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Nueva variante del coronavirus con la mutación de E484K descubierta en Arizona

Arizona ensambla el filete cada vez mayor de los estados americanos que abrigan una variante del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática. Un estudio llevado por Efrem S. Lim de la universidad de estado de Arizona confirma las pruebas del B.1.243.1 con una mutación de E484K en la proteína del pico.

La mutación de E484K está tratando para que su capacidad escape la inmunorespuesta y reduzca la potencia de neutralización de los anticuerpos monoclonales. Su demostración de los resultados que la variante se está extendiendo en Arizona y que está comenzando a cruzar las bandas de estado a New México y a Tejas.

B.1.427 y B.1.429 primero fueron denunciados en California, y el trabajo reciente ha mostrado una aparición de las variantes B.1.525 y B.1.526 en Nueva York. Esto está además de otras variantes de circulación del coronavirus que primero fueron descubiertas en el Brasil, el Reino Unido, y Suráfrica.

Los investigadores escriben:

“Basó en el perfil de la mutación, introducción regional y las pruebas filogenéticas, recomendamos la supervisión vigilante de B.1.243.1 como variante potencial del interés. Este estudio demuestra la necesidad de la vigilancia genomic continua en estrategias y reacciones de la salud pública.”

El estudio “aparición de una variante de SARS-CoV-2 E484K del interés en Arizona” está disponible como prueba preliminar en el servidor del medRxiv*, mientras que el artículo experimenta la revisión paritaria.

Rastreo de variantes virales

Las muestras cerco personas de la saliva de varios condados de Arizona que probaron el positivo para SARs-CoV-2. Extrajeron el ARN a partir de 688 muestras y realizaron vigilancia genomic para buscar variantes. Cerca de 92,7% de genomas fueron ordenados con éxito, donde 7,7% tenían la variante B.1.1.7, 33,5% tenían la variante B.1.427/429, y 0,9% tenían la variante P.2. Una limitación importante en el estudio es que no ordenaron la muestra entera pues la mayoría de los genomas tenían cargas virales inferiores con alto CTs en los años 30.

Había un total de 7 genomas con el B.1.243 variable y una mutación de E484K. Esta nueva variante tenía 11 otras mutaciones únicas a parte de las mutaciones observadas en el linaje original B.1.243 con la mutación de D614G. Esto incluyó V213G y E484K en la proteína del pico, una supresión del NT 9 en ORF1ab, y 3 - inserción del NT en la región intergénico de la no-codificación contracorriente desde el gen de N, así como otras substituciones.

De acuerdo con el perfil mutacional, los investigadores dieron este E484K que abrigaba variante el nombre provisional de B.1.243.1.

Aparición de E484K que abriga la variante B.1.243.1 en Arizona, los E.E.U.U. (a) Las mutaciones de linaje-definición B.1.243.1 se muestran en el genoma SARS-CoV-2. Las mutaciones se muestran en referencia a la posición del genoma de SARS-CoV-2 Wuhan-1 (NC_045512.2). (b) Incidencia global del linaje parental B.1.243 de noviembre de 2021 a marzo de 2021. El número mensual de los casos B.1.243 (capota) y la distribución por el país (parte inferior) se muestran. La frecuencia media para cada país se muestra en paréntesis. Las series a partir de marzo bajo-se denuncian a la hora de esta información (indicada por la línea discontinua). (c) Incidencia del caso B.1.243.1 que denuncia de febrero a marzo de 2021. La incidencia acumulativa del caso se traza como línea gráfico.
Aparición de E484K que abriga la variante B.1.243.1 en Arizona, los E.E.U.U. (a) Las mutaciones de linaje-definición B.1.243.1 se muestran en el genoma SARS-CoV-2. Las mutaciones se muestran en referencia a la posición del genoma de SARS-CoV-2 Wuhan-1 (NC_045512.2). (b) Incidencia global del linaje parental B.1.243 de noviembre de 2021 a marzo de 2021. El número mensual de los casos B.1.243 (capota) y la distribución por el país (parte inferior) se muestran. La frecuencia media para cada país se muestra en paréntesis. Las series a partir de marzo bajo-se denuncian a la hora de esta información (indicada por la línea discontinua). (c) Incidencia del caso B.1.243.1 que denuncia de febrero a marzo de 2021. La incidencia acumulativa del caso se traza como línea gráfico.

La variante B.1.243 cruza líneas de estado

Usando la base de datos pública de GISAID, los investigadores observaban la distribución geospatial de esta nueva variante. Encontraron que el B.1.243 variable y la mutación de E484K ha emergido solamente recientemente en Arizona, con 15 de los 17 casos ordenados que ocurrían del 1 de febrero al 2 de marzo.

Un caso del B.1.243 variable y de la mutación de E484K fue denunciado en Houston, Tejas, el 24 de febrero y otro más recientemente en New México, sugerir la variante no se contiene en Arizona.

Había también dos casos donde los linajes B.1.243 lograron independientemente la mutación de E484K. Aunque, esta variante faltara las 11 mutaciones observadas en la nueva variante y apareciera ser acciones sin salida de la transmisión.

Los investigadores trazaron la variante a un clade monofilético dentro del clade 20A/B.1.243. Y el ramificarse continuado de la variante indica que el linaje continúa diversificar. “Esto sugiere que B.1.243.1 se esté estableciendo en la circulación dentro de Arizona. En cambio, los dos casos B.1.243 que soportaban la mutación de E484K solamente eran filogenético distintos del clade B.1.243.1, soportando que se habían desarrollado independientemente,” escriben al equipo de investigación.

El anticipar

Mientras que la variante está comenzando a moverse a otros estados, acciones humanas tales como decidir a desgastar una máscara y una distancia social, y las dimensiones del orden público pueden influenciar régimen de transmisión. Sugieren que trazado y los aumentos del contacto en vigilancia genomic sea necesario medir el fragmento verdadero del riesgo de extender esta variante potencial del interés.

“Las pruebas Genomic, epidemiológicas y filogenéticas indican que la variante B.1.243.1 del interés está contrapesada para emerger. Estas conclusión demuestran la necesidad crítica de continuar el rastrear de SARS-CoV-2 en tiempo real para informar a estrategias de la salud pública, a diagnósticos, a contramedidas médicas y a vacunas.”

Advertencia importante

el *medRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Jocelyn Solis-Moreira

Written by

Jocelyn Solis-Moreira

Jocelyn Solis-Moreira graduated with a Bachelor's in Integrative Neuroscience, where she then pursued graduate research looking at the long-term effects of adolescent binge drinking on the brain's neurochemistry in adulthood.

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