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Les microbes ont pu prévoir des issues fatales dans les patients COVID-19 aérés

La présence du salivarium de mycoplasme dans les voies aériennes inférieures de patients aérés présentant l'infection COVID-19 est associée à la plus grande chance de mourir. Le résultat était une partie d'une enquête moléculaire qui a regardé comment les micro-environnements de voie aérienne ont affecté le syndrôme respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2).

Leopoldo N. Segal et collègues proposent que des microbes de poumon pourrait être prévisionnel de l'infection sévère de COVID et de la résistance d'anticorps.

« Ces caractéristiques mettent en valeur l'importance de l'abondance SARS-CoV-2 dans les voies aériennes inférieures en tant que facteur prédictif pour la mortalité, et la cotisation significative du transcriptome de cellule hôte, qui réfléchit la réaction inférieure de cellules de voie aérienne à l'infection, » a écrit les chercheurs.

Les découvertes ont pu aider à recenser des patients les plus à risque pour des résultats cliniques faibles et à fournir des alternatives thérapeutiques dès l'abord.

L'étude « signatures microbiennes dans les voies aériennes inférieures des patients COVID19 mécaniquement aérés liés au résultat clinique faible » est procurable comme prétirage sur le serveur de medRxiv*, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.

Classification des signatures microbiennes

Les échantillons inférieurs rassemblés de voie aérienne provenant des patients sur la ventilation de l'infection COVID-19 pendant la première onde à New York City. Ils ont rassemblé des échantillons de voie aérienne de 142 patients présentant l'infection COVID-19.

Le salivarium de mycoplasme dans les voies aériennes est lié à des résultats cliniques plus faibles

Utilisant le metagenomics, les chercheurs ont joint les microbes vivant dans le microbiome de poumon avec les résultats cliniques des patients.

Les résultats ont montré que cela ayant des montants élevés de salivarium de mycoplasme a été associé à une charge virale plus élevée de SARS-CoV-2. De plus, une réaction limitée d'immunoglobuline dans les voies aériennes inférieures a marqué avec le risque de mortalité accrue.

« Les caractéristiques présentées ici par l'utilisation des méthodes quantitatives directes (RT-PCR) et d'un support untargeted semi-quantitatif d'approche (metatranscriptome ordonnançant) l'hypothèse que la charge virale SARS-CoV-2 dans les voies aériennes inférieures joue un rôle critique dans l'étape progressive clinique des patients en critique mauvais COVID-19, » ont écrit les chercheurs.

Aucune preuve des résultats cliniques plus faibles de la co-infection avec des virus respiratoires

Tandis que la plupart des patients étaient les antibiotiques à large spectre donnés et les antifungals, il n'y avait aucune preuve d'empirer des effets de la co-infection avec les virus respiratoires bactériens, viraux, et de champignons.

Pour examiner au risque de la mortalité de l'infection COVID-19, l'équipe a analysé des cultures de laboratoire de 589 patients hospitalisés pour l'insuffisance respiratoire de l'infection COVID-19 sévère.

Les résultats ont prouvé que les patients présentant des résultats cliniques faibles n'ont pas succombé à d'autres infections respiratoires. Il n'y avait également aucune tige entre les cultures et la mortalité microbiennes positives dans les infections COVID-19 sévères.

Associations entre la positivité de culture et le résultat clinique. Rapports de chance et intervalles de confiance correspondants de 95% pour des régimes de positivité de culture pour la cohorte entière (n=589) pendant la longueur de leur hospitalisation (laissée) et pendant les 2 premières semaines de l
Associations entre la positivité de culture et le résultat clinique. Rapports de chance et intervalles de confiance correspondants de 95% pour des régimes de positivité de culture pour la cohorte entière (n=589) pendant la longueur de leur hospitalisation (laissée) et pendant les 2 premières semaines de l'hospitalisation (droite).

Les changements bactériens observés des patients ont aéré pendant plus de 28 jours

Examinant au delà des microbes, les voies aériennes inférieures ont montré une présence élevée de SARS-CoV-2, qui a été associé à la mort. Un échantillon de patients minuscule a eu la grippe A ou les virus de B, la proposant peu probable que la grippe se soit produite simultanément avec l'infection de coronavirus.

En observant des bactéries dans les voies aériennes inférieures, les caractéristiques de metatranscriptome ont trouvé le présent de bactériophages activement. Les chercheurs proposent que ceci pourrait être preuve que les alternances dans le microbiome bactérien pourraient se produire dans les patients présentant l'infection COVID-19 sévère.

Des changements ont été observés des bactériophages de staphylocoque, et le salivarium de mycoplasme était activement présent dans les patients ayant besoin de ventilation pour plus de 28 et les patients qui sont morts comparé aux patients qui ont été aérés pendant moins de 28 jours.

Choc microbien sur la réaction immunitaire

Les patients présentant des résultats cliniques faibles ont exprimé les voies qui ont activé des gènes liés à la dégradation, transport, ainsi qu'ont exprimé des gènes et la signalisation de résistance antimicrobienne.

Les chercheurs écrivent :

« Ces différences peuvent indiquer des différences fonctionnelles importantes menant à un environnement métabolique différent dans les voies aériennes inférieures qui pourraient influencer des réactions immunitaires d'hôte. C'a pu également être préposé du service des différences dans la pression microbienne dans les patients présentant des charges virales plus élevées et de différents environnements inflammatoires. »

Il y avait également une régulation positive des voies dans de Sirtuin et de Ferroptosis signalisation dans les cas COVID-19 le plus sévèrement mauvais. Ceci a coïncidé avec les configurations inactivées de réaction immunitaire, y compris des phagocytes, des neutrophiles, des polynucléaires, et des leucocytes. On a également observé un downregulation des niveaux d'expression d'immunoglobuline et le dysfonctionnement mitochondrial.

Basé sur les caractéristiques, l'équipe propose que les poumons des patients en état critique qui ont besoin de la ventilation de l'infection COVID-19 exprimez une condition imbalanced plutôt que l'inflammation élevée. Faire semble ainsi être prévisionnel d'empirer des pronostics.

L'analyse approfondie a trouvé des différences survie-associées dans des réactions d'interféron. L'activation de l'interféron du type I était un facteur prévisionnel pour la mortalité accrue.

« Tandis qu'encore d'autres caractéristiques longitudinales seront nécessaires pour expliquer le rôle de la signalisation d'interféron sur la maladie, les caractéristiques présentées ici proposent que cela la combinaison microbienne et les signatures d'hôte pourraient aider à comprendre le risque accru pour la mortalité dans les patients en critique mauvais COVID-19. »

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Jocelyn Solis-Moreira

Written by

Jocelyn Solis-Moreira

Jocelyn Solis-Moreira graduated with a Bachelor's in Integrative Neuroscience, where she then pursued graduate research looking at the long-term effects of adolescent binge drinking on the brain's neurochemistry in adulthood.

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