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Os micróbios podiam prever resultados fatais nos pacientes COVID-19 ventilados

A presença de salivarium do Mycoplasma nas vias aéreas mais baixas de pacientes ventilados com infecção COVID-19 é associada com as probabilidades aumentadas da morte. O resultado era uma parte de uma investigação molecular que olhasse como os microambiente da via aérea afectaram a Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2).

Leopoldo N. Segal e colegas sugere que micróbios do pulmão poderia ser com carácter de previsão da infecção de COVID e da resistência severas do anticorpo.

“Estes dados destacam a importância da abundância SARS-CoV-2 nas vias aéreas mais baixas como um predictor para a mortalidade, e a contribuição significativa do transcriptome da pilha de anfitrião, que reflecte a resposta mais baixa da pilha da via aérea à infecção,” escreveu os pesquisadores.

Os resultados podiam ajudar a identificar mais pacientes em risco dos resultados clínicos deficientes e a fornecer cedo tratamentos alternativos sobre.

O estudo “assinaturas microbianas nas vias aéreas mais baixas dos pacientes COVID19 mecanicamente ventilados associados com o resultado clínico deficiente” está disponível como uma pré-impressão no server do medRxiv*, quando o artigo se submeter à revisão paritária.

Classificando assinaturas microbianas

As amostras mais baixas recolhidas da via aérea dos pacientes na ventilação da infecção COVID-19 durante a primeira onda em New York City. Recolheram amostras da via aérea de 142 pacientes com infecção COVID-19.

O salivarium do Mycoplasma nas vias aéreas é ligado a uns resultados clínicos mais deficientes

Usando o metagenomics, os pesquisadores ligaram os micróbios que vivem no microbiome do pulmão com os resultados clínicos dos pacientes.

Os resultados mostraram que isso que tem quantidades altas de salivarium do Mycoplasma estêve associado com uma carga viral mais alta de SARS-CoV-2. Além, uma resposta limitada da imunoglobulina nas vias aéreas mais baixas correlacionou com o risco aumentado da mortalidade.

“Os dados apresentados aqui com o uso dos métodos quantitativos directos (RT-PCR) e de um apoio untargeted semiquantitativo da aproximação (metatranscriptome que arranja em seqüência) a hipótese que a carga SARS-CoV-2 viral nas vias aéreas mais baixas joga um papel crítico na progressão clínica dos pacientes COVID-19 crìtica doentes,” escreveram os pesquisadores.

Nenhuma evidência de resultados clínicos mais deficientes do coinfection com micróbios patogénicos respiratórios

Quando a maioria de pacientes foram dados antibióticos e antifungals do largo-espectro, não havia nenhuma evidência de agravar efeitos do coinfection com os micróbios patogénicos respiratórios bacterianos, virais, e dos fungos.

Para olhar com risco da mortalidade da infecção COVID-19, a equipe analisou culturas do laboratório de 589 pacientes hospitalizados para a falha respiratória da infecção COVID-19 severa.

Os resultados mostraram que os pacientes com resultados clínicos deficientes não sucumbiram a outras infecções respiratórias. Não havia igualmente nenhuma relação entre culturas e a mortalidade microbianas positivas nas infecções COVID-19 severas.

Associações entre a positividade da cultura e o resultado clínico. Relações das probabilidades e intervalos de confiança correspondentes de 95% para taxas de positividade da cultura para a coorte inteira (n=589) durante o comprimento de sua hospitalização (deixada) e durante as primeiras 2 semanas da hospitalização (direita).
Associações entre a positividade da cultura e o resultado clínico. Relações das probabilidades e intervalos de confiança correspondentes de 95% para taxas de positividade da cultura para a coorte inteira (n=589) durante o comprimento de sua hospitalização (deixada) e durante as primeiras 2 semanas da hospitalização (direita).

As mudanças bacterianas observadas nos pacientes ventilaram por mais de 28 dias

Olhando além dos micróbios, as vias aéreas mais baixas mostraram uma presença alta de SARS-CoV-2, que foi associado com a morte. Uma amostra minúscula de pacientes teve a gripe A ou os vírus de B, sugerindo a improvável que a gripe ocorresse simultaneamente com infecção do coronavirus.

Ao observar as bactérias nas vias aéreas mais baixas, os dados do metatranscriptome encontraram o presente dos fago activamente. Os pesquisadores sugerem que esta poderia ser evidência que as alternações no microbiome bacteriano poderiam acontecer nos pacientes com infecção COVID-19 severa.

As mudanças foram observadas em fago do estafilococo, e o salivarium do Mycoplasma estava activamente actual nos pacientes que precisam a ventilação para mais de 28 e os pacientes que morreram compararam aos pacientes que foram ventilados por menos de 28 dias.

Impacto microbiano na resposta imune

Os pacientes com resultados clínicos deficientes expressaram os caminhos que activaram os genes relativos à degradação, transporte, assim como expressaram genes e sinalização de resistência antimicrobiais.

Os pesquisadores escrevem:

“Estas diferenças podem indicar as diferenças funcionais importantes que conduzem a um ambiente metabólico diferente nas vias aéreas mais baixas que poderiam impactar respostas imunes do anfitrião. Podia igualmente ser representante das diferenças na pressão microbiana nos pacientes com cargas virais mais altas e ambientes inflamatórios diferentes.”

Havia igualmente um upregulation caminhos na sinalização de Sirtuin e de Ferroptosis nos casos COVID-19 o mais severamente doentes. Isto coincidiu com as características neutralizadas da resposta imune, incluindo fagócito, neutrófilo, granulocytes, e leucócito. Um downregulation de níveis da expressão da imunoglobulina e a deficiência orgânica mitocondrial foram observados igualmente.

Baseado nos dados, a equipe sugere que os pulmões dos pacientes crìtica doentes que exigem a ventilação da infecção COVID-19 expresse um estado desequilibrado um pouco do que a inflamação elevado. Fazer parece assim ser com carácter de previsão de agravar prognósticos.

Diferenças sobrevivência-associadas encontradas análise mais aprofundada em respostas da interferona. Activação do tipo eu interferona era um factor com carácter de previsão para a mortalidade aumentada.

“Quando uns dados longitudinais mais adicionais serão necessários esclarecer o papel da sinalização da interferona na doença, os dados apresentados aqui sugerem que aquela a combinação microbiana e as assinaturas do anfitrião poderiam ajudar a compreender o risco aumentado para a mortalidade nos pacientes COVID-19 crìtica doentes.”

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Jocelyn Solis-Moreira

Written by

Jocelyn Solis-Moreira

Jocelyn Solis-Moreira graduated with a Bachelor's in Integrative Neuroscience, where she then pursued graduate research looking at the long-term effects of adolescent binge drinking on the brain's neurochemistry in adulthood.

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