Attenzione: questa pagina è una traduzione automatica di questa pagina originariamente in lingua inglese. Si prega di notare in quanto le traduzioni sono generate da macchine, non tutte le traduzioni saranno perfetti. Questo sito web e le sue pagine web sono destinati ad essere letto in inglese. Ogni traduzione del sito e le sue pagine web possono essere imprecise e inesatte, in tutto o in parte. Questa traduzione è fornita per comodità.

La sorveglianza genomica può contribuire ad identificare come SARS-CoV-2 si sparge nelle case di cura

Le case di cura sono ad ad alto rischio di avvertire gli scoppi di COVID-19, la malattia causata da SARS-CoV-2. La gente più anziana e quelle hanno pregiudicato a memoria la malattia, malattia respiratoria ed il diabete di tipo 2 - che aumentano con l'età - è al più grande rischio di malattia e perfino di morte severe, rendente la popolazione della casa di cura particolarmente vulnerabile.

Le case di cura sono conosciute per essere impostazioni ad alto rischio per le malattie infettive, a causa di una combinazione della vulnerabilità di fondo dei residenti che sono spesso delicati ed anziani, dell'ambiente vivente comune con gli spazi comunali multipli e del numero alto dei contatti fra i residenti, il personale e gli ospiti in uno spazio chiuso.

Nella ricerca pubblicata nel eLife, un gruppo piombo dagli scienziati all'università di Cambridge e di istituto di Wellcome Sanger ha usato una combinazione di sequenziamento del genoma ed ha dettagliato le informazioni epidemiologiche per esaminare l'impatto di COVID-19 sulle case di cura e per esaminare come il virus si sparge in queste impostazioni.

SARS-CoV-2 è un virus a RNA e poichè tale suo codice genetico è ogni volta ad errori inclini ripiega. Corrente è stimato che il virus subisca una mutazione ad un tasso di 2,5 nucleotidi (A, la C, il G ed U del suo codice genetico) al mese. La lettura - o “ordinare„ - del codice genetico del virus può fornire informazioni apprezzate sulla sue biologia e trasmissione. Permettono che i ricercatori crino “gli alberi genealogici - conosciuti come gli alberi filogenetici - quella manifestazione come i campioni si riferiscono l'un l'altro.

Gli scienziati ed i clinici a Cambridge hanno aperto la strada all'uso di sequenziamento del genoma e di informazioni epidemiologiche rintracciare gli scoppi e le reti di trasmissione in ospedali e nelle impostazioni a livello comunitario di sanità, aiutando informi le misure di controllo di infezione e rompa le catene di trasmissione. Dal marzo 2020, stanno applicando questo metodo a SARS-CoV-2 come componente del consorzio del Regno Unito di genomica COVID-19 (COG-UK).

In questo nuovo studio, i ricercatori hanno analizzato i campioni raccolti da 6.600 pazienti fra il 26 febbraio ed il 10 maggio 2020 e provati al laboratorio dell'Inghilterra (PHE) di salute pubblica a Cambridge. Da tutti i casi, 1.167 (18%) erano residenti domestici di cura da 337 case di cura, 193 di cui erano case residenziali e 144 case di cura, la maggior parte nell'est dell'Inghilterra. L'età media dei residenti della casa di cura era di 86 anni.

Mentre il numero mediano dei casi per casa di cura era due, le dieci case di cura con il più grande numero dei casi hanno rappresentato 164 casse. C'era una leggera tendenza affinchè le case di cura abbia più casi per casa che le case residenziali, con una mediana di tre casi.

Rispetto ai residenti della casa di non cura ammessi all'ospedale con COVID-19, i residenti ospedalizzati della casa di cura erano meno probabili essere ammessi alle unità di cure intensive (meno di 7% contro 21%) e più probabile morire (47% contro 20%).

I ricercatori egualmente hanno esplorato i collegamenti fra le case di cura e gli ospedali. 68% dei residenti della casa di cura sono stati ammessi all'ospedale durante il periodo di studio. 57% sono stati ammessi con COVID-19, 6% dei casi aveva sospettato l'infezione ospedale-acquistata e 33% sono stati scaricati dall'ospedale entro 7 giorni di una prova positiva. Questi risultati evidenziano le ampie opportunità per la trasmissione SARS-CoV-2 fra l'ospedale e le impostazioni domestiche di cura.

Quando i ricercatori hanno esaminato le sequenze virali, hanno trovato che per varie delle case di cura con il più alto numero dei casi, tutti casi ragruppati molto attentamente insieme su un albero filogenetico con i genoma identici o appena una differenza della coppia di basi. Ciò era coerente con un singolo scoppio che si sparge all'interno della casa di cura.

Al contrario, per parecchie altre case di cura, i casi si sono distribuiti attraverso l'albero filogenetico, con le differenze genetiche più diffuse, suggerenti che ciascuno di questi casi interessasse indipendente e una sorgente comune della trasmissione.

“La gente più anziana, specialmente quelle nelle case di cura che possono essere delicate, è al rischio particolare da COVID-19, in modo da è essenziale noi fa tutti che possiamo proteggerli,„ ha detto il Dott. Estée Török, un consulente onorario all'ospedale di Addenbrooke, agli ospedali dell'università di Cambridge (CUH) e ad un collega visualizzante senior onorario all'università di Cambridge.

“Impedire l'introduzione di nuove infezioni nelle case di cura dovrebbe essere una priorità chiave per limitare gli scoppi, accanto agli sforzi di controllo di infezione per limitare la trasmissione all'interno delle case di cura, includenti una volta che uno scoppio è stato identificato.„

Il gruppo ha trovato due cluster che sono stati collegati ai lavoratori di sanità. Uno di questi residenti implicati della casa di cura, una personale che dispensa le cure da quella casa ed un altro da una casa sconosciuta, dai paramedici e dalla gente di cura viventi con loro. Il secondo ha compreso vari residenti domestici di cura e personale medico acuto alla fiducia delle fondamenta di NHS degli ospedali dell'università di Cambridge che si è preoccupata per almeno uno dei residenti. Non era possibile dire da dove questi cluster sono provenuto e come la diffusione del virus.

Facendo uso di questa tecnica “di sorveglianza genomica„ può aiutare meglio le istituzioni quali le case e gli ospedali di cura a capire le reti di trasmissione che permettono la diffusione di COVID-19. Ciò può poi informare le misure di controllo di infezione, aiutanti assicuri che questi posti siano sicuri come possibile per i residenti, i pazienti, il personale e gli ospiti.„

Dott. William Hamilton, università di Cambridge e CUH

Il numero assoluto delle casse diagnosticate COVID-19 dai residenti della casa di cura è diminuito più lentamente ad aprile che per i residenti della casa di non cura, aumentando la proporzione di casi dalle case di cura e contribuendo alla tariffa lenta del declino nei numeri totali di caso durante il mese di aprile e l'inizio di maggio 2020.

“I nostri dati suggeriscono che la trasmissione domestica di cura sia stata più resistente alle misure del lockdown che le impostazioni domestiche di non cura. Ciò può riflettere la vulnerabilità di fondo della popolazione della casa di cura e le sfide di controllo di infezione di cura dei residenti multipli che possono anche dividere gli spazi vitali comunali,„ ha detto la Tonkin-Collina di Gerry dall'istituto di Wellcome Sanger.

Il gruppo ha trovato gli stirpi virali non nuovi dall'esterno del Regno Unito, che può riflettere il successo delle restrizioni di viaggio nella limitazione delle introduzioni virali nuove nella popolazione in genere durante il primo periodo epidemico del lockdown e dell'onda.

Source:
Journal reference:

Hamilton, W.L., et al. (2021) Genomic epidemiology of COVID-19 in care homes in the East of England. eLife. doi.org/10.7554/eLife.64618.