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A linhagem SARS-CoV-2 colombiana nova compartilha de mutações anticorpo-resistentes com outras variações

Os cientistas em Colômbia identificaram uma linhagem SARS-CoV-2 altamente divergente nova com substituições L249S e E484K do ponto. Estas mesmas mutações apareceram convergently em outras tensões do mutante do vírus, especialmente nas variações do interesse.

Uma versão da pré-impressão do artigo de investigação está disponível para ler completamente no server do medRxiv*.

A propagação e a natureza rápidas do RNA do coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) permitiram que cause tensões do mutante. Embora somente algumas variações actuais fossem do interesse real acima do vírus baixo, até agora, sobre 800 linhagens foram descritos, muitas delas que evoluem as mesmas mutações independentemente de se.

Katherine Laiton-Donato e colegas em Colômbia tem arranjado em seqüência agora uma variação altamente divergente nova, com as mutações que incluem as substituições L249S e E484K do ponto.

Estas duas substituições provavelmente são associadas com o escape imune. A presença de E484K é acreditada especialmente para ser responsável para resistir anticorpos do plasma de sangue convalescente. Estas duas mutações são associadas com as linhagens B.1.1.28 e B.1.351 (o brasileiro e para o sul - variações africanas, respectivamente), duas variações do interesse.

Árvore filogenética da linhagem nova de SARS-CoV-2 que emerge da linhagem B.1.111. A árvore foi reconstruída pela probabilidade máxima com o modelo calculado da substituição do nucleotide de GTR+F+I para o conjunto de dados de 304 genomas completos, representante das linhagens recentemente emergentes do principal. A árvore interactiva pode ser alcançada na seguinte relação: https://microreact.org/project/nFBT2K1JdjcMuEPH7u32Ar/6d9eb0c0. As estrelas vermelhas representam as seqüências que pertencem à linhagem nova.
Árvore filogenética da linhagem nova de SARS-CoV-2 que emerge da linhagem B.1.111. A árvore foi reconstruída pela probabilidade máxima com o modelo calculado da substituição do nucleotide de GTR+F+I para o conjunto de dados de 304 genomas completos, representante das linhagens recentemente emergentes do principal. A árvore interactiva pode ser alcançada na seguinte relação: https://microreact.org/project/nFBT2K1JdjcMuEPH7u32Ar/6d9eb0c0. As estrelas vermelhas representam as seqüências que pertencem à linhagem nova.

A equipe usou o algoritmo do Pangolin - uma base de dados dos genomas SARS-CoV-2 gravados - para determinar uma origem para a seqüência colombiana nova. O algoritmo atribuiu a linhagem como pertencendo à linhagem B.1.111, identificada primeiramente nos EUA ao princípio de março de 2020. Esta variação está circulando actualmente em Colômbia, em EUA, em Aruba, e em Bélgica. Uma árvore filogenética da probabilidade máxima foi usada igualmente para calcular a linhagem parental. Os resultados deste igualmente apoiaram o parentesco B.1.111. Outras mutações dentro da seqüência são igualmente consistentes com esta hipótese.

Apesar deste consenso, há ainda muitas mutações distintas actuais na tensão recentemente identificada que são divergentes de B.1.111. Os autores postulam que um tamanho da amostra maior pode bem continuar a apoiar o parentesco B.1.111. Contudo, uma explicação alternativa é que estas mutações podem convergently ter elevarado de intenso, presentemente desconhecido, pressões ecológicas.

As substituições de L249S e de E484K apareceram convergently em quase 70 tensões identificadas, e esta não é completamente sem surpresa considerando estes é ambo o provavelmente associada com resistência fornecida do anticorpo.

A emergência rápida de tensões virais anticorpo-resistentes convergentes desafiará o programa de vacinação global actual, como as mutações tais como L249S e E484K podem poder elevarar esporàdica em toda a população local dentro de qualquer país.

Os autores concluem, “no contexto da propagação da pandemia do vírus, uma população que enorme do vírus o tamanho é esperado, porque é igualmente a emergência das variações do vírus que poderiam igualmente fazer possível a emergência de mutantes anticorpo-resistentes no contexto da infecção natural em povos imuno-competentes. É necessário avaliar o impacto deste fundo genético na eficácia da neutralização dos soros convalescentes/plasma da imunidade adquirida.”

Journal reference:
Michael Burgess

Written by

Michael Burgess

Michael graduated with a first-class degree in Zoology from the University of Hull, and later received a Masters degree in Palaeobiology from the University of Bristol.

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