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Mutación triple en SARS-CoV-2 visto en la segunda onda de COVID-19 en la India

Los investigadores ordenaron el genoma viral de muestras en el estado del maharashtra y encontraron que una combinación única de tres mutaciones que sugieran el virus SARS-CoV-2 se está desarrollando continuamente para evadir la inmunorespuesta humana.

Con continuar pandémico COVID-19 extenderse en varias partes del mundo, el coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática se está desarrollando para evadir nuestro sistema inmune. Varias nuevas variantes, señaladas las variantes de la preocupación, se han denunciado del Reino Unido, de la Suráfrica, y del Brasil a finales de 2020, que parecen ser más infecciosas que la deformación original.

La introducción de nuevas variantes y de sus consecuencias es importante en conducir la reacción de la salud pública en un país. Con el enorme pico en COVID-19 considerado en la India, especialmente en el estado del maharashtra, el gobierno aumentó la secuencia del genoma viral para determinar nuevos mutantes posibles y para entender la aptitud física de nuevas deformaciones.

Los investigadores de varios institutos indios implicados en la investigación SARS-CoV-2 obtuvieron muestras de hojas de ruta (traveler) internacionales al maharashtra. El cerca de 5% de las muestras de la vigilancia probaron el positivo y fueron ordenados, y los genomas enteros de SARS-CoV-2 eran analizados.

Las personas también analizaban la estructura cristalina de las 10 mutaciones superiores de la proteína del pico del virus complexed con el receptor humano, angiotensina-convirtiendo la enzima 2 (ACE2). También fijaron el efecto de mutaciones sobre atar a dos anticuerpos de neutralización usando las estructuras.

Tendencia de mutaciones importantes en la proteína del pico de diciembre de 2020 a marzo de 2021.
Tendencia de mutaciones importantes en la proteína del pico de diciembre de 2020 a marzo de 2021.

Determinar mutaciones

Después de analizar 598 genomas virales enteros, las personas encontraron 47 linajes de G. El más común era el B.1.617, que fue encontrado por la mitad alrededor los genomas ordenó. Dentro del clade B.1.617, encontraron cuatro atados conectados a las mutaciones específicas de la proteína del pico.

Encontraron que las mutaciones L452R y E484Q en el dominio receptor-obligatorio (RBD) de la proteína del pico y las mutaciones G142D y P681R fuera del RBD aumentaron de frecuencia a partir de enero de 2021. Otras mutaciones H1101D y T95I incluidos. Solamente una pequeña proporción de las series mostró la variante B.1.1.7, determinado en diciembre de 2020.

Un atado de mutaciones no incluyó E484Q y tenía mutaciones de T19R y de D950N en la proteína del pico. Otra mutación D111D, ocurrida junto con las mutaciones L452R y E484Q de RBD pero no fue considerada en el atado sin la mutación de E484Q. El análisis indicó un aumento en la frecuencia de las mutaciones no-sinónimas (ésas que cambian series de la proteína) desde febrero de 2021.

En maharashtra occidental, los lugares tales como Bombay, Pune, el Thane, y Nashik mostraron varios linajes aparte del B.1.617 dominante considerado en la zona oriental del estado.

Correspondencia de las mutaciones dominantes en la estructura cristalina furin-hendida de la glicoproteína del pico SARS-CoV-2 (visión superficial gris) en complejo con ACE2 (cinta sólida marrón). Región de RBD mostrada en verde
Correspondencia de las mutaciones dominantes en la estructura cristalina furin-hendida de la glicoproteína del pico SARS-CoV-2 (visión superficial gris) en complejo con ACE2 (cinta sólida marrón). Región de RBD mostrada en verde

Acciones recíprocas del cambio de las mutaciones con ACE2 y los anticuerpos

La estructura cristalina del complejo ACE2 con la proteína del pico sugiere que las mutaciones L452R y E484Q reduzcan las acciones recíprocas intermoleculares e intramoleculares comparadas al salvaje-tipo virus. La mutación de L452R quita las acciones recíprocas hidrofóbicas con otros residuos próximos. Pero, el cambio de L452 hidrofóbico a 452R hidrofílico aumenta la estabilidad del complejo, probable debido a su mayor acción recíproca con las moléculas de agua.

La mutación de E484Q rompe una ligazón electroestática en el RBD. La mutación P681R en el sitio de la hendidura del furin podría ayudar a la fusión creciente de la membrana y causar así aumentó transmisibilidad.

Las mutaciones L452R y E484Q rompen la acción recíproca de los anticuerpos de neutralización REGN10933 y P2B-2F6 con la proteína del pico, así reduciendo su efecto de la neutralización.

Los estudios anteriores han mostrado que la mutación de L452R reduce la actividad de neutralización de varios anticuerpos monoclonales, incluyendo ésos bajo juicios clínicas. Esta mutación puede también escape la inmunidad celular, contagiosidad viral cada vez mayor y quizás para aumentar la réplica viral. Así, esta combinación doble del mutante podía escape los anticuerpos monoclonales, requiriendo otros estudios.

Mutación triple

Las mutaciones en los sitios 452 y 484 se han denunciado individualmente, por ejemplo, en las variantes B.1.427 y B.1.429 de California, que tienen la mutación de L452R. E484K se ha visto en las variantes denunciadas del Reino Unido, de la Suráfrica, y del Brasil. Las mutaciones en el sitio P681 también se han considerado en algunos linajes antes así como la mutación E484Q. La combinación de todas las tres mutaciones denunciadas aquí, de L452R, E484Q, y de P681R, sugiere que el virus está desarrollando rasgos similares independientemente, continuamente adaptándose a sus ordenadores principal humanos.

El aumento exponencial en casos del maharashtra se puede conectar a esta mutación triple y a otras mutaciones del pico. Aunque el linaje B.1.617 se haya denunciado en muchos otros países, su aparición localmente necesita vigilar continuado para entender su impacto.

Los investigadores concluyen, ` que el estudio investigó las mutaciones de la proteína de S se asoció a los casos COVID19 en el maharashtra observado desde el mes de febrero de 2021. El aumento contínuo en positividad se podía atribuir a las mutaciones de la firma en la proteína del pico y las mutaciones triples de co-ocurrencia funcionalmente importantes. Según presentaciones de GISAID, el linaje B.1.617 se ha denunciado de varios países, incluyendo Reino Unido, los E.E.U.U., Suiza, Alemania, Singapur, el etc. Sin embargo, la aparición de tales variantes locales durante la onda COVID19 en la India necesita en segundo lugar ser investigada más a fondo para su impacto de la salud pública y su posibilidad de convertirse en un VOC.'

Advertencia *Important

el bioRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Lakshmi Supriya

Written by

Lakshmi Supriya

Lakshmi Supriya got her BSc in Industrial Chemistry from IIT Kharagpur (India) and a Ph.D. in Polymer Science and Engineering from Virginia Tech (USA).

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