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da ricercatori guidati UVA sollecitano l'atto rapido preparare meglio per la pandemia seguente

Un gruppo internazionale dei ricercatori piombo da un'università di professore della scuola di medicina della Virginia sta avvertendo che gli scienziati devono preparare meglio per la pandemia seguente - ed ha sviluppato una pianificazione per fare appena quello.

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Un'immagine creata dal minore di Marcin per il coperchio del giornale scientifico IUCrJ per accompagnare un nuovo articolo che invita gli scienziati ora a preparare per la pandemia seguente. Credito di immagine: Salubrità di UVA

Notando “la valanga„ di dati scientifici generati in risposta a COVID-19, il minore del Wladek di UVA, il PhD ed i colleghi stanno richiedendo la creazione “di un sistema di informazione avanzato„ (AIS) per aiutare gli scienziati ad integrare, riflettere e valutare i grandi importi dei dati che saranno redatti come ricercatori riveli l'architettura molecolare dell'agente patogeno seguente che posa una grande minaccia biologica. Questi informazioni sulla forma, sulla struttura e sulla funzione di un agente patogeno sono essenziali allo sviluppo dei farmaci, dei vaccini e dei trattamenti. Per esempio, dei vaccini COVID-19 l'obiettivo disponibile ora la proteina “della punta„ sulla superficie del virus SARS-CoV-2.

La loro risorsa online molto citata per COVID-19 (https://covid-19.bioreproducibility.org/) dimostra l'utilizzabilità del loro approccio e può essere usato come base per la nuova strategia di ricerca, dicono. Il sito comprende i modelli strutturali 3-D con attenzione convalidati di numerose proteine relative al virus SARS-CoV-2, compreso molti obiettivi potenziali della droga.

I modelli strutturali ed altri risultati sperimentali forniti dai vari laboratori devono seguire una procedura standard di valutazione per assicurarsi che siano accurati e per conformarsi agli standard scientifici accettati. La convalida standardizzata è importante per tutte le aree delle scienze biomediche, particolarmente per i modelli strutturali, che sono usati spesso poichè un punto di partenza nella ricerca successiva, quale l'aggancio guidato da computer della droga studia e data mining. Anche gli errori apparentemente irrilevanti possono piombo tale ricerca fuori strada.„

Il minore di Wladek, Harrison ha distinto il professor della fisiologia molecolare e della fisica biologica, UVA

Combattimento della pandemia

Un ruolo importante dell'AIS sarebbe di identificare le strutture che possono essere raffinate e migliorate, i ricercatori dice. Erano felici di notare che l'ispezione delle cianografie molecolari prodotte per le componenti di COVID-19 e depositate nel database online della banca dati della proteina suggerisce che la maggior parte fossero molto buone. Meno di 1% la nuova interpretazione significativa stata necessaria e meno di 10% ha potuto essere ottimizzata dalle revisioni moderate.

Eppure, le buone edilizie richiedono le buone cianografie. Lo stesso è vero con i vaccini ed i trattamenti di malattia. È critico, i ricercatori dicono, che i dati strutturali ed altri per gli agenti patogeni sono accurati come possibile e che gli scienziati dai vari campi stanno parlando lo stesso linguaggio quando li discute ed usando. L'AIS proposto contribuirebbe ad assicurare la conformità attraverso le discipline.

Quasi 100.000 documenti di COVID-19-related sono stati pubblicati e sopra mille modelli delle macromolecole codificati da SARS-CoV-2 sono stati determinati sperimentalmente durante circa un anno. Nessun essere umano può possibilmente elaborare questo volume di informazione. Crediamo che la soluzione di promessa a sovraccarico di informazioni ed alla mancanza di efficace reperimento delle informazioni sia la creazione di un sistema di informazione avanzato che è capace presentare e risorse pertinenti da tutte le dei risultati di raccolta le informazioni nei modi istruttivi che promuovono capire e conoscenza.„

Minore di Wladek

I ricercatori riconoscono quello che applica la loro proposta sarebbero un'impresa importante. Altre risorse che hanno cercato di offrire i simili vantaggi su un su scala ridotta già sono venuto ed andato. Ecco perché è così importante, gli scienziati dicono, che ora agiamo. “Creare un AIS richiederà indubbiamente la collaborazione di molti scienziati che sono esperti nelle loro rispettive materie, ma sembra essere il solo modo preparare la scienza biomedica per la pandemia seguente,„ i ricercatori scrive in un nuovo articolo scientifico che descrivono la loro proposta.

“In cronologia di umanità, la pandemia COVID-19 è relativamente delicata in confronto alla peste bubbonica (morte nera) che ha ucciso che cento volte più gente,„ i ricercatori concludono. “Non potremmo essere il tempo prossimo così fortunato.„

Nuovo approccio descritto

I ricercatori - da UVA, dall'istituto nazionale contro il cancro, dalla Polonia e dall'Austria -- hanno dettagliato la loro pianificazione in un articolo nel giornale scientifico IUCrJ. L'articolo è descritto sul coperchio del giornale. Il gruppo di ricerca consiste di Marek Grabowski, di Joanna M. Macnar, di Marcin Cymborowski, di David R. Cooper, di Ivan G. Shabalin, di Miroslaw Gilski, di Dariusz Brzezinski, di Marcin Kowiel, di Zbigniew Dauter, di Bernhard Rupp, di Alexander Wlodawer, di Mariusz Jaskolski e del minore.

In loro documento, i ricercatori riconoscente hanno riconosciuto il contributo finanziario degli istituti nazionali dell'istituto nazionale della salubrità delle scienze mediche generali, accordano R01-GM132595; l'agenzia nazionale polacca per lo scambio accademico, concessione PN/BEK/2018/1/00058/U/00001; il centro nazionale polacco di scienza, concessione 2020/01/0/NZ1/00134; il programma di ricerca interno del NIH, istituto nazionale contro il cancro, centro per ricerca sul cancro; FWF (fondamenta austriache) di scienza, concessione P 32821; ed il centro nazionale polacco di scienza, concessione 2018/29/B/ST6/01989.

Il minore ed il suo collaboratore da molto tempo Zbyszek Otwinowski, PhD, del centro medico sudoccidentale dell'università del Texas, recentemente hanno ricevuto al Tadeusz Sendzimir il premio di scienze applicate dall'istituto polacco delle arti e delle scienze dell'America affinchè i loro sforzi sviluppino e per promuovere il software per le applicazioni biomediche nel campo strutturale di biologia.

Source:
Journal reference:

Grabowski, M., et al. (2021) Rapid response to emerging biomedical challenges and threats. IUCrJ. doi.org/10.1107/S2052252521003018.