Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

Los investigadores desarrollan los métodos de perfilado innovadores para la infección SARS-CoV-2

Las personas de investigadores de las diversas instituciones en los E.E.U.U. utilizaron la ARN-secuencia de datos y de otros métodos para perfilar genes únicos y otras las características asociados al coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática en New York City (NYC).

Sus conclusión podrían ayudar con la custodia de un archivo de los datos genomic que podrían ayudar en la administración de los pandémicos futuros. Los investigadores también encuentran una ventaja de usar los inhibidores de ACE o a los moldes del receptor de la angiotensina para prevenir la infección severa.

El estudio fue publicado recientemente en las comunicaciones de la naturaleza del gorrón.

Métodos

Las personas diseñaron un análisis colorimétrico minucioso 30 para evaluar la carga viral de lampazos nasales. Validaron el análisis usando dos el sintético RNAs con series igualadas a unas encontradas de los pacientes COVID-19 en Wuhan, China, y Melbourne, Australia.

El análisis fue utilizado en 201 muestras de los pacientes de NYC sospechosos de la infección COVID-19 a principios de marzo. Había un total de 69 muestras nasofaríngeas positivas del lampazo y 132 muestras que probaron la negativa. Los resultados mostraron una sensibilidad total creciente de 95,6% y la especificidad de 99,2%. Había también una sensibilidad más alta de la LÁMPARA en cargas virales más altas.

Los investigadores también desarrollaron una plataforma en grande del metatranscriptomics de la escopeta usando el ARN total que ordenaba para evaluar los diversos perfiles del ARN asociados a las muestras COVID-19. Ordenaron 857 bibliotecas de ARN-secuencia a partir de 723 muestras nasales del lampazo a partir de 669 pacientes que presentaron al hospital con gripe-como síntomas.

Las muestras nasales positivas para SARS-CoV-2 mostraron cantidades masivas de bacteriano y del ARN SARS-CoV-2 pero de cantidades de menor importancia de los hongos, del archaea, o del otro RNAs viral. Las muestras positivas tenían una abundancia de alineaciones del genoma SARS-CoV-2 comparadas a las muestras que probaron la negativa.

El sistema también tenía un de tarifa reducida de falsos negativos, con solamente 7 o 1,3% de las muestras negativas que tienen 0,01% de lee correspondiente al ARN SARS-CoV-2.

Las conclusión mostraron las diferencias de la muestra para los virus non-SARS-CoV-2 y las bacterias

Los investigadores encontraron más virus respiratorios non-SARS-CoV-2 en las muestras negativas comparado con las muestras positivas. Los pacientes con SARS-CoV-2 mostraron cantidades más inferiores de especies bacterianas, incluyendo los xylosoxidans del A., el E. faecalis, y bacteria del L.

Los aproximadamente 23% de casos virales en muestras positivas y negativas eran de la gripe A. Otros incluyeron el rinovirus A en el 16% y el metapneumovirus humano en el 12%.

Los investigadores podían también analizar el índice de co-infección entre pacientes con COVID-19. Encontraron que cerca de 3,2% de pacientes tenían series que pertenecieron a otros virus respiratorios tales como coronaviruses humanos 229E, NL63 y HKU1, gripe A, y metapneumovirus humano del mastadenovirus - sugerir una incidencia inferior del coinfection.

Más lejos probando encontró que las muestras de NYC fueron enriquecidas con un clade del clade 20C. “Investigando la distribución geográfica y temporal de las muestras del non-NYC en 20C, encontramos una distribución global con un origen probable en Europa occidental,” escribimos a los investigadores.

Observan los primeros casos COVID-19 con el clade 20c fueron encontrados en Francia, pero sobre el 70% de casos actuales de clade20 SARS-CoV-2 de marzo a mayo de 2020 estaban en NYC.

Cambios en la expresión génica causada por SARS-CoV-2

Metatranscriptomics de la escopeta también ayudado para destapar una pequeña selección de información genomic que soporta la creación de variantes heterogéneas.

La información Genomic del transcriptome del ordenador principal mostró que SARS-CoV-2 tenía cerca de 757 genes diferenciado expresados importantes relacionados con la infección. De éstos, 350 genes upregulated, y 407 genes downregulated. Un total de 8.851 genes eran considerados únicos. Las cantidades más grandes de genes diferenciado expresados en el transcriptome del ordenador principal SARS-CoV-2 fueron asociadas a tener un título viral más alto.

Entre los genes eran algunos que ascendieron actividad y aumentos antivirus en la expresión ACE2. Las disminuciones de la expresión génica fueron observadas para el TMPRSS-11B que modula incremento de la célula del pulmón y genes olfativos del camino del receptor, potencialmente explicando la baja del olor asociada a la infección COVID-19.

Uso de la medicación en respuesta a la expresión creciente ACE2

Los investigadores evaluaron 50.821 informes médicos de los pacientes sospechosos de COVID-19 y de sus resultados después de ser dado a un molde del receptor del inhibidor o de la angiotensina de ACE. Las personas proponen que estos tipos de medicaciones podrían ayudar con la expresión génica creciente ACE2 causada por el virus. Encontraron que los pacientes dados cualquier inhibidor disminuyeron el riesgo de intubación y de muerte.

Los datos transcriptomic espaciales a partir de cuatro autopsias de la gente que murió de COVID-19 mostraron la distribución de genes a través de tejidos. Encontraron lugares geométricos únicos de la expresión ACE2, la presencia de SARS-CoV-2, y altos niveles del macrófago y del neutrófilo en los pulmones.

Journal reference:
Jocelyn Solis-Moreira

Written by

Jocelyn Solis-Moreira

Jocelyn Solis-Moreira graduated with a Bachelor's in Integrative Neuroscience, where she then pursued graduate research looking at the long-term effects of adolescent binge drinking on the brain's neurochemistry in adulthood.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Solis-Moreira, Jocelyn. (2021, March 17). Los investigadores desarrollan los métodos de perfilado innovadores para la infección SARS-CoV-2. News-Medical. Retrieved on September 26, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20210317/Researchers-develop-innovative-profiling-methods-for-SARS-CoV-2-infection.aspx.

  • MLA

    Solis-Moreira, Jocelyn. "Los investigadores desarrollan los métodos de perfilado innovadores para la infección SARS-CoV-2". News-Medical. 26 September 2021. <https://www.news-medical.net/news/20210317/Researchers-develop-innovative-profiling-methods-for-SARS-CoV-2-infection.aspx>.

  • Chicago

    Solis-Moreira, Jocelyn. "Los investigadores desarrollan los métodos de perfilado innovadores para la infección SARS-CoV-2". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20210317/Researchers-develop-innovative-profiling-methods-for-SARS-CoV-2-infection.aspx. (accessed September 26, 2021).

  • Harvard

    Solis-Moreira, Jocelyn. 2021. Los investigadores desarrollan los métodos de perfilado innovadores para la infección SARS-CoV-2. News-Medical, viewed 26 September 2021, https://www.news-medical.net/news/20210317/Researchers-develop-innovative-profiling-methods-for-SARS-CoV-2-infection.aspx.