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O teste de selecção viral portátil novo pode diagnosticar COVID-19 nas actas e nas variações da trilha

Os clínicos que usam um teste de selecção viral novo não podem somente diagnosticar COVID-19 numa questão de minutos com um portable, máquina bolso-feita sob medida, mas podem igualmente simultaneamente testar para outros vírus--como a gripe--isso pôde ser confundido pelo coronavirus. Ao mesmo tempo, podem arranjar em seqüência o vírus, fornecendo a informação valiosa na propagação das mutações COVID-19 e das variações. O teste novo, NIRVANA dublado, foi descrito hoje em linha por uma equipe da multi-instituição dos cientistas no MED do jornal.

Este é um método da detecção e da fiscalização do vírus que não exija uma infra-estrutura cara como outras aproximações. Nós podemos realizar com um teste portátil a mesma coisa que outro estão usando dois ou três testes diferentes, com máquinas diferentes, para fazer.”

Juan Carlos Izpisua Belmonte, autor Co-Correspondente e professor, laboratório da expressão genética de Salk

Em todo o mundo, mais de 100 milhões de pessoas foram contaminados com SARS-CoV-2, o vírus que causa COVID-19. Os 500.000 americanos de desconcertamento morreram de COVID-19 até agora. Testar a população é chave a parar a propagação do vírus. Além, seguindo a propagação das variações SARS-CoV-2 novas--alguns de que poderia responder diferentemente aos tratamentos ou às vacinas--é crítico.

Hoje, a aproximação padrão a determinar se um cotonete nasal é positivo para COVID-19 é executar um teste da reacção em cadeia (PCR) da polimerase para detectar o material genético do vírus SARS-CoV-2. Se a amostra é negativa, contudo, os pacientes e os clínicos não obtêm nenhuma informação no que pôde ser causar coronavirus-como sintomas--a menos que executarem testes separados do PCR, usando amostras diferentes do cotonete, para outros vírus. E se a amostra é positiva para SARS-CoV-2, não aprendem que variação COVID-19 um paciente está contaminado com a menos que um outro grupo de testes for executado; aqueles exigem uma máquina gene-arranjando em seqüência da grande e próxima geração cara.

No verão passado, o Mo Li, um professor adjunto da ciência biológica na universidade do rei Abdullah da ciência e da tecnologia em Arábia Saudita, era maneiras que contemplativos poderia emprestar sua experiência na genética e nanopore que arranja em seqüência a combater a pandemia COVID-19. Li, que passou previamente seis anos como um pesquisador pos-doctoral de Salk no laboratório de Izpisua Belmonte, quis saber se uma aproximação da gene-detecção chamou a amplificação isothermal da polimerase do recombinase (RPA) acoplado com arranjar em seqüência do nanopore do tempo real pôde ser mais útil--e mais rápido, mais barato e mais portátil--do que a aproximação actual do teste COVID-19. Teamed acima com Izpisua Belmonte para encontrar.

Ao contrário do PCR, que dá um ciclo com umas mais baixas e mais altas temperaturas para separar costas do ADN e para as copiar, o RPA usa proteínas--um pouco do que mudanças de temperatura--para realizar a mesma coisa em somente 20 minutos. A tecnologia deixa pesquisadores copiar uns estiramentos mais longos do ADN, e sonda-os para genes múltiplos ao mesmo tempo.

“Nós realizamos rapidamente que nós poderíamos usar esta técnica para detectar não somente SARS-CoV-2, mas outros vírus ao mesmo tempo,” diz Li.

No papel novo, Li e Izpisua Belmonte descrevem um dispositivo pequeno, portátil que possa seleccionar 96 amostras ao mesmo tempo que usam o ensaio do RPA. Chamam o NIRVANA do método, para do “arranjar em seqüência nanopore da amplificação viral rápida isothermal para a análise do tempo real próximo.”

Os cientistas projectaram o NIRVANA testar simultaneamente amostras para COVID-19, gripe A, o vírus adenóide humano, e o coronavirus do ser humano non-SARS-CoV-2. Em apenas 15 minutos, os pesquisadores relatam, o dispositivo começa a relatar resultados positivos e negativos. E dentro de três horas, o dispositivo finaliza resultados em todas as 96 amostras--incluindo as seqüências de cinco regiões de SARS-CoV-2 que são particularmente inclinados acumule as mutações que conduzem às variações novas tais como a variação B.1.1.7 identificada no Reino Unido.

Li e Izpisua Belmonte testaram o NIRVANA em 10 amostras conhecidas para ser positivos para SARS-CoV-2, 60 amostras do estado SARS-CoV-2 desconhecido, assim como amostras de águas residuais municipais que abrigam o vírus SARS-COV-2 e outro. Em todos os casos, o ensaio podia identificar correctamente que os vírus estaram presente. Os dados arranjando em seqüência igualmente permitiram que reduzissem para baixo a origem de SARS-CoV-2 em amostras positivas; diferenciar-se estica de China e de Europa, por exemplo.

“O projecto deste ensaio é realmente flexível, assim que não é limitado apenas aos exemplos que nós mostramos,” diz Li. “Nós podemos facilmente adaptá-lo para abordar um outro micróbio patogénico, mesmo algo novo e emergente.”

Com o tamanho e a mobilidade pequenos dos trabalhos do NIRVANA, poderia ser usado para a detecção rápida do vírus em escolas, os aeroportos ou as portas, os pesquisadores dizem. Igualmente poderia ser usada para monitorar águas residuais ou córregos para a presença de vírus novos.

“A pandemia forneceu duas lições importantes: primeiramente, teste extensamente e rapidamente, e o segundo, conhece suas variações. Nosso método do NIRVANA fornece uma solução prometedora a estes dois desafios não somente para a pandemia actual mas igualmente para o futuro possível uns,” diz Izpisua Belmonte, que guardara a cadeira de Roger Guillemin em Salk. A análise do mercado seria exigida determinar se o preço inicial da comercialização--e as emendas constantes ao teste necessário para certificar-se d detectaram variações novas ou vírus novos do interesse--valer a pena, Belmonte adiciona.

Source:
Journal reference:

Bi, C., et al. (2021) Simultaneous Detection and Mutation Surveillance of SARS-CoV-2 and co-infections of multiple respiratory viruses by Rapid field-deployable sequencing. Med. doi.org/10.1016/j.medj.2021.03.015.