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L'étude vérifie comment les variants génétiques contribuent au risque accru du cancer de poumon

Le cancer de poumon est la principale cause de décès par cancer aux États-Unis pour des hommes et des femmes. Tandis que le risque pour cette maladie peut être influencé par ambiant et le mode de vie factorise comme le fumage, estimation d'études que 18% de cas de cancer de poumon sont dus aux variants génétiques hérités. La recherche neuve aboutie par l'université de Baylor du médicament vérifie comment les variants génétiques contribuent au risque accru du cancer de poumon.

Les chercheurs ont exécuté l'exome entier ordonnançant sur la lignée germinale ADN (hérité) de huit ensembles de données de grande puissance, y compris 1.045 patients avec des antécédents familiaux de cancer de poumon ou de cancer de tôt-début. Ces groupes sont pour héberger des variantes de risque génétique. L'analyse a également compris 885 cas de contrôle.

Nous recherchions les variantes qui ont relativement un à haute impression sur le risque mais nous produisons relativement à basse fréquence. Si une variante se produit à la basse fréquence, vous devez regarder beaucoup de différents grands points d'émission de données pour valider la variante. Ces résultats peuvent être reproduits dans beaucoup de différentes populations européennes. »

M. Chris Amos, auteur correspondant, professeur de médecine - les sciences d'épidémiologie et de population et directeur, institut pour la recherche clinique et de translation (ICTR) chez Baylor

Les chercheurs ont recensé 25 variantes pathogènes rares neuves liées à la susceptibilité de cancer de poumon et ont validé cinq de ces variantes. De ces cinq, deux gènes impliqués de variantes avec les liens connus au risque de cancer de poumon, ATM et MPZL2. Trois gènes de susceptibilité nouveaux impliqués de cancer de poumon de variantes, POMC, STAU2 et MLNR. Selon le Co-premier auteur de l'étude, M. Yanhong Liu, ordonnancement d'exome a permis aux chercheurs de recenser plus de variantes qui influencent des protéines et le fonctionnement de cellules.

Vérifier la cotisation des mises en place ou des omissions

Les « mutations de l'ADN où des parties ou sont insérées ou effacé ont été comparé understudied pour choisir des variantes de nucléotide, mais elles sont également très importantes parce qu'elles peuvent avoir comme conséquence les protéines tronquées, » ont dit Liu, professeur adjoint de médicament - les sciences d'épidémiologie et de population et membre du Dan L centre de lutte contre le cancer complet de Duncan chez Baylor. « Des 25 variantes de candidat que nous avons recensées, deux-tiers d'entre elles sont des mises en place ou des omissions. »

Afin de comprendre davantage l'effet de ces variantes de candidat sur des fonctions cellulaires, les chercheurs de Baylor ont appliqué les analyses endogènes des dégâts d'ADN, qui déterminent des réplications de certains types de mutations dans l'ADN. Ils ont présumé que les gènes de risque de cancer de poumon mènent à un plus grand niveau des dégâts endogènes d'ADN en cellules, menant à l'instabilité génomique et entraînant éventuel le cancer.

« Beaucoup d'études ont regardé des gènes de risque de cancer de poumon, mais le fonctionnement de ces gènes n'a pas été bien compris. Dans notre étude, nous avons constaté que le dysregulation ou les mutations en ces gènes candidats montrés a augmenté les dégâts d'ADN, proposant que leur rôle potentiel de cancérigène pourrait être dû à l'instabilité de génome au niveau d'ADN, » a dit M. juin Xia, Co-premier auteur de l'étude et associé post-doctoral dans le service de moléculaire et génétique humaine et ICTR chez Baylor.

L'analyse a prouvé que les variantes de POMC, de MLNR et d'ATM menées aux plus grands niveaux de l'ADN endommagent. L'ATM est connu pour être un premier répondeur critique aux dégâts d'ADN, et plusieurs variantes d'ATM sont liées à la susceptibilité accrue pour des cancers multiples. Selon les AMOs, quelle cause de variantes a augmenté les dégâts de compréhension d'ADN pourraient être principaux à débloquer des demandes de règlement pour ces cancers.

« Nous savons du cancer du sein que des inhibiteurs de PARP, les médicaments qui évitent la réparation de l'ADN, le travail dans les gens avec le BRCA1 hérité et les mutations BRCA2 parce que ces cellules ont déjà quelques dégâts d'ADN dus à la mutation héritée. Si vous désactivez PARP, les cellules cancéreuses ne peuvent pas réparer les dégâts d'ADN et ne survivront pas, » a dit les AMOs, membre du Dan L centre de lutte contre le cancer complet de Duncan à Baylor et à chercheur de CPRIT. « Il est possible que les gens avec des mutations héritées d'ATM les faisant développer le cancer de poumon puissent répondre à ces inhibiteurs de PARP aussi bien, et c'est quelque chose qui doit être étudié davantage. »

Source:
Journal reference:

Liu, Y., et al. (2021) Rare deleterious germline variants and risk of lung cancer. npj Precision Oncology. doi.org/10.1038/s41698-021-00146-7.