Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

A fiscalização Genomic pode ajudar a identificar como SARS-CoV-2 espalha em HOME do cuidado

As HOME do cuidado estão no risco elevado de experimentar manifestações de COVID-19, a doença causada por SARS-CoV-2. Uns povos mais idosos e aqueles afetados pela doença cardíaca, pela doença respiratória e pelo tipo - diabetes 2 - que aumentam com idade - estão no grande risco de doença e mesmo de morte severas, fazendo a população da HOME do cuidado especialmente vulnerável.

As HOME do cuidado são conhecidas para ser ajustes de alto risco para doenças infecciosas, devido a uma combinação da vulnerabilidade subjacente dos residentes que são frequentemente frágeis e idosos, ao ambiente vivo compartilhado com espaços comunais múltiplos, e ao número alto de contactos entre residentes, pessoal e visitantes em um espaço incluido.

Na pesquisa publicada no eLife, uma equipe conduzida por cientistas na universidade de Cambridge e de instituto de Wellcome Sanger usou uma combinação de genoma que arranja em seqüência e detalhou a informação epidemiológica para examinar o impacto de COVID-19 em HOME do cuidado e para olhá-lo como o vírus espalha nestes ajustes.

SARS-CoV-2 é um vírus do RNA e como tal seu código genético é erros inclinados cada vez replicates. Calcula-se actualmente que o vírus se transforma a uma taxa de 2,5 nucleotides (o A, o C, o G e o U de seu código genético) pelo mês. Ler - ou “o arranjar em seqüência” - o código genético do vírus podem fornecer a informação valiosa em suas biologia e transmissão. Permite que os pesquisadores criem as “árvores genealógicas - conhecidas como árvores filogenéticas - essa mostra como as amostras se relacionam entre si.

Os cientistas e os clínicos em Cambridge abriram caminho o uso de arranjar em seqüência do genoma e de informação epidemiológica para seguir manifestações e redes da transmissão nos hospitais e comunidade-são baseados ajustes dos cuidados médicos, ajudando informe medidas de controle da infecção e quebre as correntes da transmissão. Desde março de 2020, têm aplicado este método a SARS-CoV-2 como parte do consórcio do Reino Unido da genómica COVID-19 (COG-UK).

Neste estudo novo, os pesquisadores analisaram as amostras recolhidas de 6.600 pacientes entre o 26 de fevereiro e o 10 de maio de 2020 e testadas no laboratório de Inglaterra da saúde (PHE) pública em Cambridge. Fora de todos os casos, 1.167 (18%) eram residentes home do cuidado de 337 HOME do cuidado, 193 de que eram as HOME residenciais e 144 lares de idosos, maioria no leste de Inglaterra. A idade mediana de residentes da HOME do cuidado era 86 anos.

Quando o número mediano de casos pela HOME do cuidado era dois, as dez HOME do cuidado com o número o maior de casos esclareceram 164 caixas. Havia uma tendência ligeira para que os lares de idosos tenham mais casos pela HOME do que HOME residenciais, com um número médio de três casos.

Comparado com os residentes da HOME do não-cuidado admitidos ao hospital com COVID-19, os residentes hospitalizados da HOME do cuidado eram menos prováveis ser admitidos às unidades de cuidados intensivos (menos de 7% contra 21%) e mais provável morrer (47% contra 20%).

Os pesquisadores igualmente exploraram as relações entre HOME do cuidado e hospitais. 68% de residentes da HOME do cuidado foram admitidos ao hospital durante o período do estudo. 57% foram admitidos com COVID-19, 6% dos casos tinha suspeitado a infecção hospital-adquirida, e 33% foram descarregados do hospital no prazo de 7 dias de um teste positivo. Estes resultados destacam as oportunidades amplas para a transmissão SARS-CoV-2 entre o hospital e os ajustes home do cuidado.

Quando os pesquisadores examinaram as seqüências virais, encontraram que para diversas das HOME do cuidado com o número o mais alto de casos, todos os casos aglomerados pròxima junto em uma árvore filogenética com genomas idênticos ou apenas uma diferença baixa dos pares. Isto era consistente com uma única manifestação que espalha dentro da HOME do cuidado.

Pelo contraste, para diversas outras HOME do cuidado, os casos foram distribuídos através da árvore filogenética, com as diferenças genéticas mais difundidas, sugerindo que cada um destes casos fosse independente e nao relacionado a uma fonte compartilhada da transmissão.

“Uns povos mais idosos, particularmente aqueles nas HOME do cuidado que podem ser frágeis, estão no risco particular de COVID-19, assim que é essencial nós faz tudo que nós podemos o proteger,” disse o Dr. Estée Török, um consultante honorário no hospital de Addenbrooke, nos hospitais da Universidade de Cambridge (CUH), e em um companheiro de visita superior honorário na universidade de Cambridge.

“Impedir a introdução de infecções novas em HOME do cuidado deve ser uma prioridade chave para limitar manifestações, ao lado dos esforços do controle da infecção para limitar a transmissão dentro das HOME do cuidado, incluindo uma vez que uma manifestação foi identificada.”

A equipe encontrou dois conjuntos que foram ligados aos trabalhadores dos cuidados médicos. Um destes residentes involvidos da HOME do cuidado, uma equipa de tratamento dessa HOME e outra de uma HOME desconhecida, dos paramédicos e dos povos do cuidado vivendo com eles. O segundo envolveu diversos os residentes home do cuidado e pessoal médico agudo na confiança da fundação dos hospitais NHS da Universidade de Cambridge que se importou no mínimo um dos residentes. Não era possível dizer de onde estes conjuntos originaram e como a propagação do vírus.

Usar esta técnica “da fiscalização genomic” pode ajudar as instituições tais como HOME e hospitais do cuidado melhor a compreender as redes da transmissão que permitem a propagação de COVID-19. Isto pode então informar as medidas de controle da infecção, ajudando assegure-se de que estes lugares sejam tão seguros como possível para residentes, pacientes, pessoal e visitantes.”

Dr. William Hamilton, universidade de Cambridge e CUH

O número absoluto das caixas COVID-19 diagnosticadas dos residentes da HOME do cuidado diminuiu mais lentamente em abril do que para residentes da HOME do não-cuidado, aumentando a proporção de casos das HOME do cuidado e contribuindo à taxa lenta de diminuição em números totais do caso durante abril e princípio de maio de 2020.

“Nossos dados sugerem que a transmissão home do cuidado seja mais resistente às medidas do lockdown do que os ajustes home do não-cuidado. Isto pode reflectir a vulnerabilidade subjacente da população da HOME do cuidado, e os desafios do controle da infecção de nutrir os residentes múltiplos que podem igualmente compartilhar de espaços vivos comunais,” disse o Tonkin-Monte de Gerry do instituto de Wellcome Sanger.

A equipe encontrou linhagens virais não novas fora do Reino Unido, que pode reflectir o sucesso de limitações de curso em limitar introduções virais novas na população geral durante o primeiro período epidémico da onda e do lockdown.

Source:
Journal reference:

Hamilton, W.L., et al. (2021) Genomic epidemiology of COVID-19 in care homes in the East of England. eLife. doi.org/10.7554/eLife.64618.