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El estudio revela cómo SARS-CoV-2 se extendió en Wuhan antes del lockdown

Usando las herramientas moleculares de la datación y las simulaciones epidemiológicas, los investigadores en la Facultad de Medicina de San Diego de la Universidad de California, con los colegas en la Universidad de Arizona y Illumina, Inc., estiman que el virus SARS-CoV-2 era circulación probable desapercibida para a lo más dos meses antes de que los primeros casos humanos de COVID-19 fueron descritos en Wuhan, China hacia adentro tarde diciembre de 2019.

Escribiendo en la aplicación en línea del 18 de marzo de 2021 la ciencia, también observan que sus simulaciones sugieren que el virus que se transforma muera fuera naturalmente más de tres cuartos del tiempo sin causar una epidemia.

Nuestro estudio fue diseñado para contestar a la cuestión de cuánto tiempo habría podido SARS-CoV-2 circular en China antes de que fuera descubierto.”

Joel O. Wertheim, doctorado, estudia al autor mayor y profesor adjunto, división de enfermedades infecciosas y salud pública global, Facultad de Medicina, Universidad de California San Diego

“Para contestar a esta pregunta, combinamos tres fragmentos de información importantes: una comprensión detallada de cómo SARS-CoV-2 se extendió en Wuhan antes del lockdown, la diversidad genética del virus en China y los partes de los casos más tempranos de COVID-19 en China. Combinando estas líneas dispares de las pruebas, podíamos poner un límite superior de mediados de octubre de 2019 para cuando SARS-CoV-2 comenzó a circular en la provincia de Hubei.”

Los casos de COVID-19 primero fueron denunciados hacia adentro tarde diciembre de 2019 en Wuhan, situado en la provincia de Hubei de China central. El virus se extendió rápidamente más allá de Hubei. Las autoridades chinas cordoned de la región y ejecutaron dimensiones de la mitigación por toda la nación. En abril de 2020, la transmisión local del virus estaba bajo mando pero, para entonces, COVID-19 era pandémico con más de 100 países que denunciaban casos.

SARS-CoV-2 es un coronavirus zoonótico, creído para haber saltado de un ordenador principal animal desconocido a los seres humanos. Se han hecho los esfuerzos numerosos de determinar cuando el virus primero comenzó a extenderse entre seres humanos, sobre la base de investigaciones de cajas temprano-diagnosticadas de COVID-19. El primer atado de casos -- y los genomas ordenados más tempranos SARS-CoV-2 -- fueron asociados al mercado de la venta al por mayor de los mariscos de Huanan, pero los autores del estudio dicen que el atado del mercado es poco probable haber marcado el principio del pandémico porque los casos documentados más tempranos COVID-19 no tenían ninguna conexión al mercado.

Los partes regionales del periódico sugieren las diagnosis COVID-19 en Hubei daten por lo menos del 17 de noviembre de 2019, sugiriendo que el virus ya circulaba activamente cuando las autoridades chinas decretaron medidas sanitarias públicas.

En el nuevo estudio, los investigadores utilizaron análisis evolutivos del reloj molecular para intentar dirigirse hacia adentro en cuando ocurrieron los primeros, o el índice, caso de SARS-CoV-2. El “reloj molecular” es un término para una técnica que utilice el índice de la mutación de genes para deducir cuando divergieron dos o más formas de vida -- en este caso, cuando existió el antepasado común de todas las variantes de SARS-CoV-2, estimado en este estudio al ya en mediados de noviembre de 2019.

La datación molecular del antepasado común más reciente se toma a menudo para ser sinónima con el caso del índice de una enfermedad emergente. Sin embargo, dijo al co-autor Michael Worobey, doctorado, profesor de la ecología y de la biología evolutiva en la Universidad de Arizona: “El caso del índice puede concebible preceder al antepasado común -- el primer caso real de este brote puede tener días ocurridos, semanas o aún muchos meses antes del antepasado común estimado. La determinación del largo de ese “fusible filogenético” estaba en el corazón de nuestra investigación.”

De acuerdo con este trabajo, los investigadores estiman que el número mediano de personas infectadas con SARS-CoV-2 en China era menos de uno hasta el 4 de noviembre de 2019. Trece días después, era cuatro individuos, y apenas nueve el 1 de diciembre de 2019. Las primeras hospitalizaciones en Wuhan con una condición determinada más adelante como COVID-19 ocurrieron a mediados de diciembre.

Los autores del estudio utilizaron una variedad de herramientas analíticas para modelar cómo el virus SARS-CoV-2 pudo haberse comportado durante el brote y los comienzos iniciales del pandémico cuando era en gran parte una entidad desconocida y la extensión de la amenaza de la salud pública observada no todavía completo.

Estas herramientas incluyeron las simulaciones epidémicas basadas en la biología sabida del virus, tal como su transmisibilidad y otros factores. En el apenas 29,7 por ciento de estas simulaciones era el virus capaz de crear epidemias independientes económicamente. En el otro 70,3 por ciento, el virus infectó a relativamente pocas personas antes de morir fuera. La epidemia fallada media terminó apenas ocho días después del caso del índice.

“Típicamente, los científicos utilizan la diversidad genética viral para conseguir la sincronización de cuando un virus comenzó a extenderse,” dijeron a Wertheim. “Nuestro estudio agregó una capa crucial encima de esta aproximación modelando cuánto tiempo el virus habría podido circular antes de dar lugar la diversidad genética observada.

“Nuestra aproximación rindió algunos resultados asombrosamente. Vimos que sobre dos tercios de las epidemias que tentativa simular iba extinto. Eso significa que si podríamos volver a tiempo y relanzar 2019 cientos veces, dos fuera de tres veces, COVID-19 se habría esfumado en sus el propio sin encender un pandémico. Esto que encuentra soporta la noción que están bombardeando a los seres humanos constante con los patógeno zoonóticos.”

Wertheim observó que incluso durante SARS-CoV-2 circulaba en China en la caída de 2019, el modelo de los investigadores sugiere que hiciera tan en los niveles bajos hasta por lo menos diciembre de ese año.

“Dado eso, es duro reconciliar estos niveles bajos del virus en China con reclamaciones de infecciones en Europa y los E.E.U.U. al mismo tiempo,” Wertheim dijo. “Soy muy escéptico de reclamaciones de COVID-19 fuera de China en aquel momento.”

La deformación original de SARS-CoV-2 llegó a ser epidémica, los autores escriben, porque fue dispersada extensamente, que favorece persistencia, y porque prosperó en zonas urbanas donde estaba más fácil la transmisión. En las epidemias simuladas que implicaban a comunidades rurales menos densas, las epidemias iban el 94,5 a 99,6 por ciento extinto del tiempo.

El virus ha transformado desde entonces épocas múltiples, con varias variantes llegando a ser más transmisibles.

La “vigilancia pandémica no fue preparada para un virus como SARS-CoV-2,” Wertheim dijo. “Buscábamos el SARS o el MERS siguiente, algo que mató a gente a una alta tasa, pero restrospectivamente, vemos cómo un virus altamente transmisible con una tasa de mortalidad modesta puede también poner el ciclón del mundo.”

Source:
Journal reference:

Pekar, J., et al. (2021) Timing the SARS-CoV-2 index case in Hubei province. Science. doi.org/10.1126/science.abf8003.