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La plate-forme de robotique pourrait révolutionner comment les laboratoires suivent l'écart de COVID-19, d'autres agents pathogènes

Une plate-forme de robotique conçue par des chercheurs de Toronto pour examiner des milliers d'échantillons COVID-19 a immédiatement le potentiel de révolutionner comment les laboratoires suivent l'écart des virus et d'autres agents pathogènes, selon des découvertes neuves.

L'étude, à l'extérieur mercredi dans des transmissions de nature, constatées que le de la deuxième génération, ultra-haut-débit ordonnançant la plate-forme, C19-SPAR-Seq appelé, conçu par des chercheurs de l'institut de recherches de Lunenfeld-Tanenbaum (LTRI) à la santé de Sinai, a pour cent plus grand de régime de sensibilité des que 95 dans des cas positifs pendant le début maximal.

Le recensement des échantillons positifs rapidement et est exactement critique en battant cette pandémie. Avec des variantes neuves et potentiellement dangereuses diffusant maintenant, c'est une plate-forme qui est évolutive, robotisée et capable d'analyser des milliers d'échantillons COVID-19 patients dans un seul passage d'instrument. »

M. Jeff Wrana, chercheur supérieur, institut de recherches de Lunenfeld-Tanenbaum, professeur, Service de Génétique Moléculaire, université de Toronto

Wrana et M. supérieur semblable de chercheur de LTRI Laurence Pelletier, en collaboration avec l'université du professeur M. Ben Blencowe de Toronto, créditent une équipe intense des stagiaires désireux qui ont changé de vitesse d'autres domaines de recherche pour aider à développer et valider la plate-forme, tenant compte pour que l'équipe aille du concept au papier publié dedans au-dessous de 12 mois.

« La coopération du laboratoire diagnostique clinique d'hôpital de mont Sinaï était l'autre ingrédient principal à notre réussite, » a dit Pelletier. « Jusqu'à présent le laboratoire partagé de microbiologie, dirigé par M. Tony Mazzulli, a permis d'accéder aux milliers d'échantillons. »

Fin 2020, l'équipe a pivoté de nouveau pour utiliser la plate-forme de robotique pour examiner des milliers d'échantillons positifs pour des variantes en ordonnançant rapidement des régions d'empreinte digital du génome viral pour rechercher les mutations principales.

« C'a été un plaisir absolu de fonctionner avec M. Jeff Wrana et son équipe au LTRI, » a dit M. Mazzulli, microbiologiste-dans-responsable pour le réseau de santé de Sinai et de santé d'université (UHN). « Son système Longeron-Seq nouveau est technologie tranchante et la capacité de son équipe d'ordonnancer les échantillons COVID-19 en temps réel a le potentiel énorme pour influencer notre compréhension de l'épidémiologie et de l'écart des mutants nouveaux dans la province. »

La plate-forme est également rentable. L'étude la note des prix uniques environ $8 USD selon le test en faisant fonctionner des milliers d'échantillons immédiatement, comme coût selon des diminutions d'échantillon dues aux économies d'échelle.

« Elle est extrêmement fiable et promptement capable de s'adapter, » a dit Javier Hernandez, un chercheur junior dans le laboratoire de Wrana qui dirigé par Co l'étude avec le jeu rouleau-tambour. Marie-Ming Aynaud et sedums Barutcu. « Le retournement est approximativement 24 heures. Il est très simple car nous avons automatisé pratiquement chaque opération dans le procédé. Pour moi, c'a été une chose très passionnante pour voir mon travail effectuer une différence. »

Source:
Journal reference:

Aynaud, M. M., et al. (2021) A multiplexed, next generation sequencing platform for high-throughput detection of SARS-CoV-2. Nature Communications. doi.org/10.1038/s41467-021-21653-y.