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Les scientifiques expliquent comment les remarques de colle et l'information de cadrage de séquence peuvent marquer des variantes du résidu SARS-CoV-2

La pandémie de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19) a ravagé le globe pour plus qu'une année, avec une émergence croissante des variantes neuves de la préoccupation qui restent pour miner des mesures actuelles visées contrôlant sa propagation. Les systèmes de santé de beaucoup de pays luttent pour satisfaire aux cas de battement provoqués par des variantes neuves avec le transmissibility intensifié observé du coronavirus 2 (SARS-CoV-2), le virus de syndrôme respiratoire aigu sévère qui entraîne COVID-19.

La surveillance des variantes dans SARS-CoV-2 représente un défi considérable dans la crise de santé globale actuelle, ainsi que de futures manifestations virales potentielles. Particulièrement, les mutations et les omissions en protéine de pointe de SARS-CoV-2 ont un impact important sur des vaccins et les médicaments qui prennent visent cette protéine virale structurelle principale pour refouler la pandémie.

Maintenant, les chercheurs aux États-Unis - à l'université de Commonwealth de la Virginie, à l'université du Minnesota, et au centre de recherche de la NASA Ames - ont expliqué comment les mappages d'horizontal ou les remarques énergétiques dominants de colle, avec l'information de cadrage de séquence peuvent potentiellement recenser les mutations principales de résidu et les omissions de protéine de pointe attachées avec des variantes apparaissantes.

Mutations SARS-CoV-2

Puisque SARS-CoV-2 a apparu la première fois dans la ville de Wuhan, province de Hubei, Chine, en décembre 2019, il a montré des débits de transmission élevés en travers du globe. Jusqu'à présent, le virus s'est écarté à 192 pays et régions, entraînant plus de 107,48 millions de cas et 2,35 millions de morts.

Une des préoccupations actuelles au sujet de la pandémie est que le virus continue à subir une mutation. Les variantes qui ont l'exposition apparue ont augmenté le transmissibility et les taux d'infection, par conséquent, lance des défis aux vaccins actuels et se développants. On a estimé que le taux de mutation de SARS-CoV-2 est des remplacements du ∼ 10−3 selon le site par an.

Dans le passé, la mutation la plus populaire de SARS-CoV-2 est la mutation D614G de protéine de pointe, qui a été liée à des charges virales plus élevées de voies respiratoires supérieures. La mutation est considérée omniprésente dans des séquences génomique récentes mondiales.  De plus, un autre appelé variable la variante BRITANNIQUE ou COV 202012/01 ou B.1.1.7 a été recensé au cours des mois antérieurs. La variante est plus contagieuse, et elle a des omissions et des mutations dans la protéine de pointe (D1614G y compris).

Il est essentiel de déterminer comment les variantes actuelles et futures pilotent des débits de transmission modifiés, des différences virales de charge, l'anticorps et l'évasion vaccinique, et résistance aux médicaments développés pour SARS-CoV-2.

L'étude

Dans l'étude, qui est apparue sur le serveur de medRxiv* de prétirage, l'équipe s'est concentrée sur analyser des mutations de la protéine de pointe, comme guide partiel des effets potentiels de ses mutations sur le fonctionnement viral, la structure, et les changements de comportement possibles.

L'équipe a également trouvé l'excellente homologie des remarques stabilisantes de colle de résidu en protéines de pointe de coronavirus, qui étaient les remarques homologues de colle de séquence appelée. De façon générale, ceux-ci ont marqué des mutations de résidu ou des omissions ont été évaluées utilisant la dynamique moléculaire de biocomputational de tout-atome plus d'environ pendant une micro-seconde pour s'assurer que les changements structurels et énergétiques de la protéine de pointe a joint des variantes.

En outre, l'équipe a particulièrement étudié le mutant SARS-CoV-2 triple basé sur théorique et le R-U ou la variante le B.1.1.7. Ils analysent de calcul la structure et le t attaché par mutations principales piloté dynamique le bas contre les conditions hautes de protomer du virus, qui est le mutant triple qui peut affaiblir des interactions récepteur-grippantes voisines du domaine de N-terminal de domaine (RBD-NTD).

De plus, les chercheurs ont largement examiné la mutation BRITANNIQUE variable et de D614G pour déterminer les différences principales dans les configurations de protomer, qui pourraient affecter l'efficacité des vaccins et des médicaments pour combattre la pandémie.

Suivre la même méthode, l'équipe a également analysé la variante du Royaume-Uni pour déterminer les mutations ou les omissions principales en sa protéine de pointe, qui pourrait être responsable de la variante étant plus transmissible.

Les découvertes de l'équipe ont mené à deux mutations principales, au D614G et au N501Y. Modifications validées par calculs biophysiques attachées aux D614G qui l'effectuent à plus de condition accessible de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2). En attendant, le N501Y a un associé potentiel 41Y de remarque de colle de l'être humain ACE2, qui peut mener à une interaction intense de paires de résidu. Ceci peut expliquer pourquoi il y a un taux d'infection plus élevé du R-U B.1.1.7 et les variantes du Sud africain B.1.351.

L'équipe a conclu que ces deux mutations principales peuvent amplifier la boîte de vitesses et les taux d'infection de deux voies différentes. Cependant, l'équipe a mis l'accent sur que d'autres études sont nécessaires pour mesurer cette caractéristique et ses conséquences.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Angela Betsaida B. Laguipo

Written by

Angela Betsaida B. Laguipo

Angela is a nurse by profession and a writer by heart. She graduated with honors (Cum Laude) for her Bachelor of Nursing degree at the University of Baguio, Philippines. She is currently completing her Master's Degree where she specialized in Maternal and Child Nursing and worked as a clinical instructor and educator in the School of Nursing at the University of Baguio.

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