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El nuevo linaje colombiano SARS-CoV-2 comparte mutaciones anticuerpo-resistentes con otras variantes

Los científicos en Colombia han determinado un nuevo linaje altamente divergente SARS-CoV-2 con las substituciones L249S y E484K del pico. Estas mismas mutaciones convergently han aparecido en otras deformaciones del mutante del virus, especialmente en variantes de la preocupación.

Una versión de la prueba preliminar del trabajo de investigación está disponible para leer por completo en el servidor del medRxiv*.

La extensión y la naturaleza rápidas del ARN del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática han permitido que dé lugar a deformaciones del mutante. Aunque solamente algunas variantes actuales sean de interés real encima del virus bajo, hasta ahora, por 800 linajes se han descrito, muchos de ellos que desarrollaban las mismas mutaciones independientemente de uno a.

Katherine Laiton-Donato y colegas en Colombia ahora ha ordenado una nueva variante altamente divergente, con mutaciones incluyendo las substituciones L249S y E484K del pico.

Estas dos substituciones probablemente se asocian a escape inmune. La presencia de E484K se cree especialmente para ser responsable de resistir los anticuerpos del plasma de sangre convaleciente. Estas dos mutaciones se asocian a los linajes B.1.1.28 y B.1.351 (las variantes brasileñas y surafricanas, respectivamente), dos variantes de la preocupación.

Árbol filogenético del nuevo linaje de SARS-CoV-2 que emerge del linaje B.1.111. El árbol fue reconstruido por toda probabilidad con el modelo estimado de la substitución del nucleótido de GTR+F+I para el grupo de datos de 304 genomas integrales, representante de los linajes recientemente emergentes del principal. El árbol interactivo se puede alcanzar en el siguiente enlace: https://microreact.org/project/nFBT2K1JdjcMuEPH7u32Ar/6d9eb0c0. Las estrellas rojas representan las series que pertenecen al nuevo linaje.
Árbol filogenético del nuevo linaje de SARS-CoV-2 que emerge del linaje B.1.111. El árbol fue reconstruido por toda probabilidad con el modelo estimado de la substitución del nucleótido de GTR+F+I para el grupo de datos de 304 genomas integrales, representante de los linajes recientemente emergentes del principal. El árbol interactivo se puede alcanzar en el siguiente enlace: https://microreact.org/project/nFBT2K1JdjcMuEPH7u32Ar/6d9eb0c0. Las estrellas rojas representan las series que pertenecen al nuevo linaje.

Las personas utilizaron el algoritmo del Pangolin - una base de datos de los genomas registrados SARS-CoV-2 - para determinar un origen para la nueva serie colombiana. El algoritmo destinó el linaje como perteneciendo al linaje B.1.111, primero determinado en los E.E.U.U. a principios de marzo de 2020. Esta variante está circulando actualmente en Colombia, los E.E.U.U., Aruba, y Bélgica. Un árbol filogenético de la toda probabilidad también fue utilizado para estimar el linaje parental. Los resultados de esto también soportaron la familia B.1.111. Otras mutaciones dentro de la serie son también constantes con esta hipótesis.

A pesar de este consenso, todavía hay muchas mutaciones distintas presentes en la deformación nuevamente determinada que son divergentes de B.1.111. Los autores postulan que un tamaño de muestra más grande bien puede continuar soportar la familia B.1.111. Sin embargo, una explicación alternativa es que estas mutaciones pudieron convergently haberse presentado de intenso, actualmente desconocido, presiones ecológicas.

Las substituciones de L249S y de E484K han aparecido convergently en casi 70 deformaciones determinadas, y ésta no es poco sorprendente considerando éstos es enteramente ambo probablemente asociada con resistencia ofrecida del anticuerpo.

La aparición rápida de deformaciones virales anticuerpo-resistentes convergentes desafiará el programa de vacunación global actual, como las mutaciones tales como L249S y E484K pueden poder presentarse en cualquier población local dentro de cualquier país esporádico.

Los autores concluyen, “en el contexto de la extensión del pandémico del virus, una población enorme del virus que se prevee la talla, pues es también la aparición de las variantes del virus que podrían también hacer posible la aparición de mutantes anticuerpo-resistentes en el contexto de la infección natural en gente inmunocompetente. Es necesario evaluar el impacto de este fondo genético en la eficacia de la neutralización de los sueros convalecientes/plasma de la inmunidad detectada.”

Journal reference:
Michael Burgess

Written by

Michael Burgess

Michael graduated with a first-class degree in Zoology from the University of Hull, and later received a Masters degree in Palaeobiology from the University of Bristol.

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