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Uns problemas mais ruins com variações SARS-CoV-2 podem estar na maneira

O coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2), o vírus que causa a doença do coronavirus (COVID-19), continua a espalhar global.  

Com esta propagação, as variações e as tensões novas emergiram, levantando uma ameaça à eficácia das vacinas SARS-CoV-2 recentemente desenvolvidas e distribuídas.

Pesquisadores no departamento de ciências biomedicáveis Integrative, universidade de Cape Town, África do Sul, evidência encontrada de uma mudança significativa nas forças selectivas actuando nos genes SARS-CoV-2 imunològica importantes, tais como N e S. Estes coincididos provavelmente com a emergência das linhagens 501Y.

No estudo, publicado no medRxiv* do server da pré-impressão, a equipe examinou testes padrões das mutações que emergiram no genoma SARS-CoV-2 durante a pandemia.

Mutação SARS-CoV-2

Entre dezembro de 2019 e outubro de 2020, a evolução do vírus no mundo inteiro envolveu uma população nova altamente suscetível do anfitrião. Uma mutação D614G (Asp614-to-Gly) na proteína viral do ponto acelerou a propagação do vírus.

De lá, poucas mutações eram epidemiològica significativas sem impactar a patogénese de SARS-CoV-2. Contudo, estas mutações foram caracterizadas por um teste padrão mutational da tracção genética aleatória lenta e selectivo-neutra.

Desde outubro de 2020, SARS-CoV-2 tem a mutação diversas vezes. Actualmente, três variações estão espalhando activamente - a variação BRITÂNICA chamada B.1.1.7 com muitas mutações na queda de 2020, o sul - a variação africana chamada B.1.351, e a variação de Brasil chamada P.1.

Mapa do genoma SARS-CoV-2 que indica os lugar e as mudanças codificadas do ácido aminado do que nós consideramos aqui ser mutações da assinatura das seqüências V1, V2 e V3. Genes representados com a luz - os blocos azuis codificam proteínas não-estruturais e os genes na laranja codificam proteínas estruturais:S codifica a proteína do ponto, o E a proteína de envelope, o M a proteína da matriz, e o N a proteína do nucleocapsid. Dentro do S-gene, o domínio obrigatório do receptor é indicado por uma máscara mais escura e pelo local onde a proteína de S é fendida em duas subunidades durante a escorva para o emperramento do receptor e entrada da pilha é indicada por uma linha vertical pontilhada.
Mapa do genoma SARS-CoV-2 que indica os lugar e as mudanças codificadas do ácido aminado do que nós consideramos aqui ser mutações da assinatura das seqüências V1, V2 e V3. Genes representados com a luz - os blocos azuis codificam proteínas não-estruturais e os genes na laranja codificam proteínas estruturais: S codifica a proteína do ponto, o E a proteína de envelope, o M a proteína da matriz, e o N a proteína do nucleocapsid. Dentro do S-gene, o domínio obrigatório do receptor (RBD) é indicado por uma máscara mais escura e pelo local onde a proteína de S é fendida em duas subunidades durante a escorva para o emperramento do receptor e entrada da pilha é indicada por uma linha vertical pontilhada.

A variação BRITÂNICA espalha mais rápido e mais fácil do que outras variações. Em janeiro de 2021, os cientistas disseram que a variação pôde ser ligada a um risco aumentado de morte do que outros vírus variantes. Espalhou a muitos países no mundo inteiro.

A variação B.1.351 é sabida para ser resistente aos efeitos das vacinas e das terapias contra COVID-19. Entrementes, a variação P.1 emergiu nos viajantes de Brasil ao princípio de janeiro. Esta variação contem um grupo de mutações adicionais que podem afectar sua capacidade para ser reconhecido por anticorpos.

No estudo, na variação B.1.17 ou 501Y.V1 é referido como V1, a variação B.1.351 ou 501Y.V2 é V2, e a variação P.1 ou 501Y.V3 é referida como V3.

Até agora, os estudos sugerem que os anticorpos produzidos com a vacinação com vacinas aprovadas reconheçam estas variações, mas a posterior investigação é em curso.

Os lugar dos ácidos aminados codificados pelos codons que estão evoluindo sob a selecção positiva e/ou codificam ácido aminado convergente mudam entre as linhagens traçadas à estrutura 3D do ponto (estrutura do PDB 7DF4; 47). O receptor ACE2 humano é mostrado na luz - azul. As mutações da assinatura não são representadas a menos que forem pressupor para estar sob a selecção positiva. Os pares de locais que coevolving detectàvel dentro das linhagens diferentes são ligados por linhas roxas.
Os lugar dos ácidos aminados codificados pelos codons que estão evoluindo sob a selecção positiva e/ou codificam ácido aminado convergente mudam entre as linhagens traçadas à estrutura 3D do ponto (estrutura do PDB 7DF4; 47). O receptor ACE2 humano é mostrado na luz - azul. As mutações da assinatura não são representadas a menos que forem pressupor para estar sob a selecção positiva. Os pares de locais que coevolving detectàvel dentro das linhagens diferentes são ligados por linhas roxas.

O estudo

O estudo apontou determinar a capacidade evolucionária de SARS-CoV-2 adaptar-se às medidas de controle de aumentação da imunidade e da infecção da população como afastar-se e vacinação do social.

Os pesquisadores examinaram testes padrões das mutações que emergiram nos genomas SARS-CoV-2 durante a pandemia.

A equipe usou uma série de técnicas phylogenetics-baseadas da análise da selecção natural para examinar testes padrões positivos da selecção dentro seqüências da proteína-codificação das três das linhagens.

Os resultados do estudo mostraram que a emergência das linhagens 501Y coincidiu com uma mudança global substancial em sinais de selecção positivos. Isto significa uma SHIFT geral no ambiente selectivo dentro de que SARS-CoV-2 está evoluindo.

Igualmente encontraram uma SHIFT significativa nas forças selectivas que actuam nos genes SARS-CoV-2. Mais, a equipe revelou que a evolução adaptável das linhagens 501Y se une entre linhagens. Este estudo destaca a essência da fiscalização em como os membros da linhagem 501Y evoluem fases similares para assegurar suas sobrevivência e persistência.

A emergência repentina das linhagens 501Y

A equipe explicou que nos primeiros meses da pandemia, não havia nenhuma mutação elevarando. Este era o ritmo lânguido da evolução viral. O começo da pandemia era como um pico da aptidão para o vírus a respeito de sua capacidade contaminar e transmitir entre seres humanos.

Desde outubro de 2020, contudo, a emergência repentina das linhagens 501Y conduziu aos casos subindo rapidamente no mundo inteiro. O V1, o V2, e o V3 causaram a transmissão mais rápida do vírus, que tem alcançado agora 192 países e regiões.

“Dado os números de infecções que tinham ocorrido daqui até outubro, todas estas mutações individuais, e mesmo todos os pares potencial epistatically de interacção destas mutações, elevarariam independente,” os pesquisadores explicados.

Até agora, o número de casos alcançou sobre 117 milhão e 2,59 milhão mortes. Os Estados Unidos relatam o número o mais alto de infecções, cobrindo 29 milhões. Os outros países com casos subindo rapidamente incluem a Índia, com 11,22 milhão casos; Brasil, com 11 milhão casos, Rússia, com 4,28 milhão casos, e o Reino Unido, com 4,23 milhão casos.

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Source:
Journal reference:
Angela Betsaida B. Laguipo

Written by

Angela Betsaida B. Laguipo

Angela is a nurse by profession and a writer by heart. She graduated with honors (Cum Laude) for her Bachelor of Nursing degree at the University of Baguio, Philippines. She is currently completing her Master's Degree where she specialized in Maternal and Child Nursing and worked as a clinical instructor and educator in the School of Nursing at the University of Baguio.

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