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Les chercheurs trouvent des jeux du gène CXCR6 un rôle dans la gravité COVID-19

Les chercheurs aux Etats-Unis ont entrepris une étude expliquant qu'un gène CXCR6 appelé (le récepteur de chémokine de motif de C-X-C 6) peut jouer un rôle majeur en déterminant la gravité de la maladie 2019 (COVID-19) de coronavirus.

Le cours de la maladie de COVID-19 est hautement variable, s'échelonnant dedans environ de 80% asymptomatique ou doux de cas dedans environ à 5% sévère de cas. Dans des cas sévères, la maladie peut rapidement progresser et mener à l'insuffisance respiratoire qui a besoin des soins intensifs urgents.

Récent, les études de la taille du génome d'association ont recensé plusieurs lieux génétiques liés à COVID-19 sévère. Cependant, les gènes « causaux » précis dans ces lieux ne sont pas encore connus.  

Maintenant, l'équipe de recherche - du centre de la Science de santé d'Université du Texas à Houston et Université de Cornell à New York - ont employé des approches intégratrices variées pour prouver que des niveaux d'expression du gène CXCR6 (trouvé dans le lieu 3p21.31) sont associés à la gravité de COVID-19.

Avec les patients qui ont eu la maladie modérée, les cellules résidentes de la mémoire CD8+ T (TRM) dans les poumons des patients présentant la maladie sévère ont exprimé des niveaux plus bas de CXCR6.

D'ailleurs, la proportion de cellules de TRM était 3,32 fois inférieure dans les patients sévèrement mauvais que parmi les patients modérément mauvais, enregistre l'équipe.

Une version de prétirage du rapport de recherche est procurable sur le serveur de bioRxiv*, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.

Études précédentes de la gravité COVID-19

Depuis que la manifestation COVID-19 a commencé la première fois à Wuhan, Chine, fin 2019, on a observé la disparité énorme dans la gravité des symptômes entre les patients.

Bien que l'âge et le sexe soient des facteurs de risque majeur liés à la gravité COVID-19, les facteurs précis qui s'entretiennent susceptibilité à COVID-19 dans certains groupes ne sont pas encore clairs.

les études de la taille du génome d'association (GWAS) ont recensé une tige entre le lieu génomique 3p21.31 de risque et la maladie COVID-19 critique. Une étude récente entreprise par le groupe sévère de COVID-19 GWAS a recensé 3p21.31 comme lieu de risque pour la susceptibilité à COVID-19 sévère avec l'insuffisance respiratoire.

Cependant, six gènes (SLC6A20, LZTFL1, CCR9, FYCO1, CXCR6, et XCR1) sont situés près de la variation génétique de fil, et du gène « causal » lié à ce lieu n'a pas été encore recensés.

Comment l'ARN-ordonnancement unicellulaire peut aider

Les progrès récents dans l'ARN-ordonnancement unicellulaire (scRNA-seq) ont fourni des chances inouïes d'élucider les mécanismes pathogènes étant à la base au niveau unicellulaire et de cellule-type.

Récent, les caractéristiques scRNA-seq acquises du liquide de lavage bronchoalvéolaire (BALF) des patients avec COVID-19 modéré et sévère ont indiqué les modifications d'expression du gène qui se produisent en cellules immunitaires importantes.

Cependant, le changement de transcriptome des sous-populations spécifiques demeure en grande partie encore inconnu, » dites les chercheurs.

Que les chercheurs ont-ils fait ?

Les approches intégratrices appliquées par équipe, y compris des études d'association et (TWAS) l'analyse de la taille du transcriptome de colocalization, pour explorer le lien entre les facteurs génétiques d'hôte et le phénotype moléculaire dans le poumon et les cellules immunitaires des patients COVID-19 employant deux ensembles de données indépendants de GWAS.

Les chercheurs ont également exécuté une analyse transcriptomic unicellulaire d'un ensemble de données de BALF pour explorer l'altération de transcriptome dans les patients avec COVID-19 modéré et sévère.

Quelles étaient les découvertes ?

L'équipe a recensé et a reproduit un gène CXCR6, qui a eu une action protectrice dans les poumons, et un gène différent CCR9 appelé qui a eu un effet de risque dans le sang total.

Les chercheurs disent que les études ont précédemment prouvé que CXCR6 est exprimé en cellules de T et est essentiel pour négocier l'autoguidage des cellules de TRM au poumon. En outre, CCR9 a été montré pour régler le chimiotactisme en réponse à la chémokine thymus-exprimée en cellules de T, ils ajoute.

L'analyse a également mis en valeur un effet de réglementation sur l'expression CXCR6 en poumon et cellules immunitaires.

Au niveau unicellulaire, CXCR6 a été exprimé aux niveaux plus bas en cellules du poumon TRM des patients avec COVID-19 sévère que dedans des patients présentant la maladie modérée, supportant de ce fait l'action protectrice précédemment recensée dans le poumon.

La proportion de cellules de TRM était également 3,32 fois inférieure dans les poumons des patients sévèrement mauvais que dans les poumons des patients modérément mauvais.

Que les auteurs ont-ils conclu ?

« Nous avons caractérisé que CXCR6 (gène de borne de cellules de TRM) a eu une expression inférieure dans les patients sévères que dans les patients modérés, » disons les chercheurs.

Notre travail a systématiquement exploré l'effet génétique sur l'expression du gène au lieu 3p21.31 de chromosome et a indiqué exactement le gène CXCR6 pourrait être impliqué dans la gravité de COVID-19. »

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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