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Los investigadores encuentran juegos del gen CXCR6 un papel en la severidad COVID-19

Los investigadores en los Estados Unidos han conducto un estudio que demostraba que un gen llamó CXCR6 (el receptor de Chemokine del adorno de C-X-C 6) puede desempeñar un papel importante en la determinación de la severidad de la enfermedad 2019 (COVID-19) del coronavirus.

El curso de la enfermedad en COVID-19 es altamente variable, colocando hacia adentro del alrededor 80% asintomático o suave de casos hacia adentro al alrededor 5% severo de casos. En casos graves, la enfermedad puede progresar y llevar rápidamente a la falla respiratoria que requiere cuidados intensivos urgentes.

Recientemente, los estudios genoma-anchos de la asociación han determinado varios lugares geométricos genéticos asociados a COVID-19 severo. Sin embargo, los genes “causales” exactos dentro de estos lugares geométricos todavía no se saben.  

Ahora, el equipo de investigación - del centro de la ciencia de la salud de la Universidad de Texas en Houston y la Universidad Cornell en Nueva York - ha utilizado diversas aproximaciones integrantes para mostrar que los niveles de la expresión del gen CXCR6 (encontrado en el lugar geométrico 3p21.31) están asociados a la severidad de COVID-19.

Comparado con los pacientes que tenían enfermedad moderada, las células residentes de la memoria CD8+ T (TRM) en los pulmones de pacientes con enfermedad severa expresaron niveles inferiores de CXCR6.

Por otra parte, la proporción de células de TRM era 3,32 veces más inferior en pacientes seriamente enfermos que entre pacientes moderado enfermos, denuncia a las personas.

Una versión de la prueba preliminar del trabajo de investigación está disponible en el servidor del bioRxiv*, mientras que el artículo experimenta la revisión paritaria.

Estudios anteriores de la severidad COVID-19

Desde que el brote COVID-19 primero comenzó en Wuhan, China, a finales de 2019, la disparidad enorme en la severidad de síntomas se ha observado entre los pacientes.

Aunque la edad y el sexo sean factores de riesgo importantes asociados a la severidad COVID-19, los factores exactos que consultan susceptibilidad a COVID-19 en ciertos grupos no están todavía sin obstrucción.

los estudios Genoma-anchos de la asociación (GWAS) han determinado un eslabón entre el lugar geométrico genomic 3p21.31 del riesgo y la enfermedad crítica COVID-19. Un estudio reciente conducto por el grupo severo de COVID-19 GWAS determinó 3p21.31 como lugar geométrico del riesgo para la susceptibilidad a COVID-19 severo con falla respiratoria.

Sin embargo, seis genes (SLC6A20, LZTFL1, CCR9, FYCO1, CXCR6, y XCR1) están situados cerca de la variación genética del guía, y del gen “causal” asociado a este lugar geométrico todavía no se han determinado.

Cómo la ARN-secuencia unicelular puede ayudar

Los avances recientes en la ARN-secuencia unicelular (scRNA-seq) han ofrecido oportunidades sin precedentes de aclarar mecanismos patógenos que eran la base en el unicelular y el célula-tipo nivel.

Recientemente, los datos scRNA-seq detectados del líquido de lavado broncoalveolar (BALF) de pacientes con COVID-19 moderado y severo revelaron los cambios de la expresión génica que ocurren en células inmunes importantes.

Sin embargo, el cambio del transcriptome en subpoblaciones específicas sigue siendo sobre todo inexplorado,” diga a los investigadores.

¿Qué los investigadores hicieron?

Las aproximaciones integrantes aplicadas personas, incluyendo estudios de la asociación y (TWAS) análisis transcriptome-anchos del colocalization, explorar la conexión entre los factores genéticos del ordenador principal y el fenotipo molecular en el pulmón y las células inmunes de los pacientes COVID-19 que usan dos grupos de datos independientes de GWAS.

Los investigadores también realizaron un análisis transcriptomic unicelular de un grupo de datos de BALF para explorar cambios del transcriptome en pacientes con COVID-19 moderado y severo.

¿Cuáles eran las conclusión?

Las personas determinaron y replegaron el gen CXCR6, que tenía un efecto protector en los pulmones, y otro gen llamó CCR9 que tenía un efecto del riesgo en sangre entera.

Los investigadores dicen que los estudios han mostrado previamente que CXCR6 está expresado en células de T y es esencial para mediar dirigirse de las células de TRM para el pulmón. Además, CCR9 se ha mostrado para regular quimiotactismo en respuesta a chemokine timo-expresado en células de T, él agrega.

El análisis también destacó un efecto regulador sobre la expresión CXCR6 en pulmón y células inmunes.

En el nivel unicelular, CXCR6 fue expresado en los niveles inferiores en las células del pulmón TRM de pacientes con COVID-19 severo que hacia adentro de pacientes con enfermedad moderada, de tal modo soportando el efecto protector determinado previamente en el pulmón.

La proporción de células de TRM era también 3,32 veces más inferior en los pulmones de pacientes seriamente enfermos que en los pulmones de pacientes moderado enfermos.

¿Qué los autores concluyeron?

“Caracterizamos que CXCR6 (gen del marcador de las células de TRM) tenía una expresión más inferior en pacientes severos que en pacientes moderados,” decimos a los investigadores.

Nuestro trabajo exploró sistemáticamente el efecto genético sobre la expresión génica en el lugar geométrico 3p21.31 del cromosoma y estableció claramente el gen CXCR6 se pudo implicar en la severidad de COVID-19.”

Advertencia *Important

el bioRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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