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I microbi hanno potuto predire i risultati interni in pazienti arieggiati COVID-19

La presenza di salivarium del micoplasma nelle gallerie di ventilazione più basse dei pazienti arieggiati con l'infezione COVID-19 è associata con le probabilità aumentate della morte. Il risultato era una parte di una ricerca molecolare che ha esaminato come i microenvironments della galleria di ventilazione hanno pregiudicato la sindrome respiratorio acuto severo (SARS-CoV-2).

Leopoldo N. Segal e colleghi suggerisce che microbi del polmone potrebbe essere premonitore dell'infezione di COVID e della resistenza severe dell'anticorpo.

“Questi dati evidenziano l'importanza dell'abbondanza SARS-CoV-2 nelle gallerie di ventilazione più basse come preannunciatore per la mortalità ed il contributo significativo del transcriptome della cellula ospite, che riflette la risposta più bassa delle cellule della galleria di ventilazione all'infezione,„ ha scritto i ricercatori.

I risultati hanno potuto contribuire ad identificare i pazienti più a rischio dei risultati clinici difficili ed a fornire i trattamenti alternativi nella fase iniziale.

Lo studio “impronte microbiche nelle gallerie di ventilazione più basse dei pazienti meccanicamente arieggiati COVID19 connessi con risultato clinico difficile„ è disponibile come pubblicazione preliminare sul " server " del medRxiv*, mentre l'articolo subisce la revisione tra pari.

Classificazione delle impronte microbiche

I campioni più bassi raccolti della galleria di ventilazione dai pazienti su ventilazione dall'infezione COVID-19 durante la prima onda in New York. Hanno raccolto i campioni della galleria di ventilazione da 142 pazienti con l'infezione COVID-19.

Il salivarium del micoplasma nelle gallerie di ventilazione è collegato ai risultati clinici più difficili

Facendo uso del metagenomics, i ricercatori hanno collegato i microbi che vivono nel microbiome del polmone con i risultati clinici dei pazienti.

I risultati hanno mostrato che quello che ha quantità elevate del salivarium del micoplasma è stato associato con un più alto caricamento virale di SARS-CoV-2. Inoltre, una risposta limitata dell'immunoglobulina nelle gallerie di ventilazione più basse ha correlato con il rischio aumentato della mortalità.

“I dati presentati qui con l'uso dei metodi quantitativi diretti (RT-PCR) e di un supporto untargeted semiquantitativo di approccio (metatranscriptome che ordina) l'ipotesi che il caricamento virale SARS-CoV-2 nelle gallerie di ventilazione più basse svolge un ruolo critico nella progressione clinica dei pazienti criticamente malati COVID-19,„ hanno scritto i ricercatori.

Nessuna prova dei risultati clinici più difficili dal coinfection con gli agenti patogeni respiratori

Mentre la maggior parte dei pazienti sono stati dati gli antibiotici ed i antifungals di vasto-spettro, non c'era prova del peggioramento degli effetti dal coinfection con gli agenti patogeni respiratori batterici, virali e dei funghi.

Per guardare col rischio della mortalità dall'infezione COVID-19, il gruppo ha analizzato le culture del laboratorio da 589 pazienti ospedalizzati per arresto respiratorio dall'infezione severa COVID-19.

I risultati hanno indicato che i pazienti con i risultati clinici difficili non hanno soccombuto ad altre infezioni respiratorie. Non c'era egualmente collegamento fra le culture e la mortalità microbiche positive nelle infezioni severe COVID-19.

Associazioni fra positività della cultura e risultato clinico. Rapporti di probabilità e intervalli di confidenza corrispondenti di 95% per le tariffe di positività della cultura per l
Associazioni fra positività della cultura e risultato clinico. Rapporti di probabilità e intervalli di confidenza corrispondenti di 95% per le tariffe di positività della cultura per l'intero gruppo (n=589) durante la lunghezza della loro ospedalizzazione (lasciata) e durante le prime 2 settimane dell'ospedalizzazione (destra).

I cambiamenti batterici osservati in pazienti hanno arieggiato per i più di 28 giorni

Guardando oltre i microbi, le gallerie di ventilazione più basse hanno mostrato un'alta presenza di SARS-CoV-2, che è stato associato con la morte. Un campione minuscolo dei pazienti ha avuto l'influenza A o virus di B, suggerente la improbabile che l'influenza si presentasse simultaneamente con l'infezione di coronavirus.

Nell'osservare i batteri nelle gallerie di ventilazione più basse, i dati del metatranscriptome hanno trovato il presente dei fagi attivamente. I ricercatori suggeriscono che questa potrebbe essere prova che le alternative nel microbiome batterico potrebbero accadere in pazienti con l'infezione severa COVID-19.

I cambiamenti sono stati osservati nei fagi dello stafilococco e il salivarium del micoplasma era attivamente presente in pazienti che hanno bisogno della ventilazione per più di 28 ed i pazienti che sono morto hanno confrontato ai pazienti che sono stati arieggiati per i meno di 28 giorni.

Impatto microbico sulla risposta immunitaria

I pazienti con i risultati clinici difficili hanno espresso le vie che hanno attivato i geni relativi a degradazione, il trasporto come pure hanno espresso i geni e la segnalazione di resistenza antimicrobici.

I ricercatori scrivono:

“Queste differenze possono indicare le differenze funzionali importanti che piombo ad un ambiente metabolico differente nelle gallerie di ventilazione più basse che potrebbero urtare le risposte immunitarie ospite. Ha potuto anche essere rappresentante delle differenze nella pressione microbica in pazienti con gli più alti caricamenti virali e gli ambienti infiammatori differenti.„

C'era egualmente un upregulation vie nella segnalazione di Ferroptosis e di Sirtuin nei casi il più severamente malati COVID-19. Ciò ha coinciso con le funzionalità inattivate di risposta immunitaria, compreso i fagociti, i neutrofili, i granulociti ed i leucociti. Un downregulation dei livelli di espressione dell'immunoglobulina e la disfunzione mitocondriale egualmente sono stati osservati.

Sulla base dei dati, il gruppo suggerisce che i polmoni dei pazienti criticamente malati che richiedono la ventilazione dall'infezione COVID-19 esprima uno stato squilibrato piuttosto di quanto l'infiammazione elevata. Agire in tal modo sembra essere premonitore del peggioramento delle prognosi.

Ulteriore analisi ha trovato le differenze sopravvivenza-associate nelle risposte dell'interferone. L'attivazione di tipo interferone di I era un fattore premonitore per la mortalità aumentata.

“Mentre ulteriori dati longitudinali saranno necessari chiarire il ruolo della segnalazione dell'interferone sulla malattia, i dati presentati qui suggeriscono che quella combinarsi microbica e le impronte ospite potrebbero aiutare a capire il rischio aumentato per la mortalità in pazienti criticamente malati COVID-19.„

Avviso *Important

il medRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
Jocelyn Solis-Moreira

Written by

Jocelyn Solis-Moreira

Jocelyn Solis-Moreira graduated with a Bachelor's in Integrative Neuroscience, where she then pursued graduate research looking at the long-term effects of adolescent binge drinking on the brain's neurochemistry in adulthood.

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