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A plataforma da robótica poderia revolucionar como os laboratórios seguem a propagação de COVID-19, outros micróbios patogénicos

Uma plataforma da robótica projetada por pesquisadores de Toronto seleccionar milhares das amostras COVID-19 tem imediatamente o potencial revolucionar como os laboratórios seguem a propagação dos vírus e dos outros micróbios patogénicos, de acordo com resultados novos.

O estudo, para fora quarta-feira nas comunicações da natureza, encontradas que a próxima geração, ultra-alto-produção que arranja em seqüência a plataforma, chamou C19-SPAR-Seq, projetado por pesquisadores do instituto de investigação de Lunenfeld-Tanenbaum (LTRI) na saúde de Sinai, tem por cento maior da taxa da sensibilidade uns de 95 em casos positivos durante o início máximo.

Identificar amostras positivas rapidamente e é exactamente crítica em bater esta pandemia. Com as variações novas e potencialmente perigosos que circulam agora, esta é uma plataforma que seja evolutiva, automatizado e capaz de analisar milhares das amostras COVID-19 pacientes em uma única corrida do instrumento.”

Dr. Jeff Wrana, investigador superior, instituto de investigação de Lunenfeld-Tanenbaum, professor, departamento da genética molecular, universidade de toronto

Wrana e o Dr. superior Laurence Pelletier do investigador do companheiro LTRI, em colaboração com a universidade do professor Dr. Ben Blencowe de toronto, creditam uma equipe forte dos estagiários ansiosos que deslocaram de outras áreas de pesquisa para ajudar a desenvolver e validar a plataforma, permitindo a equipe ir do conceito ao papel publicado dentro sob 12 meses.

“A cooperação do laboratório diagnóstico clínico do hospital do monte Sinai era o outro ingrediente chave a nosso sucesso,” disse Pelletier. “Até agora o laboratório compartilhado da microbiologia, dirigido pelo Dr. Tony Mazzulli, forneceu o acesso aos milhares de amostras.”

Ao fim de 2020, a equipe girou outra vez para usar a plataforma da robótica para seleccionar milhares de amostras positivas para variações ràpida arranjando em seqüência regiões de impressão digital do genoma viral para procurar as mutações chaves.

“Foi um prazer absoluto trabalhar com Dr. Jeff Wrana e sua equipe no LTRI,” disse o Dr. Mazzulli, microbiologista-em-chefe para a rede da saúde de Sinai e da saúde da universidade (UHN). “Sua novela Espato-Segs. Sistema é tecnologia pioneiro e a capacidade da sua equipe para arranjar em seqüência as amostras COVID-19 no tempo real tem o potencial tremendo para impactar nossa compreensão da epidemiologia e da propagação de mutantes novos na província.”

A plataforma é igualmente eficaz na redução de custos. O estudo nota-a custa somente aproximadamente $8 USD pelo teste ao executar milhares de amostras imediatamente, como o custo pelas diminuições da amostra devido às economias de escala.

“É extremamente seguro e prontamente adaptável,” disse Javier Hernández, um pesquisador júnior no laboratório de Wrana que co-conduziu o estudo com afastamento cilindro/rolo. Marie-Ming Aynaud e Seda Barutcu. “A rotação é aproximadamente 24 horas. É muito simples porque nós automatizamos praticamente cada etapa no processo. Para mim, foi uma coisa muito emocionante para ver meu trabalho fazer uma diferença.”

Source:
Journal reference:

Aynaud, M. M., et al. (2021) A multiplexed, next generation sequencing platform for high-throughput detection of SARS-CoV-2. Nature Communications. doi.org/10.1038/s41467-021-21653-y.