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De plus mauvais problèmes avec les variantes SARS-CoV-2 peuvent être sur le chemin

Le coronavirus 2 (SARS-CoV-2), le virus de syndrôme respiratoire aigu sévère qui entraîne la maladie de coronavirus (COVID-19), continue à écarter mondial.  

Avec cet écart, les variantes et les tensions neuves ont apparu, constituant un danger à l'efficacité des vaccins développés récemment SARS-CoV-2 et distribués.

Les chercheurs au service des sciences biomédicales intégratrices, université de Cape Town, Afrique du Sud, ont trouvé la preuve d'une évolution important dans les forces sélectrices agissant sur les gènes immunologiquement importants SARS-CoV-2, tels que N et S. Ces vraisemblablement coïncidés avec l'émergence des lignées 501Y.

Dans l'étude, publiée dans le medRxiv* de serveur de prétirage, l'équipe a examiné des configurations des mutations qui ont apparu dans le génome SARS-CoV-2 pendant la pandémie.

Mutation SARS-CoV-2

Entre décembre 2019 et octobre 2020, l'impliqué mondial de l'évolution du virus une population neuve hautement susceptible d'hôte. Une mutation D614G (Asp614-to-Gly) dans la protéine virale de pointe a accéléré l'écart du virus.

De là, peu de mutations étaient épidémiologiquement significatives sans influencer la pathogénie de SARS-CoV-2. Cependant, ces mutations ont été caractérisées par une configuration mutationnelle de chassoir génétique fait au hasard lent et sélecteur-neutre.

Depuis octobre 2020, SARS-CoV-2 a la mutation plusieurs fois. Actuel, trois variantes écartent activement - le B.1.1.7 appelé variable BRITANNIQUE avec beaucoup de mutations en automne de 2020, du B.1.351 appelé variable sud-africain, et du Brésil P.1 appelé variable.

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Plan du génome SARS-CoV-2 indiquant l'emplacement et les modifications acides aminées codées de ce que nous avons considéré comme étant ici des mutations de signature des séquences V1, V2 et V3. Les gènes représentés avec les cases bleu-clair codent les protéines non-structurelles et les gènes dans l'orange codent des protéines de structure : S code la protéine de pointe, l'E la protéine d'enveloppe, le M la protéine de la matrice, et le N la protéine de nucleocapsid. Dans le S-gène, le domaine obligatoire de récepteur (RBD) est indiqué par une nuance plus foncée et le site où la protéine de S est fendue dans deux sous-unités pendant l'amorçage pour le grippement de récepteur et entrée de cellules sont indiquées par une ligne verticale pointillée.

La variante BRITANNIQUE écarte plus rapide et plus facile que d'autres variantes. En janvier 2021, les scientifiques ont dit que la variante pourrait être liée à un risque accru de la mort que d'autres virus variables. Elle s'est écartée à beaucoup de pays mondiaux.

La variante B.1.351 est connue pour être résistante aux effets des vaccins et des traitements contre COVID-19. En attendant, la variante P.1 a apparu dans les voyageurs du Brésil début janvier. Cette variante contient un ensemble de mutations complémentaires qui peuvent affecter sa capacité d'être décelé par des anticorps.

Dans l'étude, la variante B.1.17 ou 501Y.V1 désigné sous le nom de V1, la variante B.1.351 ou 501Y.V2 est V2, et la variante P.1 ou 501Y.V3 désigné sous le nom de V3.

Jusqu'à présent, les études proposent que les anticorps produits par la vaccination avec les vaccins approuvés identifient ces variantes, mais l'enquête postérieure est actuelle.

Emplacement des acides aminés codé par les codons qui évoluent sous le choix positif et/ou codent les modifications acides aminées convergentes entre les lignées tracées à la structure 3D de la pointe (structure d
Emplacement des acides aminés codé par les codons qui évoluent sous le choix positif et/ou codent les modifications acides aminées convergentes entre les lignées tracées à la structure 3D de la pointe (structure d'APB 7DF4 ; 47). Le récepteur ACE2 humain est montré dans bleu-clair. Des mutations de signature ne sont pas représentées à moins qu'elles soient impliquées pour être sous le choix positif. Des paires de sites qui coevolving détectable dans les différentes lignées sont jointes par les lignes des pourpres.

L'étude

L'étude a visé à déterminer la capacité évolutionnaire de SARS-CoV-2 de s'adapter aux mesures de contrôle de montée d'immunité et d'infection de population comme distancer et vaccination de social.

Les chercheurs ont examiné des configurations des mutations qui ont apparu en génomes SARS-CoV-2 pendant la pandémie.

L'équipe avait l'habitude une suite des techniques basées sur phylogenetics d'analyse de sélection naturelle pour examiner les configurations positives de choix dans les trois séquences du protéine-codage des lignées.

Les découvertes d'étude ont montré que l'émergence des lignées 501Y a approuvé un changement global considérable des signes de choix positifs. Ceci signifie une variation générale dans l'environnement sélecteur dans lequel SARS-CoV-2 évolue.

Ils ont également trouvé une variation significative dans les forces sélectrices agissant sur les gènes SARS-CoV-2. De plus, l'équipe a indiqué que l'évolution adaptative des lignées 501Y unit entre les lignées. Cette étude met en valeur l'essence du contrôle sur la façon dont les membres de la lignée 501Y évoluent les étapes assimilées pour assurer leur survie et persistance.

L'émergence subite des lignées 501Y

L'équipe a expliqué cela pendant les premiers mois de la pandémie, là n'étaient aucune mutation surgissante. C'était le rythme languissant de l'évolution virale. Le début de la pandémie était comme une crête de forme physique pour le virus au sujet de sa capacité d'infecter et transmettre entre les êtres humains.

Depuis octobre 2020, cependant, l'émergence subite des lignées 501Y a mené aux cas de montée en flèche mondiaux. Le V1, le V2, et le V3 ont entraîné la boîte de vitesses plus rapide du virus, qui a maintenant atteint 192 pays et régions.

« Vu les nombres d'infections qui s'étaient produites avant octobre, toutes ces différentes mutations, et même toutes les paires potentiellement épistatique de interaction de ces mutations, auraient surgi indépendamment, » les chercheurs expliqués.

Jusqu'à présent, le nombre de cas a atteint plus de 117 million et 2,59 millions de morts. Les Etats-Unis enregistrent le nombre le plus élevé d'infections, principal 29 millions. Les autres pays avec des cas de montée en flèche comprennent l'Inde, avec 11,22 millions de cas ; Le Brésil, avec 11 millions de cas, de la Russie, avec 4,28 millions de cas, et le R-U, avec 4,23 millions de cas.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

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Journal reference:
Angela Betsaida B. Laguipo

Written by

Angela Betsaida B. Laguipo

Angela is a nurse by profession and a writer by heart. She graduated with honors (Cum Laude) for her Bachelor of Nursing degree at the University of Baguio, Philippines. She is currently completing her Master's Degree where she specialized in Maternal and Child Nursing and worked as a clinical instructor and educator in the School of Nursing at the University of Baguio.

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