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Correspondencia lineal del epitopo de la proteína del pico SARS-CoV-2

La proteína del pico del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática ha sido el objetivo principal de muchos los esfuerzos del descubrimiento de la droga y se utiliza semejantemente en cada uno de las vacunas aprobadas COVID-19 para sacar la generación de anticuerpos de la proteína del anti-pico, inmunidad de tal modo de concesión.

El dominio receptor-obligatorio de la proteína del pico SARS-CoV-2, particularmente, es el objetivo de la mayoría de la terapéutica y es el antígeno mayor contra el cual el virus-ordenador principal genera naturalmente los anticuerpos de neutralización. Sin embargo, otras regiones de la proteína del pico y de la mayor estructura de la subunidad de la proteína a las cuales pertenece también se han demostrado para sacar la producción de anticuerpos específicos a ellos, algunos de los cuales están neutralizando fuertemente hacia la función vital del virus.

Las inquietudes adicionales con respecto a los fenómenos conocidos como aumento con dependencia de los anticuerpos se han despertado, en el cual las concentraciones inferiores de anticuerpos de no-neutralización pueden, de hecho, ayudar al virus sobre la agregación ofreciendo un hydrophobicity favorable y cargar que permitan una mejor penetración de la membrana celular.

Semejantemente, se han despertado las inquietudes que las vacunas podrían en algunos casos ofrecer un mecanismo similar para aumentar virulencia, como se han observado en algunas vacunas tempranas del desactivar-virus en el pasado. Además directamente de influenciar el movimiento de partículas virales a través de las membranas celulares, tales anticuerpos de no-neutralización se pueden también cegar el acceso a los anticuerpos de neutralización a los puntos de enlace o producir a favor de mejores anticuerpos de neutralización. Por lo tanto, determinar los anticuerpos de no-neutralización que pueden competir con los anticuerpos de neutralización para el espacio en la proteína del pico del objetivo SARS-CoV-2 sería beneficioso.

En un trabajo de investigación cargado por teletratamiento recientemente a los partes de la célula por Li y otros (12 de marzo de 2021th) la proteína completa del pico SARS-CoV-2 que se correlaciona el paisaje lineal del epitopo basó en las muestras cerco sobre de 1.000 pacientes, revelando dos regiones ricas en epitopos lineales y correlacionando la variedad de anticuerpos generados en un paciente con severidad de la enfermedad.

Identificación de epitopos lineales

El grupo sintetizó 211 péptidos que consistían en 12 aminoácidos cada uno, atravesando el integral de la proteína del pico SARS-CoV-2, y lo ejecutó en un microarray del péptido.

Los sueros sobre de 1.000 pacientes positivos COVID-19 y de 500 voluntarios sanos fueron probados contra el arsenal, y las intensidades de la señal trazaron describir la acción recíproca entre los péptidos y cualquier anticuerpo conveniente presentes dentro de las muestras.

Dieciséis péptidos de interés fueron determinados entre de estos 211, interesante con ningunos que originaban del dominio receptor-obligatorio de la proteína del pico, generalmente la región apuntada.

La presencia de N-glycosylation no redujo la reacción de estos epitopos, indicando que las condiciones ines vitro estudiadas no afectaron el resultado.

Las muestras todas cerco de los pacientes COVID-19 15 días que seguían inicio del síntoma, como éste es probablemente el escenario en el cual los platillos de la infección SARS-CoV-2. Estas muestras exhibieron un mayores número y variedad de epitopos responsivos que el grupo de mando y más a fondo fueron categorizadas basado en severidad de la enfermedad. Los individuos con la infección severa SARS-CoV-2 exhibieron un número y una variedad notablemente más importantes de epitopos responsivos, y estas figuras correlacionan fuertemente con el título del pico IgG proteína-específico en sueros, demostrando que la presencia de epitopos derivados proteína del pico contribuye a la inmunorespuesta proteína-específica del pico, como se esperaba. Las tendencias en la población del epitopo también fueron observadas que basado en edad, el sexo, y otros parámetros clínicos tales como linfocito cuentan.

Aumentando la sensibilidad del péptido ensaye al grupo podía determinar varios epitopos lineales en el dominio receptor-obligatorio de la proteína del pico, y los anticuerpos que los apuntan. Sin embargo, utilizar estos anticuerpos contra la proteína integral del pico de SARS-CoV-2 reveló poca afinidad, que el grupo sugiere es debido a la naturaleza altamente conformación-relacionada de los epitopos receptor-obligatorios del dominio.

Anticuerpos que apuntan epitopos lineales

El grupo cerco además muestras de los sueros de pacientes durante varias semanas y rastreó los niveles de anticuerpos hacia la proteína del pico y otros epitopos específicamente determinados. Interesante, la proteína IgG del pico fue encontrada para disminuir comparativamente despacio a lo largo de 40 días comparados con los anticuerpos contra los epitopos lineales determinados aquí, que se eliminan casi totalmente por el día 30. Un lazo ligero fue observado entre estos valores. Los autores sugieren que la disminución de anticuerpos contra algunos epitopos pueda contribuir posteriormente al cese en la producción de pico IgG proteína-específico.

Los 14 epitopos lineales más importantes determinados en este estudio, la mayoría cuyo estuvo tenido demostrado para sacar la producción de un anticuerpo específico, entonces fue probado en un modelo murine. Los ratones fueron inmunizados con una selección de los péptidos para permitir que la producción del anticuerpo ocurra, y después los sueros cerco y fueron aplicados a los análisis de la neutralización SARS-CoV-2. Algunos de los epitopos lineales podían inducir solamente actividad suave de la neutralización en los sueros, mientras que el resto no sacó ninguna actividad, incluyendo los epitopos lineales originarios del dominio receptor-obligatorio de la proteína del pico, demostrando el papel vital de la conformación en el reconocimiento del anticuerpo. La concentración de anticuerpos hacia estos epitopos es muy inferior en los sueros comparados con los anticuerpos más influyentes que apuntan el dominio receptor-obligatorio. Sin embargo, el enriquecimiento del suero del ratón con los anticuerpos hacia tres de los epitopos demostró actividad de la neutralización contra la proteína del pico SARS-CoV-2 en las concentraciones inhibitorias que excedían ésos observados para los sueros obligatorios el hospitalizado de los anticuerpos del dominio del receptor.

Este trabajo podría ayudar en el refuerzo de la actividad de vacunas determinando los epitopos lineales dentro de la proteína del pico SARS-CoV-2 que sacan la producción de anticuerpos menos eficaces que los anticuerpos obligatorios del dominio de un receptor más activo. Varios de los epitopos lineales determinados son altamente inmunogenéticos, sacando la producción de anticuerpos contra ellos sin fuertemente la neutralización hacia SARS-CoV-2. La prevención de la producción de estos anticuerpos puede animar a anticuerpos más útiles que sean producidos en su lugar y potencialmente evitar los efectos del aumento con dependencia de los anticuerpos.

Journal reference:
Michael Greenwood

Written by

Michael Greenwood

Michael graduated from Manchester Metropolitan University with a B.Sc. in Chemistry in 2014, where he majored in organic, inorganic, physical and analytical chemistry. He is currently completing a Ph.D. on the design and production of gold nanoparticles able to act as multimodal anticancer agents, being both drug delivery platforms and radiation dose enhancers.

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