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Il nuovo strumento permette allo studio sullo spettro mutante SARS-CoV-2 ultrasequencing

Il genoma SARS-CoV-2 è tre volte più grande del genoma di influenza. Entrambi consistono delle molecole della EKA che subiscono una mutazione quando replica. È essenziale per conoscere il suo spettro mutante, cioè suo “prende le impronte digitali a„, per raggiungere un trattamento appropriato che diminuisce la sua infettività - la capacità degli agenti patogeni di invadere gli organismi e causare le infezioni, poiché la sua composizione delle varianti potrebbe determinare come l'infezione si svilupperebbe in ogni paziente.

I ricercatori dell'università di Malaga (UMA) potranno esaminare la profondità di questi spettri secondo grazie ultrasequencing genetici di tecniche al sistema che innovatore hanno progettato: “QuasiFlow„, uno strumento che permette determinato all'analisi delle varianti presenti in ogni paziente.

Siamo interessati nel raggiungimento della comprensione profonda della variabilità genetica del virus per scoprire il migliore modo attaccare, il suo punto debole.„

Il professor Ana Grande, dipartimento di biologia, della genetica e della fisiologia cellulari, UMA

Il professor Ana Grande piombo l'anno prossimo uno studio, costituito un fondo per dal governo dell'Andalusia, per aumentare la ricerca sulle nuove terapie rapide di entrata in vigore per COVID-19.

Nuova terapia antivirale

Specialmente, questo ricercatore dell'UMA coordinerà un gruppo pluridisciplinare degli scienziati che verificheranno una terapia antivirale di nuova combinazione, che combina la cosiddetti strategia di mutagenesi ed inibitori letali di correzione delle bozze dell'esone e di attività di MTase del coronavirus, per impedire al virus di eludere la risposta immunitaria innata.

“L'idea è di aumentare la capacità di mutazione del virus di girarlo contro il virus, altera il suo spettro mutante in modo che perda la sua infettività„, dice Ana grande, che asserisce che già ha raggiunto questa su altri virus a RNA, quali l'arenavirus linfocitario di choriomeningitis o il virus dell'epatite C, applicando il nucleoside o gli analoghi bassi, simile ai pezzi di base di cui i genoma si compongono.

L'esperto chiarisce che, questo volta, la combineranno con i peptidi - molecole formate da alcuni acidi amminici, specificamente progettato contro il suo “tallone d'Achille„, l'enzima che corregge gli errori che possono pulirlo fuori, per rendere la mutagenesi letale più efficace e per ottenere i migliori risultati.

Lo scienziato dell'UMA, che sta studiando questo tipo di terapie sui virus della pianta ed animali dal 1999, assicura che SARS-CoV-2 non fa un'eccezione e che già è stato provato che è sensibile a queste terapie di mutagenesi.

Fasi di ricerca

Questo modo, nella prima fase, che è già in corso, ricercatori applicherà il software “QuasiFlow„ di UMA per analizzare la gamma mutante di campioni dall'ospedale universitario di Virgen de la Port Victoria di Malaga. Analizzeranno i campioni virali ottenuti dai pazienti con differenti casi clinici, da asintomatico a severo rivestono, compreso i pazienti reinfected, per trovare le chiare differenze nei loro spettri.

Questa prima fase è condotta dai ricercatori e dagli scienziati di bioinformatica dei Claros di UMA Gonzalo, di Enrique Viguera, di Pedro Seoane, di Luis Díaz, di Josefa Gómez y Diego Lozano come pure degli specialisti dell'ospedale universitario di Virgen de la Port Victoria di Malaga Jesús Santos e di Isabel Viciana.

Dopo avere ultrasequencing ed analizzato gli spettri mutanti, Ugo Bastolla, ricercatore del centro per biologia molecolare “Severo Ochoa„ (CBM) del Consiglio nazionale delle ricerche spagnolo (CSIC), effettuerà la fase modellante per identificare il migliore analogo per eseguire la mutagenesi. Ana María Fernández e Gregorio Fernández, esperti in strutture della proteina dell'università di Miguel Hernández di Elche, saranno incaricati di progettazione dei peptidi.

“Questi scienziati progetteranno una terapia adattata basata sull'ordinamento precedente del virus„, chiarisce il ricercatore dell'UMA, che aggiunge che questa realizzazione è essenziale per raggiungere i nuovi trattamenti per combattere COVID-19, che le strategie differenti dovrebbero essere studiate perché “non possiamo rischiare tutto su una manovella„ con questo virus.

La prova sulle cellule ospiti per verificare l'efficacia della combinazione di queste due terapie costituisce la fase finale dello studio. I ricercatori avranno un anno per condurre la prova e l'EUR 94.800 dal fondo COVID-19 del governo dell'Andalusia, per essere fatto pagare al fondo del ERDF.