Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

Una diversa estrategia para la detección de las aguas residuales de SARS-CoV-2

Los investigadores probaron una variedad de concentración del ARN y de métodos y de análisis de la extracción para desarrollar un protocolo para probar SARS-CoV-2 en las aguas residuales, que pueden ayudar a perfeccionar la vigilancia COVID-19.

COVID-19, causado por el coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática, es vigilado generalmente diagnosticando a pacientes sintomáticos y trazando sus contactos. Sin embargo, esto puede no ser muy exacto como requiere la participación individual voluntaria y no incluye casos asintomáticos, haciéndola que desafía para controlar la extensión.

Las aguas residuales de la prueba son otro método de vigilar la extensión y la circulación de enfermedades infecciosas. Los marcadores de la enfermedad tales como genomas virales se liberan y se transportan en las aguas residuales. La abundancia de patógeno en las aguas residuales puede ser utilizada para deducir la extensión de la enfermedad.

Varios estudios han denunciado usando las aguas residuales para vigilar la transmisión de SARS-CoV-2. Sin embargo, hay algunos retos a hacer esto. Porque las aguas residuales tienen mucho otra materia orgánica y metales, la detección de los niveles inferiores del virus puede ser difícil. Además, no se sabe exacto en qué forma está presente el virus SARS-CoV-2 en heces, tales como partículas del virus, los fragmentos, y así sucesivamente, que se pueden analizar más lejos durante el transporte de las aguas residuales. Así pues, es esencial tener métodos de confianza de la concentración y detección analítica de virus.

Estrategias de la prueba

En un trabajo de investigación publicó en el servidor de la prueba preliminar del medRxiv*, investigadores del parte de Bélgica una comparación de diversos métodos bioanalytical para la concentración del ARN SARS-CoV-2 en aguas residuales.

Reseña esquemática de la vigilancia de las aguas residuales para determinar la circulación SARS-CoV-2 en la población en general.
Reseña esquemática de la vigilancia de las aguas residuales para determinar la circulación SARS-CoV-2 en la población en general.

Las personas obtuvieron muestras de las aguas residuales a partir de ocho diversas depuradoras de aguas residuales en Bélgica y las aguas residuales sanitarias de una compañía que tenía un número elevado de los casos COVID-19. Utilizaron diversos métodos de la ultrafiltración usando la precipitación de varios dispositivos de la centrifugación y del glicol de polietileno (ESPIGA) para concentrar el ARN viral. El método que dio los niveles más inferiores y más reproductivos de umbral del ciclo (Ct) para la amplificación del gen SARS-CoV-2 fue utilizado para la concentración de la muestra.

Las personas también probaron varios estuches comerciales de la extracción del ARN para elegir el que dio los valores más inferiores y más reproductivos del Ct. Utilizaron RT-PCR y la polimerización en cadena digital (dPCR) para la amplificación del ARN viral. el dPCR puede ser más útil para probar las aguas residuales pues es menos sensible a los inhibidores de la polimerización en cadena presentes en aguas residuales y ofrece la cuantificación absoluta.

Protocolos analíticos perfeccionados

De acuerdo con los resultados de la concentración para las muestras cerco en agosto de 2020, cuando el número de casos era más inferior comparado a ésos en la segunda onda, las personas encontraron que precipitación de la ESPIGA no podría descubrir N1 y los genes del N2 y las concentraciones de coronavirus porcino era considerablemente más inferior. Por lo tanto, este método no fue perseguido más lejos.

Sobre la prueba del efecto de las diversos tallas del poro del filtro y volúmenes de muestra, las personas encontraron que aunque tallas más pequeñas del poro puedan concentrar muestras mejor, llevaron a menudo para filtrar bloqueo y la concentración de inhibidores de la polimerización en cadena. Así pues, utilizaron un atajo del peso molecular de 50 a 100 volúmenes del kDa y de muestra de 50 a 500 ml. Los niveles virales eran demasiado bajos descubrir sin la concentración. Por lo tanto un paso de la concentración era necesario descubrir SARS-CoV-2 en aguas residuales. En el protocolo final, los investigadores utilizaron la ultracentrifugación con los filtros de Centricon.

Aunque el método manual de extracción del ARN y el método automatizado usando el maxwell PureFood y el estuche de la autentificación de GMO fueran comparables para la extracción del ARN, las personas eligieron el método automatizado para su alta producción.

Los autores encontraron RT-PCR y el dPCR dieron los mismos niveles de concentración, indicando que la sensibilidad de ambos análisis es similar. Sin embargo, la ventaja del dPCR es que no necesita una curva estándar.

Cuando el agua se transporta en el sistema de alcantarillado, el genoma SARS-CoV-2 se puede romper en fragmentos más pequeños del ARN. Las personas encontraron los genes del N2 y de E descubiertos para estar encima del límite más inferior de cuantificación para más de 87,5% de las muestras de las aguas residuales. Sin embargo, aumentaba variabilidad en el gen de E con tiempo. Puesto que había variabilidad importante en la concentración nativa en el nivel inferior de la cuantificación, fijar estabilidad es desafiador.

La congelación muestrea copias disminuidas del gen diez veces, mientras que los niveles de la detección eran más altos en las muestras guardadas en 4 °C. Los autores sugieren el guardar de muestras en esta temperatura y el analizar de ellas en el plazo de tres días de colección.

A pesar de mejores protocolos que se convierten, hay variabilidad todavía importante en métodos de concentración de la muestra pues no hay patrón del externo a comparar con. También, el estado del genoma SARS-CoV-2 en aguas residuales es muy incierto debido a la degradación potencial en el sistema de alcantarillado. La investigación adicional es necesaria entender mejor estas variabilidades y el uso potencial de la epidemiología aguas residuales-basada para la vigilancia SARS-CoV-2.

Advertencia *Important

el medRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Lakshmi Supriya

Written by

Lakshmi Supriya

Lakshmi Supriya got her BSc in Industrial Chemistry from IIT Kharagpur (India) and a Ph.D. in Polymer Science and Engineering from Virginia Tech (USA).

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Supriya, Lakshmi. (2021, February 21). Una diversa estrategia para la detección de las aguas residuales de SARS-CoV-2. News-Medical. Retrieved on January 18, 2022 from https://www.news-medical.net/news/20210221/A-different-strategy-for-wastewater-detection-of-SARS-CoV-2.aspx.

  • MLA

    Supriya, Lakshmi. "Una diversa estrategia para la detección de las aguas residuales de SARS-CoV-2". News-Medical. 18 January 2022. <https://www.news-medical.net/news/20210221/A-different-strategy-for-wastewater-detection-of-SARS-CoV-2.aspx>.

  • Chicago

    Supriya, Lakshmi. "Una diversa estrategia para la detección de las aguas residuales de SARS-CoV-2". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20210221/A-different-strategy-for-wastewater-detection-of-SARS-CoV-2.aspx. (accessed January 18, 2022).

  • Harvard

    Supriya, Lakshmi. 2021. Una diversa estrategia para la detección de las aguas residuales de SARS-CoV-2. News-Medical, viewed 18 January 2022, https://www.news-medical.net/news/20210221/A-different-strategy-for-wastewater-detection-of-SARS-CoV-2.aspx.