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Os cientistas desenvolvem o método novo que avança tecnologias transcriptomic da único-pilha

Os cientistas na universidade de Oxford Brookes desenvolveram um método transcriptomic da único-pilha nova que ajudasse aos campos múltiplos da biologia, incluindo o estudo da saúde humana, a doença e o ferimento.

Os cientistas desenvolvem o método novo que avança tecnologias transcriptomic da único-pilha
Mapa da pilha usando método do transciptomics da pilha do ACME o único. Crédito de imagem: Universidade de Oxford Brookes

os métodos transcriptomic da Único-pilha permitem que os cientistas estudem os milhares de pilhas individuais dos organismos vivos, de um a um, e arranjam em seqüência o material genético de cada pilha. Os genes são activados diferentemente em cada tipo da pilha, causando tipos da pilha tais como os neurônios, células epiteliais e pilhas de músculo.

o transcriptomics da Único-pilha permite que os cientistas identifiquem os genes que são activos em cada tipo individual da pilha, e descubram como estas diferenças genéticas mudam a identidade e a função celulares. O estudo cuidadoso destes dados pode permitir que os tipos novos da pilha sejam descobertos, incluindo células estaminais previamente despercebidos, e os cientistas da ajuda seguem processos desenvolventes complexos.

da “o transcriptomics Único-pilha revolucionou a biologia mas é ainda uma área na revelação activa,” explica Helena García Castro, um aluno de doutoramento no departamento da ciência biológica e médica na universidade de Oxford Brookes e no co-autor do papel.

Os protocolos actuais da dissociação da pilha do uso dos métodos com ` vivem' os tecidos, que põem pilhas sob o esforço, fazendo com que mudem, e limitando investigações exactas.”

Helena García Castro, aluno de doutoramento no departamento da ciência biológica e médica, universidade de Oxford Brookes

Para resolver este problema, a equipa de investigação usou a pesquisa histórica e reviveu um processo dos 19os e 20os séculos para criar o método do ACME (dissociação do metanol do ácido acético).

Os cientistas realizaram que com este método, as pilhas não sofreram da dissociação como para sua actividade biológica e o ` os fixa' desde o in3cio da investigação.

O método do ACME permite então que as pilhas sido cryopreserved, umas ou diversas épocas durante todo o processo, imediatamente depois do processo da dissociação, nos protocolos do campo ou ao fazer da multi-etapa.

Isto significa que os cientistas podem agora trocar amostras entre laboratórios, preservam o material da pilha e os grandes grupos da amostra podem ser congelados a fim ser analisado simultaneamente, sem destruir a integridade do material genético na pilha. Nós tomamos o método dos papéis velhos e repurposed lhe para fazê-lo trabalhar com técnicas transcriptomic da único-pilha actual. Com nosso método novo, nós expor agora para caracterizar a pilha dactilografamos dentro muitos animais.”

Dr. Jordi Solana, research fellow, universidade de Oxford Brookes

Os cientistas podem agora colaborar com outros laboratórios e pesquisar uma variedade mais larga das pilhas animais, agradecimentos ao método do ACME. Isto não seria possível sem a tecnologia para separar e congelar tecidos vivos da pilha.

O papel, dissociação do ACME: um método versátil da fixação-dissociação da pilha para o transcriptomics da único-pilha, é publicado na biologia do genoma.

Source:
Journal reference:

García-Castro, H., et al. (2021) ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics. Genome Biology. doi.org/10.1186/s13059-021-02302-5