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La variante de CAL20.C SARS-CoV-2 montant en flèche en Californie élude la réaction immunitaire d'hôte

L'effet de différents anticorps de neutralisation, vaccin-obtenus et des sérums convalescents, propose que les variantes neuves apparaissent qui peuvent éluder la réaction immunitaire humaine.

Le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère grippe aux cellules hôte par l'intermédiaire de sa protéine de pointe, qui a deux parts, les sous-unités S1 et S2. La sous-unité S1 a le domaine récepteur-grippant (RBD) et le domaine de N-terminal (NTD). Le RBD grippe à l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) d'hôte pour infecter des cellules hôte.

Des anticorps de neutralisation sont produits contre le RBD et NTD par les personnes infectées et vaccinées. Quelques anticorps monoclonaux de RBD-détail sont actuel sous des tests cliniques ou sont reconnus pour l'usage de soigner les patients COVID-19.

L'écart prolongé du virus a mené à lui évoluant rapidement, avec plusieurs variantes apparaissant dans différentes parties du globe. Les variantes B.1.1.7, B.1.351, et les tensions P.1 ont plusieurs mutations dans la partie de pointe et d'autres régions du génome viral. Certaines de ces mutations ont réduit le pouvoir de neutralisation des anticorps monoclonaux, des sérums convalescents, et de quelques vaccins.

Une autre variante, B.1.427/B.1.429 a apparu en Californie en mai 2020 et s'est maintenant écartée à plusieurs autres pays. La variante B.1.427/B.1.429 a la prévalence plus de 50% en Californie depuis février 2021. Elle a les mutations S13I, W152C dans la mutation de NTD, et de L452R dans le RBD. Ceci a été indiqué pendant qu'une variante de préoccupation (VOC) par les Etats-Unis centre pour la lutte contre la maladie (CDC) à cause de son écart rapide.

Dans une étude publiée sur le serveur de prétirage de bioRxiv*, les chercheurs enregistrent l'effet de neutraliser des anticorps des patients récupérés ou des personnes vaccinées d'ARNm sur neutraliser cette variante.

Répartition géographique et évolution de prévalence au fil du temps du COV Radars à ouverture synthétique-CoV 2 B.1.427/B.1.429. (a) Plan du monde montrant les comptes de répartition géographique et de séquence de COV B.1.427/B.1.429 à partir du 26 mars 2021. (b) Comptes cumulatifs et différents de séquence de COV B.1.427/B.1.429 par mois. (CE). Nombre total des séquences de COV SARS-CoV-2 (gris) et B.1.427/B.1.429 (bleu/orange) déposées sur une base mensuelle (c) mondial, aux USA (d) et en Californie (e). (F et G) nombre total de séquences B.1.427 et B.1.429 déposées par pays (f) et par conditions d
Répartition géographique et évolution de prévalence au fil du temps du COV Radars à ouverture synthétique-CoV 2 B.1.427/B.1.429. (a) Plan du monde montrant les comptes de répartition géographique et de séquence de COV B.1.427/B.1.429 à partir du 26 mars 2021. (b) Comptes cumulatifs et différents de séquence de COV B.1.427/B.1.429 par mois. (CE). Nombre total des séquences de COV SARS-CoV-2 (gris) et B.1.427/B.1.429 (bleu/orange) déposées sur une base mensuelle (c) mondial, aux USA (d) et en Californie (e). (F et G) nombre total de séquences B.1.427 et B.1.429 déposées par pays (f) et par conditions d'USA (G) à partir du 26 mars 2021.

Neutralisation d'anticorps de contrôle de la tension B.1.427/B.1.429

Utilisant un système lentiviral, les chercheurs ont vu que l'activité de neutralisation des anticorps obtenue par le Moderna et les vaccins de Pfizer/BioNtech était, respectivement, assimilée environ de 3 fois et quadruple réduit à cela de la tension B.1.351 et légèrement plus haut que l'activité de neutralisation vers la tension B.1.1.7 et les P.1 tendent.

Les sérums obtenus à partir des gens qui ont récupéré de COVID-19 après avoir été infectés de la tension Wuhan-1 originelle ont montré au sujet d'une réduction de 5 fois de la neutralisation de la tension B.1.427/B.1.429 comparée à la tension de D614G, comparable à cela vue pour d'autres tensions de mutant. Ceci indique que les réactions des anticorps obtenues par la vaccination sont un peu de plus de haute qualité que ceux de l'infection naturelle.

Les sérums obtenus à partir des gens infectés avec B.1.1.7 ont montré l'activité de neutralisation presque indétectable contre la variante de D614G et tout autre VOCs, y compris B.1.427/B.1.429. Ceci propose l'infection avec B.1.1.7 la variante, la lignée dominante en Europe et quelques autres pays, produisent les concentrations faibles des anticorps de croix-neutralisation contre d'autres variantes.

Ensuite, l'équipe comparée l'activité de neutralisation de plusieurs anticorps monoclonaux de RBD- et de NTD-détail à la tension de D614G et au B.1.427/B.1.429 clouent des mutations utilisant un système de virus de pseudo-type.

La représentation extérieure du SARS-CoV-2 RBD (gris) bondissent au bamlanivimab (LY-CoV555, orange, APB 7CM4) et aux éclats ouvriers du regdanvimab (CT-P59, pourpre, APB 7KMG) montrés comme bandes. La chaîne L452 latérale est exposition en tant que sphères rouges pour indiquer son site central dans les épitopes de ces deux mAbs. Le N343 glycan est rendu en tant que sphères bleues.
La représentation extérieure du SARS-CoV-2 RBD (gris) bondissent au bamlanivimab (LY-CoV555, orange, APB 7CM4) et aux éclats ouvriers du regdanvimab (CT-P59, pourpre, APB 7KMG) montrés comme bandes. La chaîne L452 latérale est montrée en tant que sphères rouges pour indiquer son site central dans les épitopes de ces deux mAbs. Le N343 glycan est rendu en tant que sphères bleues.

Sur 35 anticorps qu'elles ont testés, elles a trouvé que 14 ont eu le pouvoir de neutralisation réduit.  L'effet du cocktail d'anticorps de casirivimab/imdevimab que l'autorisation reçue d'utilisation de secours aux Etats-Unis n'a pas changé à cause de la mutation de L452R.

Dix anticorps monoclonaux spécifiques au RBD ont montré la neutralisation réduite de 10 fois de B.1.427/B.1.429 et ont eu le mauvais grippement au mutant de L452R RBD. Les mutations de S31I et de W152C ont enlevé l'effet de neutralisation des anticorps monoclonaux de NTD-détail.

Pression sélectrice intense pour des mutations

Puisque la mutation de S31I est présente dans le peptide signal et est pensée pour changer de vitesse le site de clivage de peptide signal, il est susceptible les affects de mutation l'intégrité du site antigénique de NTD, compromettant les N-terminus. Avec la mutation de W152C, c'est potentiellement responsable de la variante B.1.427/B.1.429 s'échappant des anticorps de NTD-détail.

L'évasion immunisée de la mutation de L452R dans la protéine de la pointe B.1.427/B.1.429 est assimilée aux découvertes précédentes de cette mutation, même avant l'identification de la variante B.1.427/B.1.429. L'acquisition de cette mutation en travers de beaucoup de lignées et de continents propose le choix positif résultant de la pression sélectrice des anticorps de neutralisation de RBD-détail.

À la différence des anticorps visant le RBD, les anticorps de NTD-détail visent seulement un site géant antigénique. Par conséquent, le SARS-CoV-2 NTD subit le chassoir antigénique rapide et a beaucoup de mutations, proposant qu'il soit sous la pression sélectrice intense de la réaction immunitaire d'hôte. La compréhension des mécanismes variés de l'évasion immunisée de différentes variantes de virus a pu aider à développer des stratégies efficaces pour combattre la pandémie.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Lakshmi Supriya

Written by

Lakshmi Supriya

Lakshmi Supriya got her BSc in Industrial Chemistry from IIT Kharagpur (India) and a Ph.D. in Polymer Science and Engineering from Virginia Tech (USA).

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