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I ricercatori mettono a punto il metodo rapido per l'identificazione dei mutanti anticorpo-resistenti SARS-CoV-2

I ricercatori negli Stati Uniti hanno descritto un metodo rapido novello per l'identificazione dei mutanti anticorpo-resistenti in coronavirus 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo.

SARS-CoV-2 è l'agente causativo di fondo della pandemia globale di malattia 2019 (COVID-19) di coronavirus, in primo luogo identificata a Wuhan, la Cina, nel dicembre 2019. Da allora, le varianti multiple del virus sono sorto con determinate mutazioni permettendoli di essere più ereditari, o di sfuggire alla neutralizzazione dagli anticorpi.

Queste mutazioni di fuga sono di preoccupazione primaria, poichè gli sforzi virali anticorpo-resistenti possono drasticamente diminuire l'efficacia delle terapie correnti dell'anticorpo e del vaccino.

Ora, un gruppo degli scienziati all'università di colorado ed altre istituzioni riferiscono un metodo di vagliatura del lievito che può essere usato per identificare rapido i mutanti di fuga per gli anticorpi di neutralizzazione (acchiappa).

Abbiamo identificato i mutanti di fuga per cinque acchiappiamo, compreso tre dalla classe pubblica VHC-53 di germline suscitata tramite l'infezione naturale COVID-19,„ dica gli autori. “Forniamo le librerie, i metodi ed il software come risorsa apertamente disponibile della comunità per accelerare le nuove strategie terapeutiche contro SARS-CoV-2.„

Una versione della pubblicazione preliminare della pubblicazione è a disposizione per leggere completamente sul bioRxiv*server.

Che cosa i ricercatori hanno fatto?

La comprensione i ruoli e delle funzioni delle mutazioni SARS-CoV-2 svolgerà un ruolo enorme nello sviluppo dei vaccini, dei ripetitori e delle terapie sufficienti dell'anticorpo. La sola proteina virale della membrana responsabile dell'entrata delle cellule è la proteina della punta (s), che lega ai host attraverso il dominio dell'ricevitore-associazione (RBD). I ricercatori hanno desiderato sviluppare un'analisi funzionale della selezione che avrebbe potuta identificare acchiappa i mutanti di fuga ad una larga scala.

Una piattaforma della visualizzazione della superficie del lievito di S (YSD) RBD è stata creata e collaudato stata per misurare e predire il escapability di RBD. Con la prova con un comitato di undici anticorpi anti--s di RDB, potevano concludere che (ad eccezione dell'epitopo S309), la piattaforma del lievito poteva “fedelmente„ emula le interazioni obbligatorie degli anticorpi di neutralizzazione con la S RBD.

I ricercatori allora tentati per identificare i mutanti di fuga di S RBD, facendo uso di cinque acchiappa che potevano bloccare l'associazione ACE2 da SARS-CoV-2. Hanno identificato 97 mutantations di S RBD negli pseudoviruses SARS-CoV-2 che potrebbero sfuggire al riconoscimento almeno da un anticorpo di neutralizzazione. Principalmente, le mutazioni F486I, E484K, T478R, K417N, K417T e D420K potevano completamente sfuggire alla neutralizzazione dagli anticorpi comuni e concordata con gli studi precedenti che confermano che la mutazione di N501Y - presente in molte varianti di preoccupazione - non ha avuta ruolo nella fornitura della resistenza dell'anticorpo, probabilmente invece aumentante l'affinità obbligatoria per ACE2.

Questi risultati sono stati conferiti facendo uso delle repliche biologiche da una biblioteca pubblica delle varianti SARS-CoV-2, confermante che i mutanti di fuga hanno avuti tariffe più basse della resistenza agli anticorpi che altre varianti.

Che cosa fa questa media?

Gli autori riferiscono alcuni vantaggi importanti al del metodo di vagliatura basato a lievito. Vale a dire, quello il metodo può imitare precisamente l'infezione virale e l'associazione dell'anticorpo, ma ulteriormente fornisce un luogo di lavoro sicuro, l'identificazione relativamente veloce dei mutanti di fuga come pure un algoritmo di identificazione “robusto e rigoroso„ di questi mutanti.

Il gruppo presenta questo nuovo metodo di vagliatura del lievito come risorsa apertamente disponibile della comunità per gli scienziati all'aiuto nell'accelerazione dello sviluppo delle strategie terapeutiche contro SARS-CoV-2 e come nuovo strumento nell'identificazione delle mutazioni acchiappare-resistenti specifiche.

Avviso importante

il bioRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

Journal reference:
Michael Burgess

Written by

Michael Burgess

Michael graduated with a first-class degree in Zoology from the University of Hull, and later received a Masters degree in Palaeobiology from the University of Bristol.

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