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Onde de Hong Kong la quatrième de COVID-19 est-elle due à la variante de Q57H SARS-CoV-2 ?

Quatre ondes successives de l'infection avec le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère, qui a entraîné la pandémie actuelle de la maladie 2019 (COVID-19) de coronavirus, ont heurté Hong Kong.

Un article récent les maladies infectieuses apparaissantes de s dans centres pour le contrôle et la prévention des maladies (CDC) ' indique que le bout de ces derniers était probablement dû à l'introduction d'une variante neuve du Népal. Cette variante nouvelle avait diffusé dans la communauté pendant environ un mois avant que la dernière manifestation ait été rapportée.

SARS-CoV-2 a été recensé comme après avoir été transformé en plusieurs clades de la tension originelle de Wuhan. Dans le papier actuel, les chercheurs se sont concentrés sur la variante de GH de clade, qui a prouvé pour induire les concentrations faibles de l'inflammation et des gènes interféron-stimulés en cellules humaines de voie aérienne, dans la culture.

Les manifestations de Hong Kong

Hong Kong a eu quatre ondes de COVID-19, avec un total de 10.400 cas avant février 2021. L'onde 3 (Juin-extrémité en septembre 2020) a été tracée à une introduction unique d'une variante virale du clade Grèce, alors que l'onde 4 (novembre 2020 au présent) est provoquée par une variante de GH de clade.

Introduction et écart de la Communauté

Bien que la manifestation actuelle ait commencé en novembre 2020, les chercheurs ont eu déjà, début octobre, ont trouvé les génomes viraux presque identiques de deux boîtiers des patients de deux composés de construction dans le même district. Tous ont montré la même variante de GH de clade, à la différence des cas qui se sont produits pendant la troisième onde.    

Nos résultats indiquent que ce virus neuf introduit de GH de clade diffusait pendant le mois de la communauté locale ≈1 avant que le début de la quatrième onde épidémique dans Hong Kong. »            

Cependant, ils ont constaté que trois de quatre patients présentant l'infection importée dans un boîtier unique près des cas d'index, ainsi que deux autres patients dans un autre district, ont eu les mêmes génomes viraux. Ces patients étaient tous sous la quarantaine obligatoire et avaient obtenu sur le même vol pendant la deuxième semaine de septembre 2020, du Népal.

Les trois premiers patients ont été mis en quarantaine dans un autre hôtel près des deux constructions déjà mentionnées, alors que les deux autres patients étaient dans un hôtel dans un autre district. Un quatrième patient dans le premier hôtel a développé COVID-19 en dépit de avoir vérifié le négatif deux fois, dès l'arrivée et après 12 jours, tandis que toujours mis en quarantaine.

Ceci pourrait indiquer qu'ou ce patient a eu une période d'incubation très longue après avoir été infecté au Népal, ou qu'il était infecté sur le vol. Il a vérifié le positif seulement après qu'il a été relâché de la quarantaine. Ceci présente une route possible d'introduction de ce virus de GH de clade en la communauté locale.

Naturellement, il a pu avoir obtenu par l'intermédiaire d'un autre réseau non détecté de boîte de vitesses.  

Profil de mutation

L'analyse du génome viral prouve que ce virus a les mutations suivantes, à savoir : RdRp [L323P] affectant la polymérase ARN ARN-dépendante, la mutation de pointe de D614G, le cadre de lecture ouvert 3a ORF3a Q57H, ORF3bE14, et les mutations du nucleocapsid N S194L.

De ces derniers, la mutation de Q57H aboutit à ORF3b E14 la troncature, qui affecte ORF3b, un antagoniste important de la voie d'interféron. Ce virus de l'onde 4 était avec le virus de l'onde 3, qui a seulement D614G, et l'onde 1, qui n'a ni D614G ni Q57H.

Aucun avantage de réplication

L'étude de la réplication virale dans la culture d'organe humain et des organoids humains de voie aérienne a prouvé que le virus de l'onde 4 dans le tissu bronchique humain a eu un régime de la réplication qui était équivalente à celle du virus de l'onde 1. En tissus de poumon, cependant, elle était plus lente pour reproduire que l'autre, une fois évaluée à 48 heures, 72 heures, et 96 heures.

En revanche, le virus de l'onde 3 a reproduit légèrement plus rapidement que le virus de l'onde 1 dans la culture cellulaire humaine de bronche, mais pas dans les cultures humaines de poumon. Ainsi, le virus de l'onde 3 peut être meilleur à la réplication virale que le virus de l'onde 1.

N'induit pas l'inflammation

En ce qui concerne la nature inflammatoire du virus, le virus de l'onde 1 s'était déjà avéré par ces chercheurs incapable d'inciter les médiateurs inflammatoires puissants, comme montré par les concentrations faibles des cytokines et des chémokines inflammatoires dans les cellules humaines infectées.

La mutation de Q57H n'a pas changé cette propriété. Une fois vérifié dans les cultures organoid respiratoires humaines, l'acide ribonucléique viral (ARN) des cellules infectées avec le virus de l'onde 3 ou le virus de l'onde 4 s'est avéré encore inférieur en cellules infectées par le virus de l'onde 1, par environ un élément de log.

Quelles sont les conclusions ?

Le virus de l'onde 4 a ainsi entraîné des cytokines inférieures, chémokines et interféron-a stimulé l'expression du gène, comme le virus de l'onde 1. Cependant, le virus de l'onde 3 a entraîné à une expression du gène plus élevée que l'onde 1 virus, comme montré par la mesure du protein-10 interféron-γ-induit.

En dépit de l'omission principale d'ORF3b, nos résultats expliquent que le virus de l'onde 4 n'a pas une capacité améliorée de reproduire ex vivo et ne maintient pas la capacité immunisée innée efficace d'évasion dans des nos modèles expérimentaux. »

Le virus de l'onde 3 a quelques seules mutations, principalement dans le gène d'ORF1ab et de N. Il est en quelque sorte meilleur à la réplication qu'ondulent 1 ou ondulent 4 virus, et peuvent obtenir une réaction immunitaire innée plus robuste, selon les observations effectuées dans les modèles expérimentaux.

Cependant, les découvertes indiquent que le mutant SARS-CoV-2 responsable de la quatrième onde de COVID-19 dans Hong Kong ne reproduit pas plus rapidement que plus tôt des variantes, ni il induit des réactions inflammatoires puissantes. Le besoin de polices d'endiguement strictes demeure impératif, vu la nature fortement localisée des cas d'index.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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