarado em um paciente similarmente crônica contaminado. Tal luz do lance dos estudos na capacidade para seguir o curso da adaptação viral durante a infecção crônica a fim ajudar a compreender como os factores do anfitrião influenciam o genoma viral. Isto seria importante em desenvolver agentes preventivos e terapêuticos.

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

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Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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