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L'outil neuf active l'étude du spectre du mutant SARS-CoV-2 par ultrasequencing

Le génome SARS-CoV-2 est trois fois plus grand que le génome de grippe. Les deux se composent des molécules de NRA qui subissent une mutation quand réplique. Il est essentiel de connaître son spectre de mutant, en d'autres termes, son « relève les empreintes digitales », pour réaliser un traitement adapté qui réduit son pouvoir infectant - la capacité d'agents pathogènes d'envahir des organismes et d'entraîner des infections, puisque sa composition des variantes pourrait déterminer comment l'infection se développerait dans chaque patient.

Les chercheurs de l'université de Malaga (UMA) pourront examiner la profondeur de ces spectres par grâce ultrasequencing génétique de techniques au système novateur qu'ils ont conçu : « QuasiFlow », un outil qui active l'analyse des variantes actuelles dans chaque patient individuellement.

Nous sommes intéressés à parvenir à un accord profond de la variabilité génétique du virus pour découvrir la meilleure voie d'attaquer, son point faible. »

Professeur Ana Grande, service de biologie cellulaire, de génétique et de physiologie, UMA

Professeur Ana Grande aboutira une étude l'année prochaine, financé par le gouvernement de l'Andalousie, pour intensifier la recherche dans des traitements rapides neufs de mise en place pour COVID-19.

Traitement antiviral neuf

En particulier, ce chercheur de l'UMA combinera une équipe multidisciplinaire des scientifiques qui vérifieront un traitement antiviral neuf de combinaison, qui combine la soi-disant stratégie de mutagénèse dirigée et inhibiteurs mortels de la correction sur épreuves d'Exon et des activités de MTase des coronavirus, afin d'empêcher le virus d'éluder la réaction immunitaire innée.

« L'idée est d'augmenter la capacité de mutation du virus de le tourner contre le virus, modifient son spectre de mutant de sorte qu'elle détruise son pouvoir infectant », dit Ana grande, qui affirme qu'il a déjà réalisé ceci sur d'autres virus ARN, tels que l'arénavirus lymphocytique de choriomeningitis ou le virus Hépatite C, en appliquant le nucléoside ou les analogues de base, assimilé aux pièces fondamentales dont des génomes se composent.

L'expert explique que, cette fois, ils la combineront avec des peptides - molécules consistées en quelques acides aminés, particulièrement conçu contre son « talon d'Achille », l'enzyme qui rectifie les erreurs qui peuvent l'essuyer à l'extérieur, pour rendre la mutagénèse dirigée mortelle plus efficace et pour obtenir de meilleurs résultats.

Le scientifique de l'UMA, qui avait étudié ce type de traitements sur des virus d'animal et végétal depuis 1999, s'assure que SARS-CoV-2 n'est pas une exception, et qu'il a déjà été qu'il est sensible à ces traitements de mutagénèse dirigée.

Phases de recherche

Cette voie, pendant la première phase, qui est déjà en cours, des chercheurs appliquera le logiciel « QuasiFlow » d'UMA pour analyser l'éventail de mutant des échantillons provenant du centre hospitalier universitaire de Victoria de La de Virgen De de Malaga. Ils analyseront les échantillons viraux obtenus à partir des patients avec différents cas cliniques, d'asymptomatique dans des cas sévères, y compris les patients réinfectés, afin de trouver des différences claires en leurs spectres.

Cette première phase est conduite par les chercheurs et les scientifiques de bio-informatique des Claros de Gonzalo d'UMA, d'Enrique Viguera, de Pedro Seoane, de Luis Díaz, de Josefa Gómez y Diego Lozano, ainsi que des spécialistes du centre hospitalier universitaire de Victoria de La de Virgen De de Malaga Jesús Santos et d'Isabel Viciana.

Après ultrasequencing et analysé les spectres de mutant, Ugo Bastolla, chercheur du centre pour la biologie moléculaire « Severo Ochoa » (CBM) du Conseil " Recherche " national espagnol (CSIC), effectuera la phase de modélisation pour recenser le meilleur analogue pour exécuter la mutagénèse dirigée. Ana María Fernández et Gregorio Fernández, experts en matière de structures des protéines d'université de Miguel Hernández d'Elche, seront responsable de concevoir les peptides.

« Ces scientifiques concevront un traitement réglé basé sur l'ordonnancement précédent du virus », explique le chercheur de l'UMA, qui ajoute que cette réalisation est essentielle pour réaliser des demandes de règlement neuves pour combattre COVID-19, que différentes stratégies devraient être étudiées parce que « nous ne pouvons pas risquer tout sur un maneton » avec ce virus.

L'essai sur des cellules hôte pour vérifier l'efficacité de la combinaison de ces deux traitements constitue la phase finale de l'étude. Les chercheurs auront un an pour conduire l'essai et l'EUR 94.800 des fonds COVID-19 du gouvernement de l'Andalousie, pour être chargé aux fonds de FEDER.