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Plus grand écart d'étude par états neufs de la variante B.1.1.7 à Houston, le Texas

La recherche aboutie par Jimmy Gollihar à partir des Laboratoire-Sud de recherches de forces terrestres de CCDC dans Austin, le Texas a trouvé la variante B.1.1.7 - premier du coronavirus 2 de syndrôme respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) a trouvé l'automne dernier en Angleterre - accrue à Houston, le Texas. La variante B.1.1.7 écarte rapidement avec une heure de doublement de cas de 6,9 jours.

L'équipe écrit :

« Nos caractéristiques de séquence de génome documentent une trajectoire ascendante très rapide des caisses de COV B.1.1.7 dans la métropolitaine Houston. D'une manière primordiale, il n'y avait aucune augmentation analogue d'autres variantes. »

Les anciens travaux ont trouvé toutes les variantes de préoccupation dans la région de Houston après contrôle génomique des échantillons SARS-CoV-2 de mars 2020 à février 2021. Début mars 2021, le Gouverneur Greg Abbott a publié un décret soulevant le mandat de masque dans le Texas.

La condition a actuel les troisième caisses globales de coronavirus les plus élevées par la condition avec plus de 2,78 millions. Elles ont également toutes les morts de coronavirus troisième-élevées aux Etats-Unis, enregistrant plus de 48.000.

L'augmentation rapide, répandue, et préférentielle de l'étude « de la variante de SARS-CoV-2 B.1.1.7 à Houston, TX, indiqué par 8.857 séquences de génome » est procurable comme prétirage sur le serveur de medRxiv*, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.

Rail des variants génétiques

Les chercheurs ont exécuté le contrôle génomique sur 8.857 échantillons SARS-CoV-2 acquis des patients qui ont vérifié le positif pour COVID-19. Les échantillons ont été rassemblés depuis le 1er janvier 2021, au 7 mars 2021. L'échantillon était 94% de patients diagnostiqués dans le système de méthodiste de Houston. L'information patiente telle que le lieu de résidence a été obtenue à partir des dossiers médicaux électroniques pour recenser la distribution geospatial de la variante B.1.1.7 de la préoccupation.

Courbure épidémiologique des cas de COVID- 19 dans le système méthodiste d
Courbure épidémiologique des cas de COVID- 19 dans le système méthodiste d'hôpital de Houston. La courbure montre la fréquence accrue de cas provoqués par B.1.1.7 du 1er janvier 2021 au 7 mars 2021.

Prévalence de la variante B.1.1.7 à Houston

Les chercheurs ont trouvé 648 cas B.1.1.7 qui sont devenus plus récurrents que d'autres variantes de préoccupation tout au long de la période de réflexion. Totalement, la variante B.1.1.7 était répandue dans la zone métropolitaine entière de Houston. Ils estiment que la région de Houston a doublé leurs cas B.1.1.7 tous les 6,9 jours.

Heureusement, l'équipe n'a pas trouvé la mutation d'E484K dans la protéine de pointe des 648 variantes B.1.1.7 l'unes des recensée. La mutation d'E484K a été associée à diminuer la réaction immunitaire et des anticorps de neutralisation vaccin-induits. On l'a trouvé dans d'autres variantes de préoccupation, y compris P.1 et B.1.351.

Distribution de Geospatial des cas B.1.1.7 recensés dans l
Distribution de Geospatial des cas B.1.1.7 recensés dans l'étude. Le code postal d'adresse debut de piste pour chaque patient a été employé et des chiffres ont été produits utilisant la version 2020.3.4 de tableau.

Il n'y avait aucune association significative entre l'infection par la variante B.1.1.7 et l'âge d'une personne, le genre, la longueur du séjour d'hospitalisation, ou le risque de mortalité. Cependant, les patients de note de chercheurs présentant la variante B.1.1.7 étaient pour être admis à un hôpital.

Les échantillons nasopharyngaux ont également trouvé une charge virale inférieure comme indiqué par des valeurs plus basses de Ct, la proposition des patients infectés avec la variante B.1.1.7 a eu une charge virale plus élevée sur le diagnostic initial. Ils proposent que les découvertes soient compatibles avec le transmissibility accru lié à B.1.1.7.

Modèle d
Modèle d'accroissement pour la variante B.1.1.7 dans la métropolitaine Houston. L'accroissement relatif de la variante B.1.1.7 a été équipé au modèle logistique d'accroissement suivant la procédure en bonne santé de courbure de l'évaluation des moindres carrés non linéaire dans SciPy (1.1.0) (https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/release.1.1.0.html). Taux de croissance : 0,1012 [intervalle de confiance de 95% (CI) : 0,0631 - 0,1393] ; temps de doublement : 6,91 jours (ci de 95% : 5,02 - 11,08).

Limitations d'étude à considérer

Les chercheurs notent leurs caractéristiques se compose de 94% de caisses méthodistes de Houston et de 4,8% de toutes les caisses de zone métropolitaine. Environ 197.817 cas COVID-19 étaient du comté de Harris et de huit autres comtés.

Les chercheurs notent également leur population de test étaient divers dans le groupe ethnique/chemin, mais ils peuvent ne pas être traduisibles aux enfants et aux populations données sur telles que le sans-abri.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Jocelyn Solis-Moreira

Written by

Jocelyn Solis-Moreira

Jocelyn Solis-Moreira graduated with a Bachelor's in Integrative Neuroscience, where she then pursued graduate research looking at the long-term effects of adolescent binge drinking on the brain's neurochemistry in adulthood.

Citations

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