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O estudo revela como SARS-CoV-2 espalhou em Wuhan antes do lockdown

Usando ferramentas datando moleculars e simulações epidemiológicas, os pesquisadores na Faculdade de Medicina de San Diego da Universidade da California, com os colegas na Universidade do Arizona e no Illumina, Inc., calcularam que o vírus SARS-CoV-2 era circulação provável indetectado para no máximo dois meses antes que os primeiros exemplos humanos de COVID-19 estiveram descritos em Wuhan, China dentro tarde em dezembro de 2019.

Escrevendo na introdução em linha do 18 de março de 2021 da ciência, igualmente notam que suas simulações sugerem que o vírus se transformando morra para fora naturalmente mais de três quartos do tempo sem causar uma epidemia.

Nosso estudo foi projectado responder à pergunta de quanto tempo poderia SARS-CoV-2 ter circulado em China antes que se estêve descoberto.”

Joel O. Wertheim, PhD, estuda o autor superior e o professor adjunto, a divisão de doenças infecciosas e saúde pública global, Faculdade de Medicina, Universidade da California San Diego

“Para responder a esta pergunta, nós combinamos três fragmentos de informação importantes: uma compreensão detalhada de como SARS-CoV-2 espalhou em Wuhan antes do lockdown, na diversidade genética do vírus em China e em relatórios dos exemplos os mais adiantados de COVID-19 em China. Combinando estas linhas díspares de evidência, nós podíamos pôr um limite superior de em meados de outubro de 2019 para quando SARS-CoV-2 começou circular na província de Hubei.”

Os casos de COVID-19 foram relatados primeiramente dentro tarde em dezembro de 2019 em Wuhan, situado na província de Hubei da China Central. O vírus espalhou rapidamente além de Hubei. As autoridades chinesas cordoned fora da região e executaram medidas da mitigação por todo o país. Daqui até abril de 2020, a transmissão local do vírus estava sob o controle mas, até lá, COVID-19 era pandémico com os mais de 100 países que relatam casos.

SARS-CoV-2 é um coronavirus zoonotic, acreditado para ter saltado de um anfitrião animal desconhecido aos seres humanos. Os esforços numerosos foram feitos para identificar quando o vírus começou primeiramente a espalhar entre seres humanos, com base em investigações de caixas cedo-diagnosticadas de COVID-19. O primeiro conjunto de casos -- e os genomas SARS-CoV-2 arranjados em seqüência os mais adiantados -- foram associados com o mercado da venda por atacado do marisco de Huanan, mas os autores do estudo dizem que o conjunto do mercado é pouco susceptível de ter marcado o começo da pandemia porque os casos COVID-19 documentados os mais adiantados não tiveram nenhuma conexão ao mercado.

Os relatórios regionais do jornal sugerem os diagnósticos COVID-19 em Hubei datem pelo menos do 17 de novembro de 2019, sugerindo que o vírus já esteja circulando activamente quando as autoridades chinesas decretaram protecções sanitárias públicas.

No estudo novo, os pesquisadores usaram análises evolucionárias do pulso de disparo molecular para tentar dirigir dentro em quando as primeiras, ou o deslocamento predeterminado, caso de SARS-CoV-2 ocorreram. “O pulso de disparo molecular” é um termo para uma técnica que use a taxa da mutação de genes para deduzir quando dois ou mais formulários de vida divergiram -- neste caso, quando o antepassado comum de todas as variações de SARS-CoV-2 existiu, calculado neste estudo a meados de novembro de 2019.

Datar molecular do antepassado comum o mais recente é tomado frequentemente para ser sinónimo com o exemplo do deslocamento predeterminado de uma doença emergente. Contudo, disse o co-autor Michael Worobey, PhD, professor da ecologia e da biologia evolutiva na Universidade do Arizona: “O exemplo do deslocamento predeterminado pode concebìvel pre-datar o antepassado comum -- o primeiro exemplo real desta manifestação pode ter dias ocorridos, semanas ou mesmo muitos meses antes do antepassado comum calculado. Determinar o comprimento desse “fusível filogenética” era no centro de nossa investigação.”

Baseado neste trabalho, os pesquisadores calculam que o número mediano de pessoas contaminadas com o SARS-CoV-2 em China era menos de um até o 4 de novembro de 2019. Treze dias mais tarde, era quatro indivíduos, e apenas nove o 1º de dezembro de 2019. As primeiras hospitalizações em Wuhan com uma circunstância identificada mais tarde como COVID-19 ocorreram em meados de dezembro.

Os autores do estudo usaram uma variedade de ferramentas analíticas para modelar como o vírus SARS-CoV-2 pode se ter comportado durante a manifestação e o princípio iniciais da pandemia quando era pela maior parte uma entidade desconhecida e o espaço da ameaça da saúde pública realizada não ainda inteiramente.

Estas ferramentas incluíram as simulações epidémicas baseadas na biologia conhecida do vírus, tal como seu transmissibility e outros factores. Em apenas 29,7 por cento destas simulações era o vírus capaz de criar epidemias auto-alimentadas. Em outros 70,3 por cento, o vírus contaminou relativamente poucas pessoas antes de morrer para fora. A epidemia falhada média terminou apenas oito dias após o exemplo do deslocamento predeterminado.

“Tipicamente, os cientistas usam a diversidade genética viral para obter o sincronismo de quando um vírus começou espalhar,” disseram Wertheim. “Nosso estudo adicionou uma camada crucial sobre esta aproximação modelando quanto tempo o vírus poderia ter circulado antes de causar a diversidade genética observada.

“Nossa aproximação rendeu alguns resultados surpreendentes. Nós vimos que sobre dois terços das epidemias que nós tentamos simular foi extinto. Isso significa que se nós poderíamos ir para trás a tempo e repetir 2019 cem vezes, dois de três vezes, COVID-19 acabaria no seus próprios sem inflamar uma pandemia. Isto que encontra apoia a noção que os seres humanos estão sendo bombardeados constantemente com micróbios patogénicos zoonotic.”

Wertheim notou que mesmo enquanto SARS-CoV-2 estava circulando em China na queda de 2019, o modelo dos pesquisadores sugere que fizesse assim a baixos níveis até pelo menos dezembro desse ano.

“Dado isso, é duro reconciliar estes baixos níveis de vírus em China com reivindicações das infecções em Europa e os E.U. ao mesmo tempo,” Wertheim disse. “Eu sou bastante céptico das reivindicações de COVID-19 fora de China naquele tempo.”

A tensão original de SARS-CoV-2 tornou-se epidémica, os autores escrevem, porque foi dispersada extensamente, que favorece a persistência, e porque prosperou nas áreas urbanas onde a transmissão era mais fácil. Nas epidemias simuladas que envolvem as comunidades rurais menos densas, as epidemias foram 94,5 a 99,6 por cento extintos do tempo.

O vírus tem transformado desde épocas múltiplas, com um número de variações que tornam-se mais transmissíveis.

“A fiscalização pandémica não foi preparada para um vírus como SARS-CoV-2,” Wertheim disse. “Nós procurávamos o SARS ou o MERS seguinte, algo que matou povos em uma taxa alta, mas na retrospectiva, nós vemos como um vírus altamente transmissível com uma taxa de mortalidade modesta pode igualmente colocar o ponto baixo do mundo.”

Source:
Journal reference:

Pekar, J., et al. (2021) Timing the SARS-CoV-2 index case in Hubei province. Science. doi.org/10.1126/science.abf8003.