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¿Podía una proteína atún-derivada inhibir SARS-CoV-2?

La infección con el coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática puede causar señal de socorro e incluso muerte respiratorias en casos graves. La enfermedad manifestada se llama COVID-19 (enfermedad 2019 del coronavirus). Hasta la fecha, la droga antivirus no específica está disponible para tratar las infecciones altamente virulentas SARS-CoV-2 en seres humanos.

Un estudio reciente en la química alimenticia del gorrón drena la atención a la necesidad de encontrar suplementos alimenticios con efectos potenciales de la inhibición SARS-CoV-2 como consecuencia del pandémico COVID-19.

Realizando el muelle molecular, los investigadores del estudio determinaron un péptido antivirus EEAGGATAAQIEM (E-M) como inhibidor del potencial SARS-CoV-2. Encontraron que el péptido obra recíprocamente con los residuos Thr190, Thr25, Thr26, Ala191, Leu50, Met165, Gln189, Glu166, His164, His41, Cys145, Gly143, y Asn119 de la proteasa principal de SARS-CoV-2 (Mpro) vía 11 ligazones de hidrógeno convencionales, 9 ligazones del carbono-hidrógeno, y una acción recíproca alkílica.

Además, encontraron que el E-M también ata ACE2 - el receptor que medie el asiento viral - con los residuos His34, Phe28, Thr27, Ala36, Asp355, Glu37, Gln24, Ser19, Tyr83, y Tyr41. Este estudio es indicativo que las ligazones de hidrógeno y las acciones recíprocas electroestáticas pueden desempeñar papeles vitales en cegar el receptor ACE2 que ata con SARS-CoV-2.

La proteasa principal (Mpro, también llamado 3CLpro) en el virus SARS-CoV-2 es un objetivo terapéutico necesario. Así como papaína-como las proteasas, desempeña un papel vital en la traslación del ARN y reconoce sitios específicos de la hendidura. La inhibición de esta actividad enzimática ayudaría a cegar la réplica viral. También, porque no se sabe ninguna proteasa humana con especificidad similar de la hendidura, tales inhibidores son poco probables ser tóxicos a los seres humanos.

ACE2 (angiotensina-que convierte la enzima 2) es el receptor humano del ordenador principal SARS-CoV-2 a la proteína del pico (s), iniciando el asiento viral en las células humanas. Los investigadores interpretaron así eso que cegaba la acción recíproca entre la proteína de S de SARS-CoV-2 y el dominio receptor-obligatorio (RBD) de los receptores celulares ACE2 puede prevenir el asiento del virus. Por lo tanto, ACE2 es también un objetivo atractivo para el tratamiento de SARS-CoV-2.

Como suplemento alimenticio, esta proteína puede ser una aproximación útil para perfeccionar inmunidad contra SARS-CoV-2. Muchos estudios anteriores han denunciado los péptidos como agentes terapéuticos potenciales (tales como C-péptido anti-VIH (SJ-2176) y enfuvirtide). Esto está principalmente debido a su selectividad, especificidad, niveles bajos de efectos secundarios, y metabolismo fiable.

Los investigadores evaluaron las capacidades obligatorias de péptidos a Mpro y a ACE2. Contaban con que los péptidos con alta afinidad a las dos enzimas se pudieran preveer para tener cierta inhibición potencial en SARS-CoV-2.

Sin embargo, el aislamiento, la purificación y determinar de los péptidos bioactivos de los hidrolizados de la proteína son procesos altamente extensos y que toma tiempo. Puede ser simplificada y ser acelerada por método de cribado virtual de varias fases y in silico la digestión (GI) gastrointestinal.

Para cuál determinaron los investigadores los péptidos atún-derivados para su estudio, eso puede ser utilizada como suplementación alimenticia y también tener inhibición potencial de la actividad SARS-CoV-2. El atún, alto contenido de la comida de los ingredientes de la nutrición, se ha encontrado para inhibir el receptor ACE2.

La meta de este estudio era determinar los péptidos nuevos para los pacientes COVID-19 de la proteína del atún como suplementación alimenticia, usando una estrategia de la combinación in silico de la hidrólisis y del muelle molecular. Las pruebas fueron realizadas para descubrir los péptidos inhibitorios nuevos contra Mpro y el receptor ACE2 del ordenador principal.

Los investigadores explican en el papel que el muelle molecular implica el atracar de los péptidos con el centro activo de objetivos en un software del estudio (DS) del descubrimiento. Aquí, utilizaron el software R2 del DS 2017. Esto genera la energía de CDOCKER en el proceso. Esta energía de CDOCKER predice la estabilidad de la acción recíproca del péptido-objetivo.

En este estudio, evaluaron el valor de la CDOCKER-energía del E-M del péptido con ACE2 como 144 kcal/mol. Esto es indicativo que el sitio activo de ACE atracó con el pico SARS-CoV-2 fue ocupado fuertemente por el E-M del péptido, que podría afectar/inhibe la actividad SARS-CoV-2.

También realizaron las simulaciones dinámicas moleculares (Doctor en Medicina) para determinar la afinidad obligatoria del péptido con la proteasa, el Mpro, y el ACE2 principales de SARS-CoV-2 en la temperatura ambiente.

De este estudio, los investigadores encontraron que el E-M del péptido de la miosina esquelética del atún es candidato inhibitorio potencial del ` SARS-CoV-2 un'. Usando la simulación molecular del muelle, demostraron los aminoácidos (Gly143 y Gln189) que desempeñaron papeles importantes en las acciones recíprocas del E-M de los péptidos y de Mpro.

Importante, encontraron que el E-M del péptido podría cegar la agregación SARS-CoV-2 a las células huesped conectando con el receptor ACE2 del virus vía ligazones de hidrógeno y acciones recíprocas electroestáticas.

Recomendaron el uso seguro del E-M del péptido debido a su potencial dietético de la fuente como buena suplementación alimenticia para los pacientes COVID-19. Sin embargo, piden ex vivo y in vivo los experimentos que pueden verificar la aplicabilidad de sus conclusión de este estudio.

Journal reference:
Dr. Ramya Dwivedi

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Dr. Ramya Dwivedi

Ramya has a Ph.D. in Biotechnology from the National Chemical Laboratories (CSIR-NCL), in Pune. Her work consisted of functionalizing nanoparticles with different molecules of biological interest, studying the reaction system and establishing useful applications.

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