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Propagação aumentada do estudo relatórios novos da variação B.1.1.7 em Houston, Texas

A pesquisa conduzida pelo pé-de-cabra Gollihar do Laboratório-Sul em Austin, Texas da pesquisa do exército de CCDC encontrou a variação B.1.1.7 do coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) - detectado primeiramente no outono passado em Inglaterra - aumentada em Houston, Texas. A variação B.1.1.7 está espalhando ràpida com uma hora de duplicação do caso do 6,9 dias.

A equipe escreve:

“Nossos dados da seqüência do genoma documentam uma trajectória ascendente muito rápida de caixas do VOC B.1.1.7 em Houston metropolitano. Importante, não havia nenhum aumento análogo em outras variações.”

Os trabalhos anteriores encontraram todas as variações do interesse na área de Houston após a fiscalização genomic das amostras SARS-CoV-2 desde março de 2020 até fevereiro de 2021. Ao princípio de março de 2021, o regulador Greg Abbott emitiu um decreto que levanta o mandato da máscara em Texas.

O estado tem actualmente os terceiros exemplos os mais altos globais do coronavirus pelo estado com sobre os 2,78 milhões. Igualmente têm as mortes totais terceiro-as mais altas do coronavirus nos Estados Unidos, relatando sobre 48.000.

O aumento rápido, difundido, e preferencial do estudo “da variação de SARS-CoV-2 B.1.1.7 em Houston, TX, revelado por 8.857 seqüências do genoma” está disponível como uma pré-impressão no server do medRxiv*, quando o artigo se submeter à revisão paritária.

Seguindo variações genéticas

Os pesquisadores executaram a fiscalização genomic em 8.857 amostras SARS-CoV-2 adquiridas dos pacientes que testaram o positivo para COVID-19. As amostras foram recolhidas desde o 1º de janeiro de 2021, ao 7 de março de 2021. A amostra era 94% dos pacientes diagnosticados no sistema metodista de Houston. A informação paciente tal como o lugar de residência foi obtida dos informes médicos eletrônicos para identificar a distribuição geospatial da variação B.1.1.7 do interesse.

Curva epidemiológica de casos de COVID- 19 no sistema metodista do hospital de Houston. A curva mostra a freqüência aumentada dos casos causados por B.1.1.7 do 1º de janeiro de 2021 ao 7 de março de 2021.
Curva epidemiológica de casos de COVID- 19 no sistema metodista do hospital de Houston. A curva mostra a freqüência aumentada dos casos causados por B.1.1.7 do 1º de janeiro de 2021 ao 7 de março de 2021.

Predominância da variação B.1.1.7 em Houston

Os pesquisadores encontraram 648 casos B.1.1.7 que se tornaram mais periódicos do que outras variações do interesse ao longo do período do estudo. Completamente, a variação B.1.1.7 era difundida na área metropolitana inteira de Houston. Calculam que a região de Houston dobrou seus casos B.1.1.7 cada 6,9 dias.

Felizmente, a equipe não encontrou a mutação de E484K na proteína do ponto de algumas das 648 variações B.1.1.7 identificada. A mutação de E484K foi associada com a diminuição da resposta imune e dos anticorpos de neutralização vacina-induzidos. Encontrou-se em outras variações do interesse, incluindo P.1 e B.1.351.

Distribuição de Geospatial dos casos B.1.1.7 identificados no estudo. O código postal do endereço domiciliário para cada paciente foi usado e as figuras foram geradas usando a versão 2020.3.4 do quadro.
Distribuição de Geospatial dos casos B.1.1.7 identificados no estudo. O código postal do endereço domiciliário para cada paciente foi usado e as figuras foram geradas usando a versão 2020.3.4 do quadro.

Não havia nenhuma associação significativa entre a infecção pela variação B.1.1.7 e a idade de uma pessoa, o género, o comprimento da estada da hospitalização, ou o risco da mortalidade. Contudo, os pacientes da nota dos pesquisadores com a variação B.1.1.7 eram mais prováveis ser admitidos a um hospital.

As amostras Nasopharyngeal igualmente encontraram uma carga viral mais baixa como indicado com uns mais baixos valores do Ct, sugerir os pacientes contaminados com a variação B.1.1.7 teve uma carga viral mais alta em cima do diagnóstico inicial. Sugerem que os resultados sejam consistentes com o transmissibility aumentado associado com o B.1.1.7.

Modelo do crescimento para a variação B.1.1.7 em Houston metropolitano. O crescimento relativo da variação B.1.1.7 foi cabido ao modelo logístico do crescimento usando o procedimento apto da curva com a avaliação não-linear dos mínimo quadrados em SciPy (1.1.0) (https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/release.1.1.0.html). Taxa de crescimento: 0,1012 [intervalo de confiança de 95%: 0,0631 - 0,1393]; tempo de duplicação: 6,91 dias (CI de 95%: 5,02 - 11,08).
Modelo do crescimento para a variação B.1.1.7 em Houston metropolitano. O crescimento relativo da variação B.1.1.7 foi cabido ao modelo logístico do crescimento usando o procedimento apto da curva com a avaliação não-linear dos mínimo quadrados em SciPy (1.1.0) (https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/release.1.1.0.html). Taxa de crescimento: 0,1012 [intervalo de confiança de 95% (CI): 0,0631 - 0,1393]; tempo de duplicação: 6,91 dias (CI de 95%: 5,02 - 11,08).

Limitações do estudo a considerar

Os pesquisadores notam seus dados consistem em 94% de caixas metodistas de Houston e em 4,8% de todas as caixas da área metropolitana. Aproximadamente 197.817 casos COVID-19 eram do Condado de Harris e outros de oito condados.

Os pesquisadores igualmente notam sua população do teste eram diversos na afiliação étnica/raça, mas não podem ser translatable às crianças e às populações negligenciadas tais como os sem abrigo.

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Jocelyn Solis-Moreira

Written by

Jocelyn Solis-Moreira

Jocelyn Solis-Moreira graduated with a Bachelor's in Integrative Neuroscience, where she then pursued graduate research looking at the long-term effects of adolescent binge drinking on the brain's neurochemistry in adulthood.

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