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Variações novas do genoma SARS-CoV-2 identificadas no vison dos E.U.

Os pesquisadores em Canadá descobriram duas variações novas no coronavirus da Síndrome Respiratória Aguda Grave 2 seqüências do gene (SARS-CoV-2) recolhidas do vison nos Estados Unidos.

O vírus SARS-CoV-2 é o agente responsável para a pandemia da doença 2019 do coronavirus (COVID-19) que reivindicou agora as vidas de mais de 2,78 milhões de pessoas global.

A equipe identificou uma variação da dois-mutação (N501T-G142D) e uma variação da três-mutação (N501T-G142D-F486L) na proteína do ponto SARS-CoV-2 - a estrutura que principal o vírus se usa para ligar a e contaminar pilhas.

O domínio receptor-obrigatório (RBD) dos diplomatas do ponto à enzima deconversão 2 do receptor da pilha de anfitrião (ACE2) para permitir a entrada viral da fusão e da pilha.

As duas variações não foram encontradas nas seqüências vison-derivadas do gene SARS-CoV-2 recolhidas em nenhuns outros países.

Hugh Cai da universidade de Guelph em Ontário e Allison Cai da universidade de Ingleses Colômbia disseram que os resultados sugerem que as variações evoluíssem durante a infecção humana antes que espalharam às populações do vison.

A equipe diz que é vital monitorar as variações novas emergentes para determinar seu impacto na sanidade animal do ser humano e.

Uma versão da pré-impressão do artigo de investigação está disponível no server do medRxiv*, quando o artigo se submeter à revisão paritária.

Estudo: As variações do gene da proteína do ponto SARS-CoV-2 com mutação de N501T e de G142D dominaram infecções nos visons nos E.U. Crédito de imagem: Gallinago_media/Shutterstock
Estudo: Variações do gene da proteína do ponto SARS-CoV-2 com infecções dominadas mutação de N501T e de G142D nos visons nos E.U. Crédito de imagem: Gallinago_media/Shutterstock

O vírus evoluiu ràpida mutações na proteína do ponto

Desde que a primeira seqüência SARS-CoV-2 foi isolada das amostras recolhidas em Wuhan, China, em dezembro de 2019, o vírus evoluiu ràpida as mutações da proteína do ponto que aumentaram seus transmissibility e virulência.

O 17 de março de 2021th , 22% dos genomas SARS-CoV-2 dentro da base de dados de GISAID (iniciativa global em compartilhar todos os dados da gripe) conteve a mutação de N501Y. Esta variação foi identificada na proteína do ponto das linhagens mais transmissíveis e potencial mais virulentos que emergiram recentemente no Reino Unido (B.1.1.7), em África do Sul (B.1.351), e em Brasil (B.1.525).

Em Dinamarca, um grande número o vison foi encontrado igualmente para ser contaminado com o SARS-CoV-2 que contem a mutação Y453F do ponto, que provocou interesses que esta variação poderia ser espalhada dos animais aos seres humanos.

O espaço temporal emergente (abaixo do espaço temporal) da proteína humano-derivada (acima do espaço temporal) e vison-derivada N501T-G142D do ponto SARS-CoV-2 e das variações de N501T-G142D-F486L nos E.U. A escala do espaço temporal não está na proporção.
O espaço temporal emergente (abaixo do espaço temporal) da proteína humano-derivada (acima do espaço temporal) e vison-derivada N501T-G142D do ponto SARS-CoV-2 e das variações de N501T-G142D-F486L nos E.U. A escala do espaço temporal não está na proporção.

Que os pesquisadores fizeram?

Os pesquisadores expor para determinar as características genéticas das seqüências da proteína do ponto SARS-CoV-2 recolhidas do vison nos Estados Unidos e no Canadá.

A equipe analisou todas as seqüências SARS-CoV-2 animal-derivadas (977), todas as seqüências recolhidas em Canadá (19.529), e todas as seqüências recolhidas nos Estados Unidos (173.277) que estiveram depositados em GISAID entre dezembro de 2019 e o 12 de março de 2021th .

SARS-CoV-2 o isolado Wuhan-Hu-1 recolhido o 19 de dezembro de 2019 foi usado como uma referência para a análise da mutação.

A função da “EXPLOSÃO” do software “Geneious” da bioinformática foi usada para determinar localmente e global a incidência de todas as mutações novas.

Que a análise revelou?

Nem a mutação compartilhada pelo Reino Unido, sul de N501Y - o africano, e as variações de Brasil nem a mutação de Y453F identificada entre o vison em Dinamarca estaram presente em alguns dos E.U. e o canadense vison-derivou as seqüências SARS-CoV-2.

Contudo, a equipe identificou duas variações novas dominantes nas seqüências da proteína do ponto recolhidas do vison nos E.U. - a mutação dobro N501T-G142D e a mutação tripla N501T-G142D-F486L.

As variações não foram encontradas nas seqüências recolhidas do vison em Canadá ou em nenhum outro país.

Para determinar a origem das variações novas, os pesquisadores analisaram todas as seqüências SARS-CoV-2 humano-derivadas recolhidas dos E.U. e do Canadá.

Isto revelou que a mutação de N501T (sem G142D ou F486L) estou presente nas seqüências humano-derivadas E.U. recolhidas já em agosto de 2020 - dois meses antes de quando as seqüências vison-derivadas foram recolhidas (em outubro de 2020).

A equipe igualmente disse que as variações de N501T-G142D e de N501T-G142D-F486L estiveram identificadas nas seqüências humano-derivadas antes que estiveram identificadas nas seqüências vison-derivadas.

Que são as implicações do estudo?

“Os resultados deste estudo indicam que as variações novas podem ter evoluído durante a infecção humana e então transmitido às populações do vison nos E.U.,” escrevem a equipe.

Os pesquisadores dizem que a ocorrência destas variações novas nas autorizações da população do vison estuda mais para estabelecer como podem ter afectado a interacção do ponto com ACE2 e, conseqüentemente, transmissibility viral, virulência, e imunogenicidade nos seres humanos e no vison.

“É importante monitorar as variações novas emergentes e para determinar seu impacto na sanidade animal do ser humano e,” concluem.

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

Citations

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